Job Description P06864 Confidence 99.94% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 31 Aligned Residues 256 % Identity 16% Template d1rh9a1 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.50

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	K	V	R	D	G	L	F	W	I	N	N	R	Y	V	M	L	H	G	V	N	R	H	D	N	D	H	R	K	G	R	A	V	G	M	D	R	V	E	K	D	L	Q	L	M	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	T	A	H	Y	P	N	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	Y	T	D	G	T	H	F	A	L	N	G	K	S	L	Y	I	N	G	F	N	A	Y	W	L	M	Y	I	A	Y	D	P	S	T	R	I	K	V	T	N	T	F	Q	Q	A	S	K	Y	K	M	N	V	A	R	T	W	A	F	S	H	G	G	S	R	P	L	Q	S	A	P	G	V	Y	N	E	Q	M	F	Q	G
Template Known Secondary structure						T	T					T	T											T	T							S	T	T	T	T													T	T								S	S		S	S	S	S	S		S				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		33	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.
				382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.															.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.									.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	R	F	Y	E	L	C	D	I	Y	G	L	F	V	M	A	E	T	D	V	E	S	H	G	F	A	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	D	I	S	R	I	T	D	D	P	Q	W	E	K	V	Y	V	E	R	I	V	R	H	I	H	A	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	K	N
Query Conservation		.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	D	F	V	I	S	E	A	K	K	Y	G	I	H	L	I	M	S	L	V	N	N	W	D	A	F	G	G	K	K	Q	Y	V	E	W	A	V	Q	R	G	Q	K	L	T	S	D	D	D	F	F	T	N	P	M	V	K	G	F	Y	K	N	N	V	K	V	V	L	T	R	V	N	T	I	T	K	V	A	Y	K	D
Template Known Secondary structure												T	T									B	S	S	S	S	S	S	B											T	T						G	G	G	G	G	T																			B		T	T	T		S	B	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		113	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.
		438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.										.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	480	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	P	S	I	I	I	W	S	L	G	N	E	S	G	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	N	I	R	A	M	Y	H	A	A	K	A	L	D	D	T	R	L	V	H	Y	E	E	D	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	E	V	V	D
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	P	T	I	L	S	W	E	L	I	N	E	P	R	C	P	S	D	L	S	G	K	T	F	Q	N	W	V	L	E	M	A	G	Y	L	K	S	I	D	S	N	H	L	L	E	I	G	L	E	G	F	Y	G	N	D	M	R	Q	Y	N	P	N	S	Y	I	F	G	T	N	F	I	S	N	N	Q	V	Q	G	I	D
Template Known Secondary structure			T	T						S		B	S				T	T		T	T	S																				S	S												G	G	G	G	G	G	S	G	G	G				S								T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		193	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.
		485	.	.	.	.	490	.									.	.	.	.	.	.	.	.	500	.											.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	I	S	T	M	Y	T	.	.	.	.	.	.	.	.	R	V	P	L	M	N	E	F	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	P	H	P	K	P	R	I	I	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	G	P	G	G	L	T	E	Y	Q	N	V	F	Y	K	H	D	C	I	Q	G	H	Y	V	W	E	W	C
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																						.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	T	T	I	H	M	Y	P	N	Q	W	L	P	G	L	T	Q	E	A	Q	D	K	W	A	S	Q	W	I	Q	V	H	I	D	D	S	K	M	L	K	K	P	L	L	I	A	E	F	G	K	S	T	K	T	P	G	Y	T	V	A	K	R	D	N	Y	F	E	K	I	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	T	I	F
Template Known Secondary structure													S	T	T	S																								T	S											T	T	S	T	T														.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340								.	.	.	.	.
		547	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	H	G	I	Q	A	Q	D	D	H	G	N	V	W	Y	K	F	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N	N	Y	N	F	C	L	D	G	L	I	Y	S	D	Q
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.
Template Sequence		N	C	A	K	S	G	G	P	C	G	G	G	L	F	W	Q	V	L	G	Q	G	M	S	S	F	D	D	G	.	.	.	.	Y	Q	V	V	L	Q	E	S
Template Known Secondary structure						T	T		S							S		B			T	T		G	G	G			S	.	.	.	.			B		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.
Template SS confidence
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.					.	.	.	.	.	.	380	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions