Job Description P45549 Confidence 99.44% Date Thu Jan 5 12:03:06 GMT 2012 Rank 35 Aligned Residues 272 % Identity 11% Template c2d1gB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:acid phosphatase; PDBTitle: structure of francisella tularensis acid phosphatase a (acpa) bound to2 orthovanadate Resolution 1.75 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		34	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.		.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.
Predicted Secondary structure																																			.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	H	I	L	S	Q	L	P	H	L	Q	L	P	T	L	E	T	L	G	L	I	N	A	L	G	Y	A	P	G	D	M	Q	P	.	S	D	S	A	T	W	G	V	A	E	L	Q	H	E	G	G	D	T	F	M	G	H	Q	E	I	L	G	T	R	P	L	P	P	L	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																			.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																			.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	Q	V	M	G	Y	Y	D	G	N	T	V	T	A	L	W	N	Y	A	Q	N	F	A	L	N	D	N	T	F	G	T	T	F	G	P	S	T	P	G	A	L	N	L	V	A	G	A	N	G	P	A	M	S	P	S	G	N	L	E	N	I	E	N	N	Y	I	I	D	D	P	N	P	Y	Y	D	D	C	S	Y	G
Template Known Secondary structure		T	G	G	G					T	T	T	S										S				S	S				S	S	S	S												S				S				T	T		S	T	T	T			T	T				S					S	S		G	G	G	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.
												102	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	P	F	R	D	V	I	D	R	V	E	Q	A	L	V	S	A	G	W	Q	V	E	R	R	G	D	D	L	Q	F	L	W	V	N	Q	A	V	A	I	G	D	N	L	E	A	D	L	G	Q	V	Y	N	I	T	A	N	L	S	V	I	S	F	D	D	A	I	K	I	G	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	S	K	S	G	D	T	N	T	A	V	A	K	I	T	D	G	Y	N	I	G	H	Y	L	T	Q	K	G	I	T	W	G	W	F	Q	G	G	F	K	P	T	S	Y	S	G	K	T	A	I	C	D	A	M	S	T	N	K	F	G	V	K	S	R	D	Y	I	P	H	H	E	P	F	N	Y	W	K	E	T	S	N
Template Known Secondary structure		T	S	T	T	S		T	T	S							S												T								T	T		S		S				T	T											T	T	S					S			G	G	G		G	G	G	G	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	V	R	E	Q	V	Q	V	G	R	V	I	T	F	G	G	L	L	T	D	S	Q	R	I	L	D	A	A	E	S	K	E	G	R	F	I	G	I	N	A	P	R	S	G	A	Y	D	N	G	F	Q	V	V	H	M	G	Y	G	V	D	E	K	V	Q	V	P	Q	K	L	Y	E	A	G	V	P	T	V	L	V	G
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	H	H	L	A	P	S	D	D	K	Y	I	G	S	N	D	Q	A	N	H	Q	Y	D	I	S	E	F	W	K	A	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	N	N	M	P	A	V	S	Y	L	K	A	P	G	Y	Q	D	G	H	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T					S		G	G	G	T	T	S	B	S	T	T	T	T				T									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T				S								G	G	G	S			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.											.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																																															.	.	.
Query Sequence		K	V	A	D	I	V	N	N	P	Y	G	V	S	W	Q	N	L	V	D	S	Q	R	I	M	D	I	T	L	N	E	F	N	T	H	P	T	A	F	I	C	T	N	I	Q	E	T	D	L	A	G	H	A	E	D	V	A	R	Y	A	E	R	L	Q	V	V	D	R	N	L	A	R	L	V	E	A	M	Q	.	.	.
Query Conservation																																																																															.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	S	N	P	L	D	E	Q	E	W	L	V	N	T	I	N	R	I	Q	Q	S	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T																				S	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																												353	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.
				329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.													.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.		.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Predicted Secondary structure		.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Query SS confidence		.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Query Sequence		.	.	P	D	D	C	L	V	V	M	A	D	H	G	N	D	P	T	I	G	H	S	H	H	T	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	V	V	P	V	L	V	Y	Q	Q	G	M	I	.	A	T	Q	L	G	V	R	T	T	L	S	D	V	G	A	T	V	C	E	F	F	R	A	P	P
Query Conservation		.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Alig confidence		.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Template Conservation
Template Sequence		D	W	D	S	T	A	I	I	I	I	Y	D	D	S	D	G	D	Y	D	H	V	Y	S	P	K	S	Q	F	S	D	I	K	G	R	Q	G	Y	G	P	R	L	P	M	L	V	I	S	P	Y	A	K	A	N	Y	V	D	H	S	L	L	N	Q	A	S	V	L	K	F	I	E	Y	N	W	G	I	G	S
Template Known Secondary structure		T	G	G	G								S			T	T											T	T	T	T	S	T	T							B							S	T	T	B		S	S									T												T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		375	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions