Job Description P00962 Confidence 99.92% Date Thu Jan 5 10:57:24 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 279 % Identity 14% Template d2d5ba2 SCOP info Adenine nucleotide alpha hydrolase-like Nucleotidylyl transferase Class I aminoacyl-tRNA synthetases (RS), catalytic domain Resolution 1.80

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		28	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.			.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	H	T	R	F	P	P	E	P	N	G	Y	L	H	I	G	H	A	K	S	I	C	L	N	F	G	I	A	Q	D	.	.	Y	K	G	Q	C	N	L	R	F	D	D	T	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	V	K	E	D	I	E	Y	V	E	S	I	K	N	D	V	E	W	L
Query Conservation																																.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	V	T	T	P	I	Y	Y	V	N	A	E	P	H	L	G	H	A	Y	T	T	V	V	A	D	F	L	A	R	W	H	R	L	D	G	Y	R	T	F	F	L	T	G	T	D	E	H	G	E	T	V	Y	R	A	A	Q	A	A	G	E	D	P	K	A	F	V	D	R	V	S	G	R	F	K	R	A	W	D	L	L
Template Known Secondary structure										T	T	S																							T	T													S											T	S																				T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.			.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150																.	.
Predicted Secondary structure															.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	F	H	W	S	G	N	V	R	Y	S	S	D	.	.	Y	F	D	Q	L	H	A	Y	A	I	E	L	I	N	K	G	L	A	Y	V	D	E	L	T	P	E	Q	I	R	E	Y	R	G	T	L	T	Q	P	G	K	N	S	P	Y	R	D	R	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E
Query Conservation															.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.								.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.
Template Sequence		G	I	A	Y	D	.	D	F	I	R	T	T	E	E	R	H	K	K	V	V	Q	L	V	L	K	K	V	Y	E	A	G	D	I	Y	Y	G	E	Y	E	G	L	Y	C	V	S	C	E	R	F	Y	T	E	K	E	L	V	E	G	L	C	P	I	H	G	R	P	V	E	R	R	K	E	G	N	Y	F	F	R	M	E
Template Known Secondary structure		T				S	.					T	T	S																	T	T													T	T	T	T					T	T	T	S	B	T	T	B		T	T	T		S	B													G	G
Template Predicted Secondary structure							.
Template SS confidence
		86	.	.	.	90		.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
		153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	N	L	A	L	F	E	K	M	R	A	G	G	F	E	E	G	K	A	C	L	R	A	K	I	D	M	A	S	P	F	I	V	M	R	D	P	V	L	Y	R	I	K	F	A	E	H	H	Q	T	G	N	K	W	C	I	Y	P	M	Y	D	F	T	H	C	I	S	D	A	L	E	G	I	T	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																												.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	Y	R	P	W	L	Q	E	Y	I	Q	E	N	P	D	L	I	R	P	E	G	Y	R	N	E	V	L	A	M	L	A	E	P	I	G	D	L	S	I	S	R	P	K	S	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	W	G	I	P	L	P	W	D	E	N	H	V	T	F	V	W	F	D	A	L	L
Template Known Secondary structure		G	G										T		T	T	S			S												T	S											T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S				T	T														T
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.													210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
																							227	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.		.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260		.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																			.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																			.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	S	L	C	T	L	E	F	Q	D	N	R	R	L	Y	D	.	W	V	L	D	N	I	T	I	P	V	H	P	R	Q	Y	E	F	S	.	R	L	N	L	E	Y	T	V	M	S	K	R	K	L	N	L	L	V	T	D	K	H	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																			.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																			.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	Y	V	S	A	L	D	Y	P	E	G	E	A	Y	R	T	F	W	P	H	A	W	H	L	I	G	K	D	I	L	K	P	H	A	V	F	W	P	T	M	L	K	A	A	G	I	P	M	Y	R	H	L	N	V	G	G	F	L	L	G	P	D	G	R	K	M	S	K	T	L	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						T	T	T	T	T	T								G	G	G							G	G	G						T										T					S											T	T	S	S				T	T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	G	W	D	D	P	R	M	P	T	I	S	G	L	R	R	R	G	Y	T	A	A	S	I	R	E	F	C	K	R	I	G	V	T	K	Q	D	N	T	I	E	M	A	S	L	E	S	C	I	R	E	D	L	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.											.																														.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.											.																														.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	V	V	D	P	F	A	L	L	E	K	.	Y	G	R	D	A	L	R	Y	Y	L	L	R	E	I	P	Y	G	Q	D	T	P	V	S	E	E	A	L	R	T	.	.	R	Y	E	A	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.											.														S		T	T	S												.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.											.																														.	.
Template SS confidence
									305	.	.	.	.	310	.	.	.	.		.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.			.	.	.	.	.

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions