Job Description P77495 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:29:54 GMT 2012 Rank 28 Aligned Residues 385 % Identity 19% Template c3e53A_ PDB info PDB header:ligase Chain: A: PDB Molecule:fatty-acid-coa ligase fadd28; PDBTitle: crystal structure of n-terminal domain of a fatty acyl amp2 ligase faal28 from mycobacterium tuberculosis Resolution 2.35 Å

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		53	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.				80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.
Query Sequence		L	C	H	N	A	I	D	R	W	L	E	K	Q	P	E	A	L	A	L	I	A	V	S	S	E	T	E	.	.	.	E	E	R	T	F	T	F	R	Q	L	H	D	E	V	N	A	V	A	S	M	L	R	S	L	G	V	Q	R	G	D	R	V	L	V	Y	M	P	M	I	A	E	A	H	I	T	L	L	A	C	A
Query Conservation																													.	.	.
Alig confidence																													.	.	.																										.
Template Conservation																																																									.
Template Sequence		S	L	P	A	A	L	R	A	C	A	R	L	Q	P	H	D	P	A	F	T	F	X	D	Y	E	Q	D	W	D	G	V	A	I	T	L	T	W	S	Q	L	Y	R	R	T	L	N	V	A	Q	E	L	S	R	C	G	.	S	T	G	D	R	V	V	I	S	A	P	Q	G	L	E	Y	V	V	A	F	L	G	A	L
Template Known Secondary structure														S	T	T	S									S	S		S	S																							T	T	S	S	.		T	T									S	S
Template Predicted Secondary structure																																																									.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.		60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
		130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	I	G	A	I	H	S	V	V	F	G	G	F	A	S	H	S	V	A	A	R	I	D	D	A	K	P	V	L	I	V	S	A	D	A	G	A	R	G	G	K	I	I	P	Y	K	K	L	L	D	D	A	I	S	Q	A	Q	H	Q	P	R	H	V	L	L	V	D	R	G	L	A	K	M	A	R	V	S	G	R	D
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	A	G	R	I	A	V	P	L	S	V	P	Q	R	.	.	.	S	D	S	V	L	S	D	S	S	P	V	A	I	L	T	T	S	S	A	V	D	D	V	V	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T												.	.	.	T	T									S						T	T	T						T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.				.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.				.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.	.	.
Query SS confidence																																																																.	.	.
Query Sequence		V	D	F	A	S	L	R	H	Q	H	I	G	A	R	V	P	V	A	W	L	E	S	N	E	T	S	C	I	L	Y	T	S	G	T	T	G	K	P	K	G	V	Q	R	D	V	G	G	Y	A	V	A	L	A	T	S	M	D	T	I	F	G	G	.	.	.	K	A	G	S	V	F	F	C	A	S	D	I	G	W	V
Query Conservation																																																																.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	V	P	P	S	I	I	E	V	D	L	L	D	L	D	A	P	E	Y	P	S	T	A	Y	L	Q	Y	T	P	A	G	V	V	X	S	H	Q	N	V	R	V	N	F	E	Q	L	X	S	G	Y	F	A	D	G	I	P	P	P	N	S	A	L	V	S	W	L	P	F	Y	H	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	T								G	G	G	S		T	T						S																																					T	T									T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.		.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.
Query SS confidence																																																																.
Query Sequence		V	G	H	S	Y	I	V	Y	A	P	L	L	A	G	M	A	T	I	V	Y	E	G	L	P	T	W	P	D	C	G	V	W	W	T	I	V	E	K	Y	Q	V	S	R	M	F	S	A	P	T	A	I	R	V	L	K	K	F	P	T	A	E	I	.	R	K	H	D	L	S	S	L	E	V	L	Y	L	A	G	E	P
Query Conservation																																																																.
Alig confidence																																																																.
Template Conservation
Template Sequence		X	G	L	V	I	G	I	C	A	P	I	L	G	G	Y	P	A	V	L	T	S	P	V	S	F	L	Q	R	P	A	R	W	X	H	L	X	A	S	D	F	H	A	F	S	A	A	P	N	F	A	F	E	L	A	A	R	R	T	T	D	D	D	X	A	G	R	D	L	G	N	I	L	T	I	L	S	G	S	E	R
Template Known Secondary structure								T							T															T								S	S	S	S																				T	T	T	T	T	T				T	T								S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
		366	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.							.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	D	E	P	T	A	S	W	V	S	N	T	.	.	.	.	.	.	L	D	V	P	V	I	D	N	Y	W	Q	T	E	S	G	W	P	I	M	A	I	A	R	G	L	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	P	T	R	L	G	S	P	G	V	P	M	Y	G	Y	N	V
Query Conservation														.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	Q	A	A	T	I	K	R	F	A	D	R	F	A	R	F	N	L	Q	E	R	V	I	R	P	S	Y	G	L	A	E	A	T	V	Y	V	A	T	S	K	P	G	Q	P	P	E	T	V	D	F	D	T	E	S	L	S	A	G	H	A	K	P	C	A	G	A	T	S	L	I	S	Y	X	L	P	R	S	P	I	V
Template Known Secondary structure																T	T	T			G	G	G								G	G	G	S	S							T	T	S														T	T	B																	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
		422	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.									.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	L	L	N	E	V	T	G	E	P	C	G	V	N	E	K	G	M	L	V	V	E	G	P	L	P	P	G	C	I	Q	T	I	W	G	D	D	G	R	F	V	K	T	Y	W	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	F	S	R	P	V	Y	A	T	F	D	W	G	I	R	D	A	D	G	Y	H	F	I	L	G
Query Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Conservation																											.	.	.																																											.
Template Sequence		R	I	V	D	S	D	T	C	I	E	C	P	D	G	T	V	G	E	I	W	V	H	G	D	N	.	.	.	V	A	N	G	Y	W	Q	K	P	D	E	S	E	R	T	F	G	G	K	I	V	T	P	S	P	G	T	P	E	G	P	W	L	R	T	G	D	S	G	F	V	T	.	D	G	K	X	F	I	I	G
Template Known Secondary structure						T	T	T	T					T	T	B								S	T	T	.	.	.	S				B	T	T											B			B	S			T	T						B											.	T	T
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.																																											.
Template SS confidence
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.				410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.		.	.	.	.	.	.	.	.