Job Description P06864 Confidence 98.48% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 106 Aligned Residues 222 % Identity 22% Template d1ug6a_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 0.99

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		355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.						.	.	.	380													.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	R	V	E	K	D	L	Q	L	M	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	T	A	H	.	.	.	.	.	Y	P	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	R	F	Y	E	L	C	D	I	Y	G	L	F	V	M	A	E	T	D	V	E	S	H	G	F	A	N	V	G	D	I	S	R	I	T	D	D
Query Conservation																								.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.
Template Conservation																																																																															.	.
Template Sequence		R	R	Y	E	E	D	I	A	L	M	Q	S	L	G	V	R	A	Y	R	F	S	V	A	W	P	R	I	L	P	E	G	R	G	R	I	N	P	K	G	L	A	F	Y	D	R	L	V	D	R	L	L	A	S	G	I	T	P	F	L	T	L	Y	H	W	D	L	P	L	A	L	E	E	R	G	G	W	R	.	.	S
Template Known Secondary structure															T														S	T	T	S	S	S																				T	T									S	S			B					T	T	T	G	G	G	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.
Template SS confidence
		57	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.			.
		418	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.							450	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	Q	W	E	K	V	Y	V	E	R	I	V	R	H	I	H	A	Q	K	N	H	P	S	I	I	I	W	S	L	G	N	E	.	.	.	.	.	.	S	G	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	N	I	R	A	M	Y	H	A	A	K	A	L	D	D	T
Query Conservation																																		.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.										.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.
Template Sequence		R	E	T	A	F	A	F	A	E	Y	A	E	A	V	A	R	A	L	A	D	R	.	.	V	P	F	F	A	T	L	N	E	P	W	C	S	A	F	L	G	H	W	T	G	E	H	A	P	G	L	R	N	L	E	A	A	L	R	A	A	H	H	L	L	L	G	H	G	L	A	V	E	A	L	R	A	A	G	A	R
Template Known Secondary structure																				T	T	T	.	.																			T	S		S	S	T	T																													T	T		S
Template Predicted Secondary structure																							.	.
Template SS confidence
		135	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.			.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
		470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	L	V	H	Y	E	E	D	R	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	V	V	D	I	I	S	T	M	Y	T	R	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	V	G	I	V	L	N	F	A	P	A	Y	G	E	D	P	E	A	V	D	V	A	D	R	Y	H	N	R	F	F	L	D	P	I	L	G	K	G	Y	P	E	S	P	F	R	D	P	P	P	V	P	I	L	S	R	D	L	E	L	V	A	R	P	L	D	F	L	G	V	N	Y	Y	A	P	V	R	V	A	P	G
Template Known Secondary structure															S													T								T	T	S		S		S			S	S	S								T	T						T				S							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.
																												493	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	530
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	L	M	N	E	F	G	E	Y	P	H	P	K	P	R	I	I	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	G	P	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	E	Y	Q	N	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	G	T	L	P	V	R	Y	L	P	P	E	G	P	A	T	A	M	G	W	E	V	Y	P	E	G	L	Y	H	L	L	K	R	L	G	R	E	V	P	W	P	L	Y	V	T	E	N	G	A	A	Y	P	D	L	W	T	G	E	A	V	V	E	D	P	E	R	V	A	Y	L	E	A	H	V	E	A	A	L	R	A
Template Known Secondary structure			S	S	S								S	S		B		T	T			B																		S	S																S	S		S	S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		293	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
		531	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.						.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.
Query Sequence		F	Y	K	H	D	C	I	Q	G	H	Y	V	W	E	W	C	D	H	G	I	Q	A	Q	D	D	H	G	N	V	W	Y	K	F	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N	N	Y	N	F	C	L	D	G	L	I	Y	S	D	.	.	.	.	.	Q	T	P	G	P	G	L	K	E	Y	K	Q	V	I	A
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.													.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.
Template Sequence		R	E	E	G	V	D	L	R	G	Y	F	V	W	S	L	M	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	F	E	W	A	F	.	G	Y	T	R	R	F	G	L	Y	Y	V	D	F	P	S	Q	R	R	I	P	K	R	S	A	L	W	Y	R	E	R	I	A
Template Known Secondary structure					T											S	B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				G	G	G	.	G	G	G	S				S					T	T	T	T					B
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.
Template SS confidence
		373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				390	.	.	.	.	.		.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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