Job Description P06864 Confidence 99.16% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 69 Aligned Residues 219 % Identity 16% Template d1hjsa_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.87

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		361	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.			.	.	.	.	.	.	380									.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.				.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.								.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Query SS confidence															.	.								.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Query Sequence		L	Q	L	M	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	.	.	T	A	H	Y	P	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	P	R	F	Y	E	L	C	D	I	Y	G	L	F	V	M	A	E	T	.	.	.	D	V	E	S	H	G	F	A	N	V	G	D	I	S	R	I	T	D	D	P	Q	W	E	K	V	Y	V	E	R
Query Conservation															.	.								.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Alig confidence															.	.								.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	N	I	L	A	A	N	G	V	N	T	V	R	Q	R	V	W	V	N	P	A	D	G	N	Y	N	L	D	Y	N	I	A	I	A	K	R	A	K	A	A	G	L	G	V	Y	I	D	F	H	Y	S	D	T	W	A	D	P	A	H	Q	T	M	P	A	G	W	P	S	D	I	D	N	L	S	W	K	L	Y	N	Y
Template Known Secondary structure								T	T										S	S		T	T		T	T	S														T	T										S	S	S			B	T	T	B		B			T	T				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		33	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.
		428	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.		.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.																.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.			.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
Predicted Secondary structure																	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	V	R	H	I	H	A	Q	K	N	H	P	S	I	I	.	I	W	S	L	G	N	E	S	G	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	N	I	R	A	M	Y	H	A	A	K	A	L	.	.	D	D	T	R	L	V	H	Y	E	E	D	R	D	A	E	V	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	L	D	A	A	N	K	L	Q	N	A	G	I	Q	P	T	I	V	S	I	G	N	E	I	R	A	G	L	L	W	P	T	G	R	T	E	N	W	A	N	I	A	R	L	L	H	S	A	A	W	G	I	K	D	S	S	L	S	P	K	P	K	I	M	I	H	L	D	N	G	W	D	W	G	T	Q	N	W	W	Y
Template Known Secondary structure												T	T				S					S	S	S	G	G	G			T	B	T	T			T	T																		T	S			S	S									S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		113	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.
															483	.	.	.	.	.	.	490	.								.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.				.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.														.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.														.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	D	I	I	S	T	M	Y	T	.	.	.	.	.	.	.	R	V	P	L	M	N	E	F	G	E	Y	P	H	.	.	.	P	K	P	R	I	I	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	G	P	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.														.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.														.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	N	V	L	K	Q	G	T	L	E	L	S	D	F	D	M	M	G	V	S	F	Y	P	F	Y	S	S	S	A	T	L	S	A	L	K	S	S	L	D	N	M	A	K	T	W	N	K	E	I	A	V	V	E	T	N	W	P	I	S	C	P	N	P	R	Y	S	F	P	S	D	V	K	N	I	P	F	S	P	E	G
Template Known Secondary structure						T	T	S	S	S		G	G	G										S	S	S		T	T																														S	B		S	S		S	S				G	G	G	T	T	S		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		193	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.
						524	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	L	T	E	Y	Q	N	V	F	Y	K	H	D	C	I	Q	G	H	Y	V	W	E	W	C	D	H	G	I	Q	A	Q	D	D	H	G	N	V	W	Y	K	F	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N	N	Y	N	F	C	L	D	G	L	I	Y	S	D	Q	T	P	G	P	G	L	K	E	Y	K	Q	V
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	T	T	F	I	T	N	V	A	N	I	V	S	S	V	S	R	G	V	G	L	F	Y	W	E	P	A	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	H	N	A	N	L	G	S	S	C	A	D	N	T	M	F	S	Q	S	G	Q	A	L	S	S	L	S	V	F	Q	R	I
Template Known Secondary structure															T	S	T	T									T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	T	T	T	T	S	S	S	S	B			S	B		T	T	S	B	B		G	G	G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions