Job Description P77690 Confidence 99.74% Date Thu Jan 5 12:31:41 GMT 2012 Rank 234 Aligned Residues 322 % Identity 13% Template d1ohwa_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 2.30

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		2	.	.	.	.	.					.	.	10	.	.	.				.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.										.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.			.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.							.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Query SS confidence								.	.	.	.							.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Query Sequence		S	E	F	L	P	F	.	.	.	.	S	R	P	A	M	G	.	.	.	V	E	E	L	A	A	V	K	E	V	L	E	S	G	W	I	T	T	G	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	N	Q	A	L	E	Q	A	F	C	Q	L	T	.	.	G	N	Q	H	A	I	A	V	S	S	A	T	A	G	M	H	I
Query Conservation								.	.	.	.							.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Alig confidence								.	.	.	.							.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	R	M	L	D	L	Y	S	Q	I	S	S	I	P	I	G	Y	S	H	P	A	L	V	K	L	V	Q	Q	P	Q	N	V	S	T	F	I	N	R	P	A	L	G	I	L	P	P	E	N	F	V	E	K	L	R	E	S	L	L	S	V	A	P	K	G	M	S	Q	L	I	T	M	A	C	G	S	C	S	N	E	N
Template Known Secondary structure							S	S					T		S	S		B	T											G	G	G										T	T	T	S			T	T								T	G	G	G	G			T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		63	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.
		64	.	.	.	.	.																													70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	L	M	A	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G	K	G	D	E	V	I	T	P	S	L	T	W	V	S	T	L	N	M	I	S	L	L	G	A	T	P	V	M	V	D	V	D	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	F	K	T	I	F	M	W	Y	R	S	K	E	R	G	Q	S	A	F	S	K	E	E	L	E	T	C	M	I	N	Q	A	P	G	C	P	D	Y	S	I	L	S	F	M	G	A	F	H	G	R	T	M	G	C	L	A	T	T	H	S	K	A	I	H	K	I	D	I	P	S	F	D	W	P	I	A	P	F	P	R
Template Known Secondary structure																T	T													T	T		T	T	T	S									T	T					S	S						T			S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		143	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
																						105	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.			.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.					.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.																.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.																.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	T	L	M	V	T	P	E	A	I	E	S	A	I	T	P	R	.	.	T	K	A	I	I	P	V	H	Y	A	G	A	P	A	D	.	.	.	.	I	D	A	I	R	A	I	G	E	R	Y	G	I	A	V	I	E	D	A	A	H	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.																.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.																.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	K	Y	P	L	E	E	F	V	K	E	N	Q	Q	E	E	A	R	C	L	E	E	V	E	D	L	I	V	K	Y	R	K	K	K	K	T	V	A	G	I	I	V	E	P	I	Q	S	E	G	G	D	N	H	A	S	D	D	F	F	R	K	L	R	D	I	S	R	K	H	G	C	A	F	L	V	D	E	V	Q	T
Template Known Secondary structure				S	S	G	G	G																										T	T										S	S	B		T	T	T		B																	T	T								T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
			159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.			.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																.	.
Query SS confidence		.																.	.
Query Sequence		.	V	G	T	Y	Y	K	G	R	H	I	G	A	K	G	T	.	.	A	I	F	S	F	H	A	I	K	N	I	T	C	A	E	G	G	L	I	V	T	D	N	E	N	L	A	R	Q	L	R	M	L	K	F	H	G	L	G	V	D	A	Y	D	R	Q	T	W	G	R	A	P	Q	A	E	V	L	T	P	G	Y	K
Query Conservation		.																.	.
Alig confidence		.																.	.													.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	G	G	S	T	G	K	F	W	A	H	E	H	W	G	L	D	D	P	A	D	V	M	T	F	S	K	K	M	M	.	.	.	T	G	G	F	F	H	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	F	R	P	N	A	P	Y	R	I	F	N	T	W	L
Template Known Secondary structure			S	S	T	T	S	S	S	S	G	G	G	G	G			S	S			S						G	G	G	S	.	.	.	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	S		S	S	T	T	S	S			S		S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.				.	.	.	.	.	.	.																									340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	N	L	T	D	I	N	A	A	I	A	L	T	Q	L	V	K	L	E	H	L	N	T	R	R	R	E	I	A	Q	Q	Y	Q	Q	A	L	A	A	L	P	F	Q	P	L	S	L	P	A	W	P	H	V	H	A	W	H	L	F	I	I	R	V	D	E	Q	R	C	G	I	S	R	D	A	L	M	E	A	L	K	E
Query Conservation
Alig confidence																																									.																												.	.	.
Template Conservation																																									.																												.	.	.
Template Sequence		G	D	P	S	K	N	L	L	L	A	E	V	I	N	I	I	K	R	E	D	L	L	S	N	A	A	H	A	G	K	V	L	L	T	G	L	L	D	L	.	Q	A	R	Y	P	Q	F	I	S	R	V	R	G	R	G	T	F	C	S	F	D	T	P	D	E	S	I	.	.	.	R	N	K	L	I	S	I	A	R	N
Template Known Secondary structure		S																		T	T																				.					T	T	T								T	T							S	S				.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																									.																												.	.	.
Template SS confidence
		356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.		.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.				.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	G	I	G	T	G	L	H	F	R	A	A	H	T	Q	K	Y	Y	R	E	R	F	P	T	L	S	L	P	N	T	E	W	N	S	E	R	I	C	S	L	P	L	F	P	D	M	T	T	A	D	A	D	H	V	I	T	A	L	Q	Q	L	A	G	Q
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	G	V	M	L	G	G	C	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	K	S	I	R	F	R	P	T	L	V	F	R	D	H	H	A	H	L	F	L	N	I	F	S	D	I	L	A	D
Template Known Secondary structure		T	T							T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T								T	T																			T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		432	.	.	.	.	.	.	.	440																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470