Job Description P00962 Confidence 99.38% Date Thu Jan 5 10:57:24 GMT 2012 Rank 32 Aligned Residues 273 % Identity 17% Template d1ilea3 SCOP info Adenine nucleotide alpha hydrolase-like Nucleotidylyl transferase Class I aminoacyl-tRNA synthetases (RS), catalytic domain Resolution 2.50

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		33	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.			.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70																																		.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	P	E	P	N	G	Y	L	H	I	G	H	A	K	S	I	C	L	N	F	G	I	A	Q	.	.	D	Y	K	G	Q	C	N	L	R	F	D	D	T	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	V	K	E	D	I	E
Query Conservation																										.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	P	T	A	N	G	L	P	H	V	G	H	A	Q	A	R	S	Y	K	D	L	F	P	R	Y	K	T	M	R	G	Y	Y	A	P	R	R	A	G	W	D	T	H	G	L	P	V	E	L	E	V	E	K	K	L	G	L	K	S	K	R	E	I	E	A	Y	G	I	E	R	F	N	Q	A	C	R	E	S	V	F	T
Template Known Secondary structure					T	T	S				T	T																		T	T		B																						T	T			S																				T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		46	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.				.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	V	E	S	I	K	N	D	V	E	W	L	G	F	H	W	S	G	N	V	R	Y	S	S	.	.	.	D	Y	F	D	Q	L	H	A	Y	A	I	E	L	I	N	K	G	L	A	Y	V	D	E	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																										.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	E	K	E	W	E	A	F	T	E	R	I	A	Y	W	V	D	L	E	D	A	Y	A	T	L	E	P	T	Y	I	E	S	I	W	W	S	L	K	N	L	F	D	R	G	L	L	Y	R	D	H	K	V	V	P	Y	C	P	R	C	G	T	P	L	S	S	H	E	V	A	L	G	Y	P	H	C	W	R	C	S	T
Template Known Secondary structure		T					T	T					T	T											T	T	S																	T	T													T	T	T	T											T			B		S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		126	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
																			127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	E	Q	I	R	E	Y	R	G	T	L	T	Q	P	G	K	N	S	P	Y	R	D	R	S	V	E	E	N	L	A	L	F	E	K	M	R	A	G	G	F	E	E	G	K	A	C	L	R	A	K	I	D	M	A	S	P	F	I	V	M	R	D	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	L	M	Y	Y	A	T	E	S	W	F	I	K	N	T	L	F	K	D	E	L	I	R	N	N	Q	E	.	.	I	H	W	V	P	P	H	I	K	E	G	R	Y	G	E	W	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	V	D	W	A	L	S	R	N	R	Y	W	G	T	P	L	P	I	W	V	C	Q
Template Known Secondary structure		B													G	G	G	G											.	.	S			S	S	G	G	G	T	T	T	T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T								B			S	S	S		B							S
Template Predicted Secondary structure																													.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		395	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.			.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.											440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.
																																			190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	L	Y	R	I	K	F	A	E	H	H	Q	T	G	N	K	W	C	I	Y	P	M	Y	D	F	T	H	C	I	S	D	A	L	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	C	G	K	E	E	A	I	G	S	F	Q	E	L	K	A	R	A	T	K	P	L	P	E	P	F	D	P	H	R	P	Y	V	D	Q	V	E	L	A	C	A	C	G	G	T	M	R	R	V	P	Y	V	I	D	V	W	Y	D	S	G	A	M	P	F	A	S	L	H	Y	P	F	E	H	E	E	V	F	R	E	S
Template Known Secondary structure		S	S	S							S								B	S	S				S	S				S					T	T						T	T	S	S						S		B														T	T	T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		463	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.
				225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.		.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.			.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.												.																				.	.
Query SS confidence		.	.												.																				.	.
Query Sequence		.	.	I	T	H	S	L	C	T	L	E	F	Q	.	D	N	R	R	L	Y	D	W	V	L	D	N	I	T	I	P	V	H	P	.	.	R	Q	Y	E	F	S	R	L	N	L	E	Y	T	V	M	S	K	R	K	L	N	L	L	V	T	D	K	H	V	E	G	W	D	D	P	R	M	P	T	I	S	G	L	R	R
Query Conservation		.	.												.																				.	.
Alig confidence		.	.												.																				.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	P	A	D	F	I	A	E	G	I	D	Q	T	R	G	W	F	N	S	L	H	Q	L	G	V	M	L	F	G	S	I	A	F	K	N	V	I	C	H	G	L	I	L	D	E	K	G	Q	K	M	S	K	S	K	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	V	D	P	W	D	I	I	R
Template Known Secondary structure		S	S	B	S	B					G	G	G	G	G	T														S	S		S	B	S											T	T	S	S				T	T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		543	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.																.	600	.	.	.	.	.	.	.
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	G	Y	T	A	A	S	I	R	E	F	C	K	R	I	G	V	T	K	Q	D	N	T	I	E	M	A	S	L	E	S	C	I	R
Query Conservation
Alig confidence			.
Template Conservation			.
Template Sequence		K	.	F	G	A	D	A	L	R	W	Y	I	Y	V	S	A	P	P	E	A	D	R	R	F	G	P	N	L	V	R	E	T	V	R
Template Known Secondary structure		T	.	T													S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure			.
Template SS confidence
		608		.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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