Job Description P0AAE0 Confidence 98.00% Date Thu Jan 5 11:12:40 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 433 % Identity 14% Template d2a65a1 SCOP info SNF-like SNF-like SNF-like Resolution 1.65

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Show / Hide Conservation and Alignment quality

		24	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.		.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.					.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.																				.	.	.	.
Query SS confidence																							.																				.	.	.	.
Query Sequence		T	N	R	H	I	Q	L	I	A	I	G	G	A	I	G	T	G	L	F	M	G	.	S	G	K	T	I	S	L	A	G	P	S	I	I	F	V	Y	M	I	I	.	.	.	.	G	F	M	L	F	F	V	M	R	A	M	G	E	L	L	L	S	N	L	E	Y	K	S	F	S	D	F	A	S	D	L	L	G	P	W
Query Conservation																							.																				.	.	.	.
Alig confidence																							.																				.	.	.	.																						.
Template Conservation																																																																				.
Template Sequence		T	R	L	G	L	I	L	A	M	A	G	N	A	V	G	L	G	N	F	L	R	F	P	V	Q	A	A	E	N	G	G	G	A	F	M	I	P	Y	I	I	A	F	L	L	V	G	I	P	L	M	W	I	E	W	A	M	G	R	Y	G	G	A	Q	G	H	G	.	T	T	P	A	I	F	Y	L	L	W	R	N	R
Template Known Secondary structure															S	S					T									T	T	T														T																	T	T	T			.	S									S		S
Template Predicted Secondary structure																																																																				.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.		.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
		99	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	140
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	G	Y	F	T	G	W	T	Y	W	F	C	W	V	V	T	G	M	A	D	V	V	A	I	T	A	Y	A	Q	F	W	F	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	S	D	W	V	A	S	L
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	A	K	I	L	G	V	F	G	L	W	I	P	L	V	V	A	I	Y	Y	V	Y	I	E	S	W	T	L	G	F	A	I	K	F	L	V	G	L	V	P	E	P	P	P	T	D	P	D	S	I	L	R	P	F	K	E	F	L	Y	S	Y	I	G	V	P	K	G	D	E	P	I	L	K	P	S	L	F	A	Y	I
Template Known Secondary structure								T																														T																										T			S	S	S	S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	V	I	V	L	L	L	T	L	N	L	A	T	V	K	M	F	G	E	M	E	F	W	F	A	M	I	K	I	V	A	I	V	S	L	I	V	V	G	L	V	M	V	A	M	H	F	Q	S	P	T	G	V	E	A	S	F	A	H	L	W	N	D	G	G	W	F	P	K	G	L	S	G	F	F	A	G	F	Q	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	F	L	I	T	M	F	I	N	V	S	I	L	I	R	G	I	S	K	G	I	E	R	F	A	K	I	A	M	P	T	L	F	I	L	A	V	F	L	V	I	R	V	F	L	L	E	T	P	N	G	T	A	A	D	G	L	N	F	L	W	T	P	D	F	E	K	L	K	D	P	G	V	W	I	A	A	V	G	Q
Template Known Secondary structure															T	T		T	T	T	T																								T	T				T	T												S			T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		171	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.												.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	V	F	A	F	V	G	I	E	L	V	G	T	T	A	A	E	T	K	D	P	E	K	S	L	P	R	A	I	N	S	I	P	I	R	I	I	M	F	Y	V	F	A	L	I	V	I	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	V	T	P	W	S	S	V	V	P	E	K	S	P	F	V	E	L	F	V	L
Query Conservation																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	F	F	T	L	S	L	G	F	G	A	I	I	T	Y	A	S	Y	V	R	K	D	Q	D	I	V	L	S	G	L	T	A	A	T	L	N	E	K	A	E	V	I	L	G	G	S	I	S	I	P	A	A	V	A	F	F	G	V	A	N	A	V	A	I	A	K	A	G	A	F	N	L	G	F	I	T	L	P	A	I
Template Known Secondary structure							T	T	T	S	S							T	T	S		T	T	S																			T	T																										S	S					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	G	L	P	A	A	A	S	V	I	N	F	V	V	L	T	S	A	A	S	S	A	N	S	G	V	F	S	T	S	R	M	L	F	G	L	A	Q	E	G	V	A	P	K	A	F	A	K	L	S	K	R	A	V	P	A	K	G	L	T	F	S	C	I	C	L	L	G	G	V	V	M	L	Y	V	N	P	S	V	I
Query Conservation
Alig confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	S	Q	T	A	G	G	T	F	L	G	F	L	W	F	F	L	L	F	F	A	G	L	T	S	S	I	A	I	M	Q	P	M	I	A	F	L	E	D	E	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	R	K	H	A	V	L	W	T	A	A	I	V	F	F	S	A	H	L	V	M	F	L	N	K	S	L
Template Known Secondary structure			T	T	S	T	T																																		T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								B	T	T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.											.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.					.	.	.	.	.	.				400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.							.	.	.																																						.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.							.	.	.																																						.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	A	F	T	M	I	T	T	V	S	A	I	L	F	M	F	V	W	T	I	I	L	C	S	.	.	.	.	Y	L	V	Y	R	K	.	.	.	Q	R	P	H	L	H	E	K	S	I	Y	K	M	P	L	G	K	L	M	C	W	V	C	M	A	F	F	V	F	V	V	V	L	L	T	L	E	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																										.	.	.	.							.	.	.																																						.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.							.	.	.																																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	E	M	D	F	W	A	G	T	I	G	V	V	F	F	G	L	T	E	L	I	I	F	F	W	I	F	G	A	D	K	A	W	E	E	I	N	R	G	G	I	I	K	V	P	R	I	Y	Y	Y	V	M	R	Y	I	T	P	A	F	L	A	V	L	L	V	V	W	A	R	E	Y	I	P	K	I	M	E	E	T	H
Template Known Secondary structure								T	T	T																T	T	S											T	T		S	S				T								T																	T							S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	D	T	R	Q	A	L	L	V	T	P	L	W	F	I	A	L	G	L	G	W	L	F	I	G	K	K	R	A	A	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		W	T	V	W	I	T	R	F	Y	I	I	G	L	F	L	F	L	T	F	L	V	F	L	A	E	R	R	R	N	H	E
Template Known Secondary structure		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		481	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.