Job Description P0AF20 Confidence 99.66% Date Thu Jan 5 11:24:56 GMT 2012 Rank 45 Aligned Residues 347 % Identity 17% Template c1qhaA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:protein (hexokinase); PDBTitle: human hexokinase type i complexed with atp analogue amp-pnp Resolution 2.25 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		16	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.							.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	Q	L	N	S	A	A	V	Y	R	L	I	D	Q	Y	G	P	I	S	R	I	Q	I	A	E	Q	S	Q	L	A	P	A	S	V	T	K	I	T	R	Q	L	I	E	R	G	L	I	K	E	.	.	.	.	.	.	V	D	Q	Q	A	S	T	G	G	R	R	A	I	S	I	V	T	E	T	R	N	F	H	A	I
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.
Template Sequence		R	L	A	E	Q	H	R	Q	I	E	E	T	L	A	H	F	H	L	T	K	D	M	L	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	K	R	M	R	A	E	M	E	L	G	L	R	K	Q	T	H	N	N	A	V	V	K	M	L	P	S	F	V	R	R	T	P	D	G	.	.	.	.	T	E	N	G	D	F	L
Template Known Secondary structure															G	G	G										.	.	.	.	.	.	.	.														S	T	T	T		S	S			S									S				S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.
Template SS confidence
		462	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.									.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.					.	.	.	.	.	.	.
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.						.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.					.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.		.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.												.	.	.	.																														.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.												.	.	.	.																														.
Query Sequence		G	V	R	L	G	R	H	D	A	T	I	T	L	F	D	L	S	S	.	.	.	.	.	K	V	L	A	E	E	H	Y	P	L	P	.	.	.	.	E	R	T	Q	Q	T	L	E	H	A	L	L	N	A	I	A	Q	F	I	D	S	Y	Q	R	K	L	R	E	L	.	I	A	I	S	V	I	L	P	G	L	V	D
Query Conservation																				.	.	.	.	.												.	.	.	.																														.
Alig confidence																				.	.	.	.	.												.	.	.	.																														.
Template Conservation
Template Sequence		A	L	D	L	G	G	T	N	F	R	V	L	L	V	K	I	R	S	G	K	K	R	T	V	E	M	H	N	K	I	Y	A	I	P	I	E	I	M	Q	G	T	G	E	E	L	F	D	H	I	V	S	C	I	S	D	F	L	D	Y	M	G	I	K	G	P	R	M	P	L	G	F	T	F	S	F	P	C	Q	Q	T
Template Known Secondary structure						S	S	S												S	S	S																		T	S	B	S																		T	T			S	S										S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.						.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.					.	.	.	190	.				.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.													.	.	.	.						.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.													.	.	.	.						.	.	.
Query Sequence		P	D	S	G	K	I	H	Y	M	P	H	I	Q	V	E	.	.	.	.	.	N	W	G	L	V	E	A	L	E	E	R	F	.	.	.	.	K	V	T	C	F	.	.	.	V	G	H	D	I	R	S	L	A	L	A	E	H	Y	F	G	A	S	Q	D	C	E	D	S	I	L	V	R	V	H	R	G	T	G	A	G
Query Conservation																	.	.	.	.	.													.	.	.	.						.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.													.	.	.	.						.	.	.															.	.	.	.
Template Conservation																																																												.	.	.	.
Template Sequence		S	L	D	A	G	I	L	I	T	W	T	K	G	F	K	A	T	D	C	V	G	H	D	V	V	T	L	L	R	D	A	I	K	R	R	E	E	F	D	L	D	V	V	A	V	V	N	D	T	V	G	T	M	M	T	C	A	Y	.	.	.	.	E	E	P	T	C	E	V	G	L	I	V	G	T	G	S	N	A	C
Template Known Secondary structure			T	T									T	T				B	T		T	T	S	B													T	S																					T	.	.	.	.	T		T	T								S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.
Template SS confidence
		610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.					.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	I	S	N	G	R	I	F	I	G	R	N	G	N	V	G	E	I	G	H	I	Q	V	E	P	L	G	E	R	C	H	C	G	N	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	L	E	T	I	A	A	N	A	A	I	E	Q	R	V	L	N	L
Query Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.						.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.						.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	M	E	E	M	K	N	V	E	M	V	E	G	D	Q	.	.	.	G	Q	M	C	I	.	.	.	.	.	N	M	E	W	G	A	F	G	D	N	G	C	L	D	D	I	R	T	H	Y	D	R	L	V	N	E	Y	S	L	N	A	G	K	Q	R	Y	E	K	M	I	S	G	M	Y	L	G	E	I	V	R	N	I
Template Known Secondary structure						G	G	G		T	T	S	S			S	.	.	.	S					.	.	.	.	.				G	G	G	T	T	S	S	S	T	T	T	T	T											T	S	T	T	T	T	S								S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.						.	.	.	.	.
Template SS confidence
		686	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700				.	.	.	.	.						.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.
		282	.											.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	Y	Q	S	R	V	P	L	D	D	C	T	I	K	T	I	C	K	A	A	N	K	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	A	S	E	V	I	E	Y	V	G	R	H	L	G	K	T
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	I	D	F	T	K	K	G	F	L	F	R	G	Q	I	S	E	T	L	K	T	R	G	I	F	E	T	K	F	L	S	Q	I	E	S	D	R	L	A	L	L	Q	V	R	A	I	L	Q	Q	L	G	L	N	S	T	C	D	D	S	I	L	V	K	T	V	C	G	V	V	S	R	R	A	A	Q	L	C	G	A	G
Template Known Secondary structure								T	T	S	S	G	G	G				T	T	T	T	S	T	T		S									T		T	T														T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		758	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.
		326	.	.	.	330	.	.	.	.									.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	A	I	A	I	N	L	F	N	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Q	K	I	V	I	A	G	E	I	T	E	A	D	K	V	L	L	P	A	I	E	S	C	I	N	T	Q	A	L	K	A	F	R	T	N	L	P	V	V	R	S	E	L	D	H	R	S	A	I	G	A	F	A	L	V	K
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.
Template Sequence		M	A	A	V	V	D	K	I	R	E	N	R	G	L	D	R	L	N	V	T	V	G	V	D	G	T	L	Y	K	L	H	P	H	F	S	R	I	M	H	Q	T	V	K	E	L	S	.	.	.	.	.	P	K	C	N	V	S	F	L	L	S	E	D	G	S	G	K	G	A	A	L	I	T	A
Template Known Secondary structure													T	T		S	S																T	T														.	.	.	.	.	T	T									T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.
Template SS confidence
		838	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.						.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.