Job Description P06864 Confidence 97.15% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 126 Aligned Residues 215 % Identity 16% Template d1uwsa_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 1.95

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		355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	380	.							.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	R	V	E	K	D	L	Q	L	M	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	T	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	Y	P	N	D	P	.	.	.	.	.	.	R	F	Y	E	L	C	D	I	Y	G	L
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	N	Y	K	T	F	H	D	N	A	Q	K	M	G	L	K	I	A	R	L	N	V	E	W	S	R	I	F	P	N	P	L	P	R	P	F	D	E	S	K	Q	D	V	T	E	V	E	I	N	E	N	E	L	K	R	L	D	E	Y	A	N	K	D	A	L	N	H	Y	R	E	I	F	K	D	L	K	S	R	G	L
Template Known Secondary structure														T	T																S								T	T		S																	T	T	S																		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		61	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
		393	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.										.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.											450	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	V	M	A	E	T	D	V	E	S	H	G	F	A	N	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	I	S	R	I	T	D	D	P	Q	W	E	K	V	Y	V	E	R	I	V	R	H	I	H	A	Q	K	N	H	P	S	I	I	I	W	S	L	G	N	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	Y	G
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.
Template Sequence		Y	F	I	L	N	M	Y	H	W	P	L	P	L	W	L	H	D	P	I	R	V	R	R	G	D	F	T	G	P	S	G	W	L	S	T	R	T	V	Y	E	F	A	R	F	S	A	Y	I	A	W	K	F	D	D	L	V	D	.	.	E	Y	S	T	M	N	E	P	N	V	V	G	G	L	G	Y	V	G	V	K	S
Template Known Secondary structure							S		S	S			B	T	T	T	B							T	T			S	S		B	G	G	G	S																			T	T	T		S	.	.																	T		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.
Template SS confidence
		143	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.			200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
																						454	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	N	I	R	A	M	Y	H	A	A	K	A	L	D	D	T	R	L	V	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	F	P	P	G	Y	L	S	F	E	L	S	R	R	A	M	Y	N	I	I	Q	A	H	A	R	A	Y	D	G	I	K	S	V	S	K	K	P	V	G	I	I	Y	A	N	S	S	F	Q	P	L	T	D	K	D	M	E	A	V	E	M	A	E	N	D	N	R	W	W	F	F	D	A	I	I	R	G	E	I	T	K
Template Known Secondary structure				T	T																												T	T			S														S	S	T	T													T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
		474	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	E	E	D	R	D	A	E	V	V	D	I	I	S	T	M	Y	T	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	L	M	N	E	F	G	E	Y	P	H	P	K	P	R	I
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	V	R	D	D	L	K	G	R	L	D	W	I	G	V	N	Y	Y	T	R	T	V	V	K	R	T	E	K	G	Y	V	S	L	G	G	Y	G	H	G	C	E	R	N	S	V	S	L	A	G	L	P	T	S	D	F	G	W	E	F	F	P	E	G	L	Y	D	V	L	T	K	Y	W	N	R	Y	H	L	Y	M	Y
Template Known Secondary structure					T	T	T	T	T			S																S	S	S					T	T	S	T	T	S	S		S	S	S	B		T	T	S		B	B		T	T			B			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
		510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	G	P	G	G	L	T	E	Y	Q	N	V	F	Y	K	H	D	C	I	Q	G	H	Y	V	W	E	W	C	D	H	G	I	Q	A	Q	D	D	H	G	N	V	W	Y	K	F	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N	N	Y	N	F	C	L	D	G	L	I	Y	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																												.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	T	E	N	G	I	A	D	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Y	Q	R	P	Y	Y	L	V	S	H	V	Y	Q	V	H	R	A	I	N	.	S	G	A	D	V	R	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	H	W	S	L	A	D	N	Y	E	W	A	S
Template Known Secondary structure										T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S																		.	T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S		S	B					G	G	G
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.																.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.		.	.	.	.	.	420	.	.														.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
																	584	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	D	Q	T	P	G	P	G	L	K	E	Y	K	Q	V	I	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	F	S	M	R	F	G	L	L	K	V	D	Y	N	T	K	R	L	Y	W	R	P	S	A	L	V	Y	R	E	I	A	T
Template Known Secondary structure		G	G	G	S				S					T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		436	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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