Job Description P06864 Confidence 99.86% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 42 Aligned Residues 252 % Identity 15% Template d1ecea_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 2.40

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		320	.	.	.	.	.	.	.	.		.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.			.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
Predicted Secondary structure											.														.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.														.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	K	V	R	D	G	L	F	W	.	I	N	N	R	Y	V	M	L	H	G	V	N	R	.	.	H	D	N	D	H	R	K	G	R	A	V	G	M	D	R	V	E	K	D	L	Q	L	M	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	T	A	H	Y	P	N	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation											.														.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.														.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	H	T	S	G	R	E	I	L	D	A	N	N	V	P	V	R	I	A	G	I	N	W	F	G	F	E	T	C	N	Y	V	V	H	G	L	W	S	R	D	Y	R	S	M	L	D	Q	I	K	S	L	G	Y	N	T	I	R	L	P	Y	S	D	D	I	L	K	P	G	T	M	P	N	S	I	N	F	Y	Q	M	N
Template Known Secondary structure						T	T					T	T	S													B	T	T	T	T		S		T	T	T	T	T	S												T	T										G	G	G	G	S	T	T					S				S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
															382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	F	Y	E	L	C	D	I	Y	G	L	F	V	M	A	E	T	D	V	E	S	H	G	F	A	N	V	G	D	I	S	R	I	T	D	D	P	Q	W	E	K	V	Y	V	E	R	I	V	R	H	I	H	A	Q	K	N	H	P	S	I	I	I	W	S	L	G	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.
Template Sequence		Q	D	L	Q	G	L	T	S	L	Q	V	M	D	K	I	V	A	Y	A	G	Q	I	G	L	R	I	I	L	D	R	.	.	.	.	H	R	P	D	C	S	G	Q	S	A	L	W	Y	T	S	S	V	S	E	A	T	W	I	S	D	L	Q	A	L	A	Q	R	Y	K	G	N	P	T	V	V	G	F	D	L	H	N
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	T																	T	T								.	.	.	.			S	B	T	T	B			S	S	S			S	S	S																T	T	T		T	T							S	S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.					.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
		449	450	.														.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	C	N	I	R	A	M	Y	H	A	A	K	A	L	D	D	T	R	L	V	H	Y	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	R	D	A	E	V	V	D	I	I	S	T	M	Y	T	R
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	P	H	D	P	A	C	W	G	C	G	D	P	S	I	D	W	R	L	A	A	E	R	A	G	N	A	V	L	S	V	N	P	N	L	L	I	F	V	E	G	V	Q	S	Y	N	G	D	S	Y	W	W	G	G	N	L	Q	G	A	G	Q	Y	P	V	V	L	N	V	P	N	R	L	V	Y	S	A	H	D	Y	A
Template Known Secondary structure					T	T		B	S	S				T	T	T	B																	T	T	S							B	S			T	T				S	T	T	T	B		T	T	T	T	T	S					S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
																							493	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	L	M	N	E	F	G	E	Y	P	H	P	K	P	R	I	I	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	G	P	G	G	L	T	E	Y	Q	N	V	F	Y	K	H	D	C	I	Q	G	H	Y	V	W	E	W	C	D	H	G	I	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.																									.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.																									.	.	.	.	.
Template Sequence		T	S	V	Y	P	Q	T	W	F	S	D	P	T	F	P	N	N	M	P	G	I	W	N	K	N	W	G	Y	L	F	N	Q	N	I	A	P	V	W	L	G	E	F	G	T	T	L	Q	S	T	.	.	T	D	Q	T	W	L	K	T	L	V	Q	Y	L	R	P	T	A	Q	Y	G	A	D	S	F	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	T				G	G	G	S		T	T	T	T	T	T									T						T	T	S	S													S		.	.													T							T	T	S	S		.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.																									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290			.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
		552	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.		.	.	.	.	590	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.
Query SS confidence																																				.
Query Sequence		A	Q	D	D	H	G	N	V	W	Y	K	F	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N	N	Y	N	F	C	L	D	G	L	I	Y	S	D	.	Q	T	P	G	P	G	L	K	E	Y
Query Conservation																																				.
Alig confidence		.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.									.
Template Conservation		.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	Q	W	T	F	W	S	W	N	P	D	S	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	G	I	L	K	D	D	W	Q	T	V	D	T	V	K	D	G	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.					S		S		S			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	T			S	B		T	T	S	S	S	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
							315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.									.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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