Job Description P0AGF4 Confidence 99.95% Date Thu Jan 5 11:28:58 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 408 % Identity 12% Template d1pw4a_ SCOP info MFS general substrate transporter MFS general substrate transporter Glycerol-3-phosphate transporter Resolution 3.30

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		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	S	Y	I	F	S	I	T	L	V	A	T	L	G	G	L	L	F	G	Y	D	T	A	V	I	S	G	T	V	E	S	L	N	T	V	F	V	A	P	Q	N	L	S	E	S	A	A	N	S	L	L	G	F	C	V	A	S	A	L	I	G	C	I	I	G	G	A	L	G	G	Y	C	S	N	R	F	G	R	R	D
Query Conservation
Alig confidence																																			.				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	R	L	R	W	Q	I	F	L	G	I	F	F	G	Y	A	A	Y	Y	L	V	R	K	N	F	A	L	A	M	P	Y	L	V	.	E	Q	G	.	.	.	.	.	.	.	.	F	S	R	G	D	L	G	F	A	L	S	G	I	S	I	A	Y	G	F	S	K	F	I	M	G	S	V	S	D	R	S	N	P	R	V
Template Known Secondary structure																								T	S								T	T	.	S	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	T		S	S																											S
Template Predicted Secondary structure																																			.				.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		24	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.		.	.	.									60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.					.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.
Query Sequence		S	L	K	I	A	A	V	L	F	F	I	S	G	V	G	S	.	.	.	.	A	W	P	E	L	G	F	T	S	I	N	P	D	N	T	V	P	V	Y	L	A	G	Y	V	P	E	F	V	I	Y	R	I	I	G	G	I	G	V	G	L	A	S	M	L	S	P	M	Y	I	A	E	L	A	P	A	H	I	R	G	K
Query Conservation																		.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	L	P	A	G	L	I	L	A	A	A	V	M	L	F	M	G	F	V	P	W	A	T	S	S	I	A	V	M	F	V	L	L	F	L	C	G	W	F	Q	G	M	G	W	P	P	C	G	R	T	M	V	H	W	W	S	Q	K	E	R	G	G	I	V	S	V	W	N	C	A	H	N	V	G	G	G	I	P	P	L
Template Known Secondary structure																									S	S	S	S																T										T	T		T	T	T																		T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		95	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	V	S	F	N	Q	F	A	I	I	F	G	Q	L	L	V	Y	C	V	N	Y	F	I	A	R	S	G	D	A	S	W	L	N	T	D	G	W	R	Y	M	F	A	S	E	C	I	P	A	L	L	F	L	M	L	L	Y	T	V	P	E	S	P	R	W	L	M	S	R	G	K	Q	E	Q	A	E	G	I	L	R	K
Query Conservation
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	F	L	L	G	M	A	W	F	N	D	W	H	A	A	L	Y	M	P	A	F	C	A	I	L	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	F	A	F	A
Template Known Secondary structure										T			S	T	T		T											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200																																																	.	.	.	.	.	.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	M	G	N	T	L	A	T	Q	A	V	Q	E	I	K	H	S	L	D	H	G	R	K	T	G	G	R	L	L	M	F	G	V	G	V	I	V	I	G	V	M	L	S	I	F	Q	Q	F	V	G	I	N	V	V	L	Y	Y	A	P	E	V	F	K	T	L	G	A	S	T	D	I	A	L	L	Q	T	I	I	V	G
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		M	M	R	D	T	P	Q	S	C	G	L	P	P	I	E	E	Y	K	N	D	T	A	K	Q	I	F	M	Q	Y	V	L	P	N	K	L	L	W	Y	I	A	I	A	N	V	F	V	Y	L	L	R	Y	G	I	L	D	W	S	P	T	Y	L	K	E	V	K	H	F	A	L	D	K	S	S	W	A	Y	F	L	Y	E
Template Known Secondary structure						S	S	T	T	T				S		T	T	T						T							T	S	S																													B	T	T	B	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	I	N	L	T	F	T	V	L	A	I	M	T	V	D	K	F	G	R	K	P	L	Q	I	I	G	A	L	G	M	A	I	G	M	F	S	L	G	T	A	F	Y	T	Q	A	P	G	I	V	A	L	L	S	M	L	F	Y	V	A	A	F	A	M	S	W	G	P	V	C	W	V	L	L	S	E	I	F	P	N	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Y	A	G	I	P	G	T	L	L	C	G	W	M	S	D	K	V	F	R	G	N	R	G	A	T	G	V	F	F	M	T	L	V	T	I	A	T	I	V	Y	W	M	N	P	A	G	N	P	T	V	D	M	I	C	M	I	V	I	G	F	L	I	Y	G	P	V	M	L	I	G	L	H	A	L	E	L	A	P	K	K
Template Known Secondary structure																		T	S	T	T																				T	T	S			T	T																	T													T	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.		.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.
Query SS confidence																	.
Query Sequence		I	R	G	K	A	L	A	I	A	V	A	A	Q	W	L	.	A	N	Y	F	V	S	W	T	F	P	M	M	D	K	N	S	W	L	V	A	H	F	H	N	G	F	S	Y	W	I	Y	G	C	M	G	V	L	A	A	L	F	M	W	K	F	V	P	E	T	K	G	K	T	L	E	E	L	E	A	L
Query Conservation																	.
Alig confidence																	.																.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	A	G	T	A	A	G	F	T	G	L	F	G	Y	L	G	G	S	V	A	A	S	A	I	V	G	Y	T	V	D	F	.	.	.	.	.	.	F	G	W	D	G	G	F	M	V	M	I	G	G	S	I	L	A	V	I	L	L	I	V	V	M	I	G	E	K	R	R	H	E	Q	L	L	Q	E	L
Template Known Secondary structure																																S	.	.	.	.	.	.	S		S																															G	G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410							.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.