Job Description P63183 Confidence 5.83% Date Thu Jan 5 12:07:53 GMT 2012 Rank 32 Aligned Residues 402 % Identity 14% Template c2xq2A_ PDB info PDB header:transport protein Chain: A: PDB Molecule:sodium/glucose cotransporter; PDBTitle: structure of the k294a mutant of vsglt Resolution 2.73 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		24	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	G	T	S	P	L	Y	T	L	R	E	C	L	S	G	Q	F	G	F	G	V	E	R	D	A	V	F	G	F	L	S	L	I	F	W	L	L	I	F	V	V	S	I	K	Y	L	T	F	V	M	R	A	D	N	A	G	E	G	G	I	L	T	L	M	S	L	A	G	R	N	T	S	A	R	T	T	S	M	L	V
Query Conservation
Alig confidence													.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	S	A	E	Q	F	I	G	M	S	G	.	S	G	Y	S	I	G	L	A	I	A	S	Y	E	W	M	S	A	I	T	L	I	I	V	G	K	Y	F	L	P	I	F	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	K	G	I	Y	T	I	P	E	F	V	E	K	R	F	N	K	K	L	K	T	I	L	A
Template Known Secondary structure		S	S										.					T		G	G	G	G																T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T			S									T
Template Predicted Secondary structure													.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		65	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.		.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.													.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.
		104	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	M	G	L	I	G	G	S	F	F	Y	G	E	V	V	I	T	P	A	I	S	V	M	S	A	I	E	G	L	E	I	V	A	P	Q	L	D	T	W	I	V	P	L	S	I	I	V	L	T	L	L	F	M	I	Q	K	H	G	T	A	M	V	G	K	L	F	A	P	I	M	L	T	W	F	L	I	L	A	G	L
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	F	W	I	S	L	Y	I	F	V	N	L	T	S	V	L	Y	L	G	G	L	A	L	E	T	I	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	L	M	Y	S	I	L	G	L	A	L	F	A	L	V	Y	S	I	Y	G	G	V	V	W	T	D	V	I	Q	V	F	F	L	V	L	G	G	F	M	T	T	Y	M
Template Known Secondary structure											T																			.	.	.	.	.	.	.	.																				T	T
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		132	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.									160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
		184	.	.	.	.	.															190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.									.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	L	R	S	I	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	P	E	V	L	H	A	L	N	P	M	W	A	V	H	F	F	L	E	Y	K	T	V	S	F	I	A	L	G	A	V	V	L	S	I	T	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	L	Y	A	D	M	G	H	F	G	K	F
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.
Template Sequence		A	V	S	F	I	G	G	T	D	G	W	F	A	G	V	S	K	M	V	D	A	A	P	G	H	F	E	M	I	L	D	Q	S	N	P	Q	Y	M	N	L	P	G	I	A	V	L	.	I	G	G	L	W	V	A	N	L	Y	Y	W	G	F	N	Q	Y	I	I	Q	R	T	L	A	A	K	S	V	S	E	A	Q	K
Template Known Secondary structure								G	G	G														G	G	G	S		S	S			S	S	S	G	G	G	G	T	S		T	T				.		S	T										T	T	T		S							T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																.
Template SS confidence
		207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.		.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	I	R	L	A	W	F	T	V	V	L	P	S	L	T	L	N	Y	F	G	Q	G	A	L	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	N	P	E	A	I	K	N	P	F	F	L	L	A	P	D	W	A	L	I	P	L	L	I	I	A	A	L	A	T	V	I	A	S	Q	A	V	I
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	I	V	F	A	A	F	L	A	L	I	V	P	F	L	V	V	L	P	G	I	A	A	Y	V	I	T	S	D	P	Q	L	M	A	S	L	G	N	L	P	S	A	A	N	A	D	K	A	Y	P	W	L	T	Q	F	L	P	V	G	V	K	G	V	V	F	A	A	L	A	A	A	I	V	S	S	L	A	S	M	L
Template Known Secondary structure										T	T	T						T											T														S	T	B	G	G	G								T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
		306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	G	V	F	S	L	T	R	Q	A	V	R	L	G	Y	L	S	P	M	R	I	I	H	T	S	E	M	E	S	G	Q	I	Y	I	P	F	V	N	W	M	L	Y	V	A	V	V	I	V	I	V	S	F	E	H	S	S	N	L	A	A	A	Y	G	I	A	V	T	G	T	M	V	L	T	S	I	L	S	T	T	V
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.						.																																		.	.
Template Conservation																				.	.	.	.						.																																		.	.
Template Sequence		N	S	T	A	T	I	F	T	M	D	I	Y	K	E	Y	I	S	P	.	.	.	.	D	S	G	D	H	.	K	L	V	N	V	G	R	T	A	A	V	V	A	L	I	I	A	A	L	I	A	P	M	L	G	G	I	G	Q	C	F	Q	Y	.	.	I	Q	E	Y	T	G	L	V	S	P	G	I	L	A	V	F	L
Template Known Secondary structure												T					T		S	.	.	.	.						.																					G	G	G	G	G	G		B						.	.						T	T	T
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.						.																																		.	.
Template SS confidence
		371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.					.	390	.	.	.		.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.			.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.
		386	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	R	Q	N	W	H	W	N	K	Y	F	V	A	L	I	L	I	A	F	L	C	V	D	I	P	L	F	T	A	N	L	D	K	L	L	S	G	G	W	L	P	L	S	L	G	T	V	M	F	I	V	M	T	T	W	K	S	E	R	F	R	L	L	R	R	M	H	E	H	G	N	S
Query Conservation
Alig confidence																															.	.	.
Template Conservation																															.	.	.
Template Sequence		L	G	L	F	W	K	K	T	T	S	K	G	A	I	I	G	V	V	A	S	I	P	F	A	L	F	L	K	F	.	.	.	M	P	L	S	M	P	F	M	D	Q	M	L	Y	T	L	L	F	T	M	V	V	I	A	F	T	S	L	S	T	S	I	N	D	D	D	P	K	G	I	S
Template Known Secondary structure							T	T																							.	.	.	S	S																													S	S	S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.
Template SS confidence
		444	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.				.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.