Job Description P0A821 Confidence 99.84% Date Thu Jan 5 11:06:39 GMT 2012 Rank 157 Aligned Residues 353 % Identity 13% Template c2eo5A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:419aa long hypothetical aminotransferase; PDBTitle: crystal structure of 4-aminobutyrate aminotransferase from sulfolobus2 tokodaii strain7 Resolution 1.90 Å

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		39	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.		.	.	.	.	.	.	100					.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.								.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.								.	.	.	.
Query Sequence		L	L	R	Q	M	L	D	E	A	R	E	V	I	R	G	S	Q	T	L	P	A	W	C	E	N	W	A	Q	E	V	D	A	R	L	T	K	E	A	Q	S	A	L	R	P	V	I	N	L	T	G	T	V	L	H	T	.	N	L	G	R	A	L	Q	.	.	.	.	A	E	A	A	V	E	A	V	A	Q	A	M	R
Query Conservation																																																									.								.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.																										.								.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	S	R	K	I	I	E	E	S	D	I	Y	L	A	T	S	T	R	D	P	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	F	P	L	V	I	D	H	G	E	G	V	W	I	Y	D	V	D	G	N	K	Y	L	D	F	T	S	G	I	G	V	N	N	L	G	W	P	S	H	P	E	V	I	K	I	G	I	E	Q	M	Q
Template Known Secondary structure														S						S	S			.	.	.	.	.	.	.	.										B	T					T	T	S						S	S	G	G	G	G	T	T	T	T		B	S														T
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.									.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.
		114	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.				.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.			.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.																							.	.
Query SS confidence																																.	.	.																							.	.
Query Sequence		S	P	V	T	L	E	Y	D	L	D	D	A	G	R	G	H	R	D	R	A	L	A	Q	L	L	C	R	I	T	G	.	.	.	A	E	D	A	C	I	V	N	N	N	A	A	A	V	L	L	M	L	A	A	T	A	.	.	S	G	K	E	V	V	V	S	R	G	E	L	V	E	I	G	G	A	F	R	I	P	D
Query Conservation																																.	.	.																							.	.
Alig confidence		.	.	.																												.	.	.																							.	.																.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																																																																						.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	K	L	A	H	A	A	A	N	D	F	Y	N	I	P	Q	L	E	L	A	K	K	L	V	T	Y	S	P	G	N	F	Q	K	K	V	F	F	S	N	S	G	T	E	A	I	E	A	S	I	K	V	V	K	N	T	G	R	K	Y	I	I	A	F	L	G	G	F	H	G	R	.	.	.	.	.	T	F	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	T	S				S		S		S																S	S		S	S								S	S														T	T	S								T	T					S	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																																																																						.	.	.	.	.
Template SS confidence
					74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.						.	.	.
		189	190	.	.	.	.	.														.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	210	.	.	.	.	.	.							.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	M	R	Q	A	G	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	H	E	V	G	T	T	N	R	T	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	D	Y	R	Q	A	V	N	.	.	.	.	.	.	E	N	T	A	L	L	M	K	V	H	T	S	N	Y	S
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	I	S	L	T	A	S	K	A	V	Q	R	S	I	V	G	P	F	M	P	G	V	I	H	V	P	Y	P	N	P	Y	R	N	P	W	H	I	N	G	Y	E	N	P	S	E	L	V	N	R	V	I	E	F	I	E	D	Y	I	F	V	N	L	V	P	P	E	E	V	A	G	I	F	F	E	P	I	Q	G	E	G
Template Known Secondary structure								S		G	G	G	G		S	S					T	T									S	S	S		T	T				T	T	T																T					T			G	G	G								S	S	B	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.		.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
Predicted Secondary structure																																.
Query SS confidence																																.
Query Sequence		I	Q	G	F	T	K	A	I	D	E	A	E	L	V	A	L	G	K	E	L	D	V	P	V	V	T	D	L	G	S	.	G	S	L	V	D	L	S	Q	Y	G	L	P	K	E	P	M	P	Q	E	L	I	A	A	G	V	S	L	V	S	F	S	G	D	K	L	L	G	G	P	Q	A	G	I	I	V	G	K	K	E
Query Conservation																																.
Alig confidence																																.										.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	Y	V	I	P	P	K	N	F	F	A	E	L	Q	K	L	A	K	K	Y	G	I	L	L	V	D	D	E	V	Q	M	G	L	G	R	T	G	K	L	F	.	.	.	.	.	.	.	A	I	E	N	F	N	T	V	P	D	V	I	T	L	A	K	A	L	G	G	G	I	M	P	I	G	A	T	I	F	R	K	D
Template Known Secondary structure		T	S	B				T	T													T								T	T	T	T	T	T	T	T	S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	G	G	T				S						G	G	G	G	T	T	T	S									G	G
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.								.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	I	A	R	L	Q	S	H	P	L	K	R	A	L	R	A	D	K	M	T	L	A	A	L	E	A	T	L	R	L	Y	L	H	P	E	A	L	S	E	K	L	P	T	L	R	L	L	T	R	S	A	E	V	I	Q	I	Q	A	Q	R	L	Q	A	P	L	A	A	H	Y	G	A	E	F	A	V	Q	V	M	P	C
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	K	T	F	G	G	N	A	L	A	C	A	I	G	S	K	V	I	D	I	V	K	D	L	L	P	H	V	N	E	I	G	K	I	F	A	E	E	L	Q	G	L	A	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									T	T	S	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		299																									300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	S	Q	I	G	S	G	S	L	P	V	D	R	L	P	S	A	A	L	T	F	T	P	H	D	G	R	G	S	H	L	E	S	L	A	A	R	W	R	E	L	P	V	P	V	I	G	R	I	Y	D	G	R	L	W	L	D	L	R	C	L	E	D	E	Q	R	F	L	E	M	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	R	G	I	G	L	A	W	G	L	E	Y	N	E	K	K	V	R	D	R	I	I	G	E	S	F	K	R	G	L	.	L	L	L	P	A	G	R	S	A	I	R	V	I	P	P	L	V	I	S	E	E	E	A	K	Q	G	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T							S															T	T		.						T	T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Template SS confidence
															352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.		.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.