Job Description P46891 Confidence 98.77% Date Thu Jan 5 12:04:39 GMT 2012 Rank 77 Aligned Residues 154 % Identity 22% Template c3iruA_ PDB info PDB header:structural genomics, unknown function Chain: A: PDB Molecule:phoshonoacetaldehyde hydrolase like protein; PDBTitle: crystal structure of phoshonoacetaldehyde hydrolase like protein from2 oleispira antarctica Resolution 2.30 Å

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Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	R	L	A	A	F	D	M	D	G	T	L	L	M	P	D	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	E	A	L	I	L	D	W	A	G	T	T	I	D	F	G	S	L	A	P	V	Y	A	F	X	E	L	F	K	Q	E	G	I	E	V	T	Q	A	E	A	R	E	P	X	G	T	E	K	S	E	H	I	R	R	X	L	G	N	S	R	I	A	N	A	W	L	S	I	K	G	Q	A	S	N	E	E	D	I	K	R
Template Known Secondary structure									S	B	T	T	T	B	S	T	T														T	T	T										T	T	T	T	S										T	T	S												S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
																			19	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.			.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	L	G	E	K	T	L	S	T	L	A	R	L	R	E	R	D	I	T	L	T	F	A	T	G	R	H	A	L	E	M	Q	H	I	L	G	A	L	S	L	D	A	Y	L	.	.	I	T	G	N	G	T	R	V	H	S	L	E	G	E	L	L	H
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	Y	D	L	F	A	P	I	Q	T	R	I	V	A	Q	R	S	Q	L	I	P	G	W	K	E	V	F	D	K	L	I	A	Q	G	I	K	V	G	G	N	T	G	Y	G	P	G	X	X	A	P	A	L	I	A	A	K	E	Q	G	Y	T	P	A	S	T	V	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																	T			B		T	T											T	T								S	S															T	T				S					G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	D	D	L	P	A	D	V	A	E	L	V	L	Y	Q	Q	W	D	T	R	A	S	M	H	I	F	N	D	D	G	W	F	T	G	K	E	I	P	A	L	L	Q	A	F	V	Y	S	G	F	R	Y	Q	I	I	D	V	K	K	M	P	L	G	S	V	T	K	I	C	F	C	G	D	H	D	D	L	T	R	L	Q
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.		.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.		.	.	.	230	.	.
Predicted Secondary structure																																													.																									.							.	.	.	.	.
Query SS confidence																																													.																									.							.	.	.	.	.
Query Sequence		I	Q	L	Y	E	A	L	G	E	R	A	H	L	C	F	S	A	T	D	C	L	E	V	L	P	V	G	C	N	K	G	A	A	L	T	V	L	T	Q	H	L	G	L	.	S	L	R	D	C	M	A	F	G	D	A	M	N	D	R	E	M	L	V	S	V	G	S	G	.	F	I	M	G	N	A	.	.	.	.	.
Query Conservation																																													.																									.							.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.																									.							.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	V	V	R	G	R	P	F	P	D	X	A	L	K	V	A	L	E	L	E	V	G	H	V	N	G	C	I	K	V	D	D	T	L	P	G	I	E	E	G	L	R	A	G	X	W	T	V	G	V	S	C	S	G	N	E	V	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S	S	S		T	T	S	S											T		S		G	G	G						S	S										T	T								S	S	S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																							160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
																							233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	P	Q	L	R	A	E	L	P	H	L	P	V	I	G	H	C	R	N	Q	A	V	S	H	Y	L	T	H	W	L	D	Y	P	H	L	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	D	R	E	D	W	Q	A	L	S	S	D	E	Q	Q	S	Y	R	Q	H	A	E	Q	R	L	F	N	A	G	A	H	Y	V	I	D	S	V	A	D	L	E	T	V	I	T	D	V	N	R	R	L	A	R	G	E	K	P
Template Known Secondary structure										S																				T		S				S	S	G	G	G	T													T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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