Job Description P06864 Confidence 98.05% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 112 Aligned Residues 237 % Identity 19% Template c3qomA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:6-phospho-beta-glucosidase; PDBTitle: crystal structure of 6-phospho-beta-glucosidase from lactobacillus2 plantarum Resolution 1.50 Å

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		355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.						.	.	.	380														.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	R	V	E	K	D	L	Q	L	M	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	T	A	H	.	.	.	.	.	Y	P	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	R	F	Y	E	L	C	D	I	Y	G	L	F	V	M	A	E	T	D	V	E	S	H	G	F	A	N	V	G	D	I	S	R	I	T	D
Query Conservation																								.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	R	Y	P	E	D	I	E	L	F	A	E	X	G	F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	N	G	D	E	S	E	P	N	E	A	G	L	Q	F	Y	D	D	L	F	D	E	C	L	K	N	G	I	Q	P	V	V	T	L	A	H	F	E	X	P	Y	H	L	V	K	Q	Y	G	G	W	R	N
Template Known Secondary structure															T		S												S	S	S	S			S	S																			T	T									S	S			B									G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
		417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	460	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	P	Q	W	E	K	V	Y	V	E	R	I	V	R	H	I	H	A	Q	K	N	H	P	S	I	I	I	W	S	L	G	N	E	S	G	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	N	I	R	A	M	Y	H
Query Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																						.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																						.	.
Template Sequence		.	R	K	L	I	Q	F	Y	L	N	F	A	K	V	C	F	E	R	Y	R	D	K	.	.	V	T	Y	W	X	T	F	N	E	I	N	N	Q	T	N	F	E	S	D	G	A	X	L	T	D	S	G	I	I	H	Q	P	G	E	N	R	E	R	W	X	Y	Q	A	A	H	Y	E	L	V	A	S	A	A	A	V	Q
Template Known Secondary structure		.	T																	T	T	T	T	.	.								T	T	G	G	G	G	G	S	T	T															T	T
Template Predicted Secondary structure		.																						.	.
Template SS confidence
			151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.			.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
		462	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.				.	.	.	.	.	.	.	480																																																										.
Predicted Secondary structure													.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	A	K	A	L	D	D	T	R	L	V	.	.	.	H	Y	E	E	D	R	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E
Query Conservation													.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	G	H	Q	I	N	P	D	F	Q	I	G	C	X	I	A	X	C	P	I	Y	P	L	T	A	A	P	A	D	V	L	F	A	Q	R	A	X	Q	T	R	F	Y	F	A	D	V	H	C	N	G	T	Y	P	Q	W	L	R	N	R	F	E	S	E	H	F	N	L	D	I	T	A	E	D	L	K	I	L	Q	A	G
Template Known Secondary structure								T	T															S	S	S																									S	S												T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
		482	.	.	.	.	.	.	.	490	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	V	D	I	I	S	T	M	Y	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	V	P	L	M	N	E	F	G	E	Y	P	H	P	K	P	R	I	I	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	G	P	G	G	L
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	V	D	Y	I	G	F	S	Y	Y	X	S	F	T	V	K	D	T	G	K	L	A	Y	N	E	E	H	D	L	V	K	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	V	D	P	V	G	L	R	Y	A	X	N	W	F	T	D	R	Y	H	L	P	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	I	D	K	K	T	A	D
Template Known Secondary structure				S							S									S	S	S				T	T	T	S					T	T	S		B		T	T	S		B			S																											B				B		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
		525	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.					.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.											.	.	.	.	.	.	.	590
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	E	Y	Q	N	V	F	Y	K	H	D	C	I	Q	G	H	Y	V	W	E	W	C	D	H	G	I	Q	A	Q	D	D	H	G	N	V	W	Y	K	F	.	.	.	.	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N	N	Y	N	F	C	L	D	G	L	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	S	D	Q	T	P	G	P
Query Conservation																																									.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	Q	I	H	D	D	Y	R	I	D	.	.	.	.	.	.	Y	L	T	D	H	L	R	Q	I	K	L	A	V	L	E	D	G	V	D	L	I	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	L	V	A	A	S	T	G	Q	X	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	E	N	D	D	G	S	G	S	L	K	R	Y	K	K	D
Template Known Secondary structure		S		B								.	.	.	.	.	.															T	T										B	T	S	B					T	T	T			S	S	S	B			S							T	T	S		S
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.							.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
		591	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	L	K	E	Y	K	Q	V	I	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	F	T	W	F	Q	H	V	I	A
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		462	.	.	.	.	.	.	.	470	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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