Job Description P06864 Confidence 97.72% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 119 Aligned Residues 232 % Identity 21% Template d1qoxa_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 2.7

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		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.						.	.	.	380	.													.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	E	K	D	L	Q	L	M	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	T	A	H	.	.	.	.	.	Y	P	N	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	F	Y	E	L	C	D	I	Y	G	L	F	V	M	A	E	T	D	V	E	S	H	G	F	A	N	V	G	D	I	S	R	I	T	D	D	P	Q
Query Conservation																						.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation																																																										.	.
Template Sequence		V	E	E	D	V	Q	L	L	K	D	L	G	V	K	V	Y	R	F	S	I	S	W	P	R	V	L	P	Q	G	T	G	E	V	N	R	A	G	L	D	Y	Y	H	R	L	V	D	E	L	L	A	N	G	I	E	P	F	.	.	C	T	L	Y	H	W	D	L	P	Q	A	L	Q	D	Q	G	G	W	G	S	R	I
Template Known Secondary structure													T		S												S	T	T	S	S	S	S																			T	T					.	.					S	S			B					T	T	T	G	G	G	S	T
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.
Template SS confidence
		61	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.			.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.
		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	E	K	V	Y	V	E	R	I	V	R	H	I	H	A	Q	K	N	H	P	S	I	I	I	W	S	L	G	N	E	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	C	N	I	R	A	M	Y	H	A	A	K	A	L	D	D	T	R	L
Query Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.
Template Sequence		T	I	D	A	F	A	E	Y	A	E	L	M	F	K	E	L	G	G	K	.	.	I	K	Q	W	I	T	F	N	E	P	W	C	M	A	F	L	S	N	Y	L	G	V	H	A	P	G	N	K	D	L	Q	L	A	I	D	V	S	H	H	L	L	V	A	H	G	R	A	V	T	L	F	R	E	L	G	I	S	G	E
Template Known Secondary structure																		T	T	T	.	.																			T	S		S	S	T	T																													T	T			S
Template Predicted Secondary structure																					.	.
Template SS confidence
		139	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.			.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
		472									.	.	.	.	.	.	.	480	.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	.	.	.	.	.	.	.	.	H	Y	E	E	D	R	D	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	V	D	I	I	S	T	M	Y	T
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	G	I	A	P	N	T	S	W	A	V	P	Y	R	R	T	K	E	D	M	E	A	C	L	R	V	N	G	W	S	G	D	W	Y	L	D	P	I	Y	F	G	E	Y	P	K	F	M	L	D	W	Y	E	N	L	G	Y	K	P	P	I	V	D	G	D	M	E	L	I	H	Q	P	I	D	F	I	G	I	N	Y	Y
Template Known Secondary structure														S	S	S														T	T	T									T	S	S													T							T	T										S							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.
		492																																						.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.		.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Query Sequence		R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	L	M	N	E	F	G	E	Y	P	H	P	K	P	.	R	I	I	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	G	P	G	G	L	T	E	Y	Q	N	V	F	Y	K
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Conservation
Template Sequence		T	S	S	M	N	R	Y	N	P	G	E	A	G	G	M	L	S	S	E	A	I	S	M	G	A	P	K	T	D	I	G	W	E	I	Y	A	E	G	L	Y	D	L	L	R	Y	T	A	D	K	Y	G	N	P	T	L	Y	I	T	E	N	G	A	C	Y	N	D	G	L	S	L	D	G	R	I	H	D	Q	R	R	I
Template Known Secondary structure										S	S	G	G	G	T	T	T	T										B		T	T	S		B			T														T	T	S																		T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		297	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
		534	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.					.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.						.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Query Sequence		H	D	C	I	Q	G	H	Y	V	W	E	W	C	D	H	G	I	Q	A	Q	D	D	H	G	N	V	W	Y	K	F	.	.	.	.	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N	N	Y	N	F	C	L	D	G	L	I	Y	S	D	.	.	.	.	.	Q	T	P	G	P	G	L	K	E	Y	K	Q	V	I	A
Query Conservation																																.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.															.									.	.	.	.													.										.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.															.																									.
Template Sequence		D	.	.	.	.	.	.	Y	L	A	M	H	L	I	Q	A	S	R	A	I	E	.	D	G	I	N	L	K	G	Y	M	E	W	S	L	M	D	N	F	E	W	A	E	G	Y	G	.	M	R	F	G	L	V	H	V	D	Y	D	T	L	V	R	T	P	K	D	S	F	Y	W	Y	K	G	V	I	S
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.															.	T	T											S	B					G	G	G	T	T	S	.	S				S					T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.															.																									.
Template SS confidence
		377							.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.		.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.		.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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