Job Description P0AF20 Confidence 99.75% Date Thu Jan 5 11:24:56 GMT 2012 Rank 36 Aligned Residues 328 % Identity 18% Template c1v4sA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:glucokinase isoform 2; PDBTitle: crystal structure of human glucokinase Resolution 2.30 Å

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		37	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.																60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	I	A	E	Q	S	Q	L	A	P	A	S	V	T	K	I	T	R	Q	L	I	E	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	I	K	E	V	D	Q	Q	A	S	T	G	G	R	R	A	I	S	I	V	T	E	T	R	N	F	H	A	I	G	V	R	L	G	R	H	D	A	T	I	T
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	I	L	A	E	F	Q	L	Q	E	E	D	L	K	K	V	M	R	R	M	Q	K	E	M	D	R	G	L	R	L	E	T	H	E	E	A	S	V	K	M	L	P	T	Y	V	R	S	T	P	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	E	V	G	D	F	L	S	L	D	L	G	G	T	N	F	R	V	M
Template Known Secondary structure					G	G	G																							S	T	T	T	T	T	T		S	S									S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		18	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.											.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		102	.	.	.	.	.								.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120					.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.		.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160		.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.																												.														.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.																												.														.
Query Sequence		L	F	D	L	S	S	.	.	.	.	.	.	.	K	V	L	A	E	E	H	Y	P	L	P	E	R	.	.	.	.	T	Q	Q	T	L	E	H	A	L	L	N	A	I	A	Q	F	I	D	S	Y	Q	R	K	L	R	E	L	.	I	A	I	S	V	I	L	P	G	L	V	D	P	.	D	S	G	K	I	H	Y	M
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.																												.														.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.																												.														.
Template Conservation
Template Sequence		L	V	K	V	G	E	G	E	E	G	Q	W	S	V	K	T	K	H	Q	M	Y	S	I	P	E	D	A	M	T	G	T	A	E	M	L	F	D	Y	I	S	E	C	I	S	D	F	L	D	K	H	Q	M	K	H	K	K	L	P	L	G	F	T	F	S	F	P	V	R	H	E	D	I	D	K	G	I	L	L	N	W
Template Known Secondary structure									S	S	S															S	T	T	T	S	S	B																		T	T	T		T	T											S							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		169	170					.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.								190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	H	.	.	.	.	I	Q	V	E	N	W	G	L	V	E	A	L	E	E	R	F	K	V	T	.	.	.	.	.	.	.	C	F	V	G	H	D	I	R	S	L	A	L	A	E	H	Y	F	G	A	S	Q	D	C	E	D	S	I	L	V	R	V	H	R	G	T	G	A	G	I	I	S	N	G	R	I	F	I	G
Query Conservation				.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.	.	.	.
Template Sequence		T	K	G	F	K	A	S	G	A	E	G	N	N	V	V	G	L	L	R	D	A	I	K	R	R	G	D	F	E	M	D	V	V	A	M	V	N	D	T	V	A	T	M	I	S	C	Y	Y	.	.	.	.	E	D	H	Q	C	E	V	G	M	I	V	G	T	G	C	N	A	C	Y	M	E	E	M	Q	N	V	E	L
Template Known Secondary structure			T	T				B	T		T	T	S	B										T	T	T		S																					T	.	.	.	.	T		T	T								S	S	S									G	G	G		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.					.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	N	G	N	V	G	E	I	G	H	I	Q	V	E	P	L	G	E	R	C	H	C	G	N	F	G	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	T	I	A	A	N	A	A	I	E	Q	R	V	L	N	L	L	K	Q	G	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.						.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.						.	.	.	.	.
Template Sequence		V	E	G	D	E	.	.	.	G	R	M	C	V	.	.	.	.	.	N	T	E	W	G	A	F	G	D	S	G	E	L	D	E	F	L	L	E	Y	D	R	L	V	D	E	S	S	A	N	P	G	Q	Q	L	Y	E	K	L	I	G	G	K	Y	M	G	E	L	V	R	L	V	L	L	R	L	V	D	E	N	L	L
Template Known Secondary structure		S	S			S	.	.	.	S					.	.	.	.	.				G	G	G	T	T	T	T	S	T	T	T	T	T											T	S	S	S	T	T	S									T	T	T															T	T		S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.						.	.	.	.	.
Template SS confidence
		244	.	.	.	.				.	250	.	.	.						.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
							286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	Y	Q	S	R	V	P	L	D	D	C	T	I	K	T	I	C	K	A	A	N	K	G	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	S	E	V	I	E	Y	V	G	R	H	L	G	K	T	I	A	I	A	I	N	L	F	N	P
Query Conservation		.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	H	G	E	A	S	E	Q	L	R	T	R	G	A	F	E	T	R	F	V	S	Q	V	E	S	D	T	G	D	R	K	Q	I	Y	N	I	L	S	T	L	G	L	R	P	S	T	T	D	C	D	I	V	R	R	A	C	E	S	V	S	T	R	A	A	H	M	C	S	A	G	L	A	G	V	I	N	R	M	R	E
Template Known Secondary structure		G	G	G				T	G	G	G	S	T	T		S									T	T			S	S	S										T	T																																							T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
		336									.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	.	.	.	.	.	.	.	.	K	I	V	I	A	G	E	I	T	E	A	D	K	V	L	L	P	A	I	E	S	C	I	N	T	Q	A	L	K	A	F	R	T	N	L	P	V	V	R	S	E	L	D	H	R	S	A	I	G	A	F	A	L	V	K
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.
Template Sequence		S	R	S	E	D	V	M	R	I	T	V	G	V	D	G	S	V	Y	K	L	H	P	S	F	K	E	R	F	H	A	S	V	R	R	L	T	.	.	.	.	.	P	S	C	E	I	T	F	I	E	S	E	E	G	S	G	R	G	A	A	L	V	S	A
Template Known Secondary structure		T			S	S	S															S	T	T														.	.	.	.	.	T	T									S	S
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.
Template SS confidence
		396	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.						.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.