Job Description P0AF20 Confidence 99.74% Date Thu Jan 5 11:24:56 GMT 2012 Rank 38 Aligned Residues 329 % Identity 17% Template c1bdgA_ PDB info PDB header:hexokinase Chain: A: PDB Molecule:hexokinase; PDBTitle: hexokinase from schistosoma mansoni complexed with glucose Resolution 2.60 Å

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		36	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.																60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	Q	I	A	E	Q	S	Q	L	A	P	A	S	V	T	K	I	T	R	Q	L	I	E	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	I	K	E	V	D	Q	Q	A	S	T	G	G	R	R	A	I	S	I	V	T	E	T	R	N	F	H	A	I	G	V	R	L	G	R	H	D	A	T	I
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	E	I	L	K	P	F	D	L	S	V	V	D	Y	E	E	I	C	D	R	M	G	E	S	M	R	L	G	L	Q	K	S	T	N	E	K	S	S	I	K	M	F	P	S	Y	V	T	K	T	P	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	E	T	G	N	F	L	A	L	D	L	G	G	T	N	Y	R	V
Template Known Secondary structure						G	G	G																							S					T	T		S										S				S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		23	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.											.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
		101	.	.	.	.	.	.				.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120					.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160				.	.	.	.	.	.	.	.	.	170
Predicted Secondary structure									.	.	.														.	.	.	.																																									.	.	.
Query SS confidence									.	.	.														.	.	.	.																																									.	.	.
Query Sequence		T	L	F	D	L	S	S	.	.	.	K	V	L	A	E	E	H	Y	P	L	P	E	R	.	.	.	.	T	Q	Q	T	L	E	H	A	L	L	N	A	I	A	Q	F	I	D	S	Y	Q	R	K	L	R	E	L	I	A	I	S	V	I	L	P	G	L	V	D	P	.	.	.	D	S	G	K	I	H	Y	M	P	H
Query Conservation									.	.	.														.	.	.	.																																									.	.	.
Alig confidence									.	.	.														.	.	.	.																								.																	.	.	.
Template Conservation																																																				.
Template Sequence		L	S	V	T	L	E	G	G	K	S	P	R	I	Q	E	R	T	Y	C	I	P	A	E	K	M	S	G	S	G	T	E	L	F	K	Y	I	A	E	T	L	A	D	F	L	E	N	N	G	M	K	.	D	K	K	F	D	L	G	F	T	F	S	F	P	C	V	Q	K	G	L	T	H	A	T	L	V	R	W	T	K
Template Known Secondary structure																							T	T	T	T	T	S	B																			T	T			.	S	S										S						T	T	T									T
Template Predicted Secondary structure																																																				.
Template SS confidence
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.		.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
						171	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.							.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	I	Q	V	E	N	W	G	L	V	E	A	L	E	E	R	F	K	.	.	.	.	.	.	V	T	C	F	V	G	H	D	I	R	S	L	A	L	A	E	H	Y	F	G	A	S	Q	D	C	E	D	S	I	L	V	R	V	H	R	G	T	G	A	G	I	I	S	N	G	R	I	F	I	G	R	N	G
Query Conservation		.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.
Template Sequence		G	F	S	A	D	G	V	E	G	H	N	V	A	E	L	L	Q	T	E	L	D	K	R	E	L	N	V	K	C	V	A	V	V	N	D	T	V	G	T	L	A	S	C	A	L	.	.	.	.	E	D	P	K	C	A	V	G	L	I	V	G	T	G	T	N	V	A	Y	I	E	D	S	S	K	V	E	L	M	D	G
Template Known Secondary structure		T				B	T		T	T	S	B											T	T	T																					T	.	.	.	.	T		T	T								S	S	S									T	T	T		G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.
Template SS confidence
		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.					.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.												.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	V	G	E	I	G	H	I	Q	V	E	P	L	G	E	R	C	H	C	G	N	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	L	E	T	I	A	A	N	A	A	I	E	Q	R	V	L	N	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.									.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.									.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	V	K	E	P	E	V	V	I	.	.	.	.	.	N	T	E	W	G	A	F	G	E	K	G	E	L	D	C	W	R	T	Q	F	D	K	S	M	D	I	D	S	L	H	P	G	K	Q	L	Y	E	K	M	V	S	G	M	Y	L	G	E	L	V	R	H	I	I	V	Y	L	V	E	Q	K	I	L	F	R	G
Template Known Secondary structure		.	.		S	S	S					.	.	.	.	.				G	G	G	T	T	T	T	S	T	T	T	T	T											T	S	S	S	T	T	S		T	T					S																		T	T	S	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.									.	.	.	.	.
Template SS confidence
				251	.	.	.	.	.	.	.						.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	G	Y	Q	S	R	V	P	L	D	D	C	T	I	K	T	I	C	K	A	A	N	K	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	A	S	E	V	I	E	Y	V	G	R	H	L	G	K	T	I	A	I	A	I	N	L	F	N	P
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	L	P	E	R	L	K	V	R	N	S	L	L	T	R	Y	L	T	D	V	E	R	D	P	A	H	L	L	Y	N	T	H	Y	M	L	T	D	D	L	H	V	P	V	V	E	P	I	D	N	R	I	V	R	Y	A	C	E	M	V	V	K	R	A	A	Y	L	A	G	A	G	I	A	C	I	L	R	R	I	N	R
Template Known Secondary structure					S	G	G	G	S	T	T		S		T	T						T	T			T	T												T	S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
		336	.			.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Predicted Secondary structure				.	.
Query SS confidence				.	.
Query Sequence		Q	K	.	.	I	V	I	A	G	E	I	T	E	A	D	K	V	L	L	P	A	I	E	S	C	I	N	T	Q	A	L	K	A	F	R	T	N	L	P	V	V	R	S	E	L	D	H	R	S	A	I	G	A	F	A	L	V
Query Conservation				.	.
Alig confidence				.	.																											.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.
Template Sequence		S	E	V	T	V	G	V	D	G	S	L	Y	K	F	H	P	K	F	C	E	R	M	T	D	M	V	D	K	L	K	.	.	.	.	P	K	N	T	R	F	C	L	R	L	S	E	D	G	S	G	K	G	A	A	A	I	A
Template Known Secondary structure		S								S							T	T													S	.	.	.	.		T	T									T	T
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.
Template SS confidence
		406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.					.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.