Job Description P06864 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 268 % Identity 20% Template d2je8a5 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.7

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		318	.	320	.	.	.	.	.	.									.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.			.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.
Query Sequence		R	D	I	K	V	R	D	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	F	W	I	N	N	R	Y	V	M	L	H	G	V	N	R	H	D	N	D	H	R	K	G	R	A	V	G	M	D	R	V	E	K	D	L	Q	L	M	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	T	.	.	A	H	Y	P	N	D	P	R	F	Y	E	L	C
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.																								.																									.	.
Template Conservation																																										.
Template Sequence		R	T	I	R	V	V	N	E	K	D	K	D	G	E	S	F	Y	F	E	V	N	G	I	P	M	F	A	K	G	A	N	Y	I	P	Q	D	A	L	L	P	.	N	V	T	T	E	R	Y	Q	T	L	F	R	D	M	K	E	A	N	M	N	M	V	R	I	W	G	G	G	T	Y	E	N	N	L	F	Y	D	L	A
Template Known Secondary structure												T	T									T	T													S		S	S	G	G	.	G																T	T								T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																										.
Template SS confidence
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370		.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	I	Y	G	L	F	V	M	A	E	T	D	V	E	S	H	G	F	A	N	V	G	D	I	S	R	I	T	D	D	P	Q	W	E	K	V	Y	V	E	R	I	V	R	H	I	H	A	Q	K	N	H	P	S	I	I	I	W	S	L	G	N	E	S	G	Y	G	C	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	E	N	G	I	L	V	W	Q	D	F	M	F	A	C	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	P	S	D	P	T	F	L	K	R	V	E	A	E	A	V	Y	N	I	R	R	L	R	N	H	A	S	L	A	M	W	C	G	N	N	E	I	L	E	A	L	K	Y	W	G	F	E	K	K	F	T	P	E	V
Template Known Secondary structure					T								S		B	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.																							T	T		T	T						S		B	S								S		T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.										.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
														456	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.							.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	R	A	M	Y	H	A	A	K	A	L	D	D	T	R	L	V	H	Y	E	E	D	.	.	.	.	.	.	R	D	A	E	V	V	D	I	I	S	T	M	Y	T	R	V	P	L	M	N	E	F	G	E	Y	P	H	P	K	P	R	I	I	C	E	Y	A	H	A	M
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	Q	G	L	M	H	G	Y	D	K	L	F	R	E	L	L	P	S	T	V	K	E	F	D	S	D	R	F	Y	V	H	S	S	P	Y	L	A	N	W	G	R	P	E	S	W	G	T	G	D	S	H	N	W	G	V	W	Y	G	K	K	P	F	E	S	L	D	T	D	L	P	R	F	M	S	E	F	G	F	Q	S
Template Known Secondary structure														T	T											T	T	S				S	S	B	S	S	S			T	T		G	G	G	T	T	B	S						T	T	T	T	T				G	G	G	G	G	T	S			S	S								B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		481	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560
		518	.	520	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	N	G	P	G	G	L	T	E	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	N	V	F	Y	K	H	D	C	I	Q	G	H	Y	V	W	E	W	C	D	H	G	I	Q	A	Q	D	D	H	G
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	P	E	M	K	T	I	A	A	F	A	A	P	E	D	Y	Q	I	E	S	E	V	M	N	A	H	Q	K	S	S	I	G	N	S	L	I	R	T	Y	M	E	R	D	Y	I	I	P	E	S	F	E	D	F	V	Y	V	G	L	V	L	Q	G	Q	G	M	R	H	G	L	E	A	H	R	R	N	R	P	Y	C	M
Template Known Secondary structure														G	G	G		S	T	T	S						T	B		S	S	S		T											S				S	S																										T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		561	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640
		558	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	V	W	Y	K	F	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N	N	Y	N	F	C	L	D	G	L	I	Y	S	D	Q	T	P	G	P	G	L	K	E	Y	K	Q	V	I	A	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	G	T	L	Y	W	Q	L	N	D	S	W	P	V	V	S	W	S	S	I	D	Y	Y	G	N	W	K	A	L	H	Y	Q	A	K	R	A	F	A	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.					S		S			S	S	S		B	B	S		S	B		T	T	S		B											T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								641	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions