Job Description P06864 Confidence 99.71% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 50 Aligned Residues 595 % Identity 14% Template c3ogrA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:beta-galactosidase; PDBTitle: complex structure of beta-galactosidase from trichoderma reesei with2 galactose Resolution 1.50 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.						.	.	.	.	.	380	.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	D	I	K	V	R	D	G	L	F	W	I	N	N	R	Y	V	M	L	H	G	V	N	R	H	D	N	D	H	R	K	G	R	A	V	G	M	D	R	V	E	K	D	L	Q	L	M	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	T	.	.	.	.	.	A	H	Y	P	N	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																											.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.
Template Sequence		N	I	V	T	W	D	E	H	S	L	F	V	H	G	E	R	V	V	I	F	S	G	E	V	H	P	F	.	.	.	.	.	R	L	P	V	P	S	L	Y	L	D	V	F	H	K	I	K	A	L	G	F	N	T	V	S	F	Y	V	D	W	A	L	L	E	G	K	P	G	R	F	R	A	D	G	I	F	S	L	E
Template Known Secondary structure		S	S					S	S					T	T												G	G	.	.	.	.	.	G				G	G	G											T	T															S	B	T	T	B					G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.
Template SS confidence
		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70						.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.										410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440						.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Query Sequence		R	F	Y	E	L	C	D	I	Y	G	L	F	V	M	A	E	T	D	V	E	S	H	G	F	A	N	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	I	S	R	I	T	D	D	P	Q	W	E	K	V	Y	V	E	R	I	V	R	H	I	H	A	Q	K	N	H	P	S	.	.	.	.	.	I	I	I	W	S	L	G
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	F	F	E	A	A	T	K	A	G	I	Y	L	L	A	R	P	G	P	Y	I	N	A	E	V	S	G	G	G	F	P	G	W	L	Q	R	V	K	G	K	L	R	T	D	A	P	D	Y	L	H	A	T	D	N	Y	V	A	H	I	A	S	I	I	A	K	A	Q	I	T	N	G	G	P	V	I	L	Y	Q	P	E
Template Known Secondary structure											T									S				T	T	B	G	G	G	G			G	G	G	G	G			S		T	T	S																							T	B	G	G	G	T	S	S							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		119	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.
		448	.	450	.	.	.										.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	E	S	G	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	N	I	R	A	M	Y	H	A	A	K	A	L	D	D	T	R	L	V	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	E	E	D	R	D	A	E	V	V	D	I	I	S	T	M	Y	T	R
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	E	Y	S	G	A	A	E	G	V	L	F	P	N	K	P	Y	M	Q	Y	V	I	D	Q	A	R	N	A	G	I	I	V	P	L	I	N	N	D	A	F	P	G	G	T	G	A	P	G	T	G	L	G	S	V	D	I	Y	G	H	D	G	Y	P	L	G	F	D	C	A	H	P	S	A	W	P	D	N	G	L	P
Template Known Secondary structure		S					B		T	T	S		S	S															T	T			S		B	B			B	S	S	S			T	T		T	T	S		T	T			S	B							T	T		S			S		T	T				T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.
		493	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	P	L	M	N	E	F	G	E	Y	P	H	P	K	P	R	I	I	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	G	P	G	G	L	T	E	Y	Q	N	V	F	Y	K	H	D	C	I	Q	G	H	Y	V	W	E	W	C	D	H	G	I	Q	A	Q	D	D	H	G	N	V	W	Y	K	F	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N
Query Conservation
Alig confidence																																																																.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.
Template Sequence		T	T	W	R	Q	D	H	L	N	I	S	P	S	T	P	F	S	L	V	E	F	Q	G	G	A	F	D	P	F	G	G	W	G	F	E	Q	C	S	A	L	V	N	H	E	F	E	R	V	F	Y	K	N	N	M	A	A	G	V	T	I	F	N	.	.	.	.	I	Y	M	T	F	G	G	T	N	W	G	N	L	G
Template Known Secondary structure													T	T	S									S	S					T	T	S										S	S														T	T		S				.	.	.	.								B			T	T		B
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.
Template SS confidence
		279	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340					.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.
		573	.	.	.	.	.	.					580	.	.	.	.	.	.	.	.	.		590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.											.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.											.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	Y	N	F	C	L	D	.	.	.	.	G	L	I	Y	S	D	Q	T	P	G	.	P	G	L	K	E	Y	K	Q	V	I	A	P	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	I	H	A	R	D	L	T	R	G	E	L	K	V	E	N	K	L	W
Query Conservation									.	.	.	.											.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.											.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	P	G	G	Y	T	S	Y	D	Y	G	A	S	I	R	E	D	R	R	I	D	R	E	K	Y	S	E	L	K	L	Q	G	Q	F	L	K	V	S	P	G	Y	I	T	A	T	P	E	N	A	T	Q	G	V	Y	S	D	S	Q	N	I	V	I	T	P	L	L	A	K	E	S	G	D	F	F	V	V	R	H	A	N
Template Known Secondary structure			T	T	S		S	B			T	T		S	B		T	T					S															T		T					S						B	S	S	S	S	S	S		S	S									S	S	S									S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
		622	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.		.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.					.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.																												.	.	.	.
Query SS confidence																		.																												.	.	.	.
Query Sequence		F	T	T	L	D	D	Y	T	L	H	A	E	V	R	A	E	.	G	E	T	L	A	T	Q	Q	I	K	L	R	D	V	A	P	N	S	E	A	P	L	Q	I	T	L	P	.	.	.	.	Q	L	D	A	R	E	A	F	L	N	I	T	V	T	K	D	S	R	T	R	Y	S	E	A	G	H	P	I	A	T	Y	Q
Query Conservation																		.																												.	.	.	.
Alig confidence																		.																												.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	S	S	T	D	T	A	S	Y	T	V	K	L	P	T	S	A	G	D	L	T	I	P	Q	L	G	G	S	L	T	L	T	G	R	D	S	K	I	H	V	T	D	Y	P	V	G	K	F	T	L	L	Y	S	T	A	E	I	F	T	W	N	E	F	A	E	K	T	V	L	V	L	Y	G	G	A	Q	E	L	H	E
Template Known Secondary structure		T	T			S											T	T							T	T	S							T	T												T	T							S	S									S	S										T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.
		697	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.				.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.
Query Sequence		F	P	L	K	E	N	T	A	Q	P	V	P	F	A	P	N	N	A	R	P	L	T	L	E	D	D	R	L	S	C	T	V	R	G	Y	N	F	A	I	T	F	S	K	M	S	G	K	P	T	S	W	Q	V	N	G	.	.	.	E	S	L	L	T	R	E	P	K	I	N	F	F	K	P	M	I	D	N	H	K	Q
Query Conservation																																																									.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.																																														.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	A	V	K	.	.	.	.	.	.	N	P	F	G	S	S	K	T	A	K	A	K	K	I	E	G	S	N	V	T	I	H	T	T	S	N	L	T	V	V	L	Q	W	T	A	S	S	A	R	Q	V	V	Q	L	G	S	L	V	I	Y	M	V	D	R	N	S	A	Y	N	Y	W	V	P	T	L	P	G	S	G	K
Template Known Secondary structure						.	.	.	.	.	.			S	T	T		S	S									S	S							T	T											S	S							T	T												T	T					B				S	S	T
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		515	.	.	.							.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.
		774	.										.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.				.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.
Query Sequence		E	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	L	W	Q	P	N	H	L	Q	I	M	Q	E	H	L	R	D	F	A	V	E	Q	S	D	G	E	V	L	I	I	S	R	T	V	I	A	P	P	V	F	D	F	G	M	R	C	T	.	.	.	Y	I	W	R	I	A	A	D	G	Q	V	N	V	A	L	S	G	E
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	S	A	Y	G	S	S	L	M	N	P	D	S	V	I	I	N	G	G	Y	L	I	R	S	V	A	I	K	G	N	A	L	S	V	Q	A	D	F	N	V	T	T	P	L	E	I	I	G	I	P	K	G	I	S	K	L	A	V	N	G	K	E	L	G	Y	S	V	S	E	L	G	D	W	I	A	H	P	A	I	E
Template Known Secondary structure		T	G	G	G		S		S	S	S			B							S									T	T								B	S	S								S			T	T							T	T									T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		589	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.
		842	.	.	.	.	.	.	.	850	.			.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880			.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.			.
Predicted Secondary structure												.	.																														.	.																																			.	.
Query SS confidence												.	.																														.	.																																			.	.
Query Sequence		R	Y	G	D	Y	P	H	I	I	P	.	.	C	I	G	F	T	M	G	I	N	G	E	Y	D	Q	V	A	Y	Y	G	R	G	P	G	E	N	Y	A	D	S	.	.	Q	Q	A	N	I	I	D	I	W	R	S	T	V	D	A	M	F	E	N	Y	P	F	P	Q	N	N	G	N	R	Q	H	V	R	W	.	.	T
Query Conservation												.	.																														.	.																																			.	.
Alig confidence												.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.																																			.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	P	H	V	Q	V	P	E	L	T	K	L	K	W	Y	K	V	D	S	L	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	R	S	N	Y	D	D	S	R	W	P	L	A	N	L	R	T	S	N	N	T	Y	A	P	L	K	T	P	V	S	L	Y	G	S	D	Y	G	F	H	A	G	T	L	L	F	R	G
Template Known Secondary structure										G	G	G	S							S		G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	T	T				T	T	S		B				S					S	S	S				S	S	S			B	G	G	G	G	T			S	S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		669	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690												.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.
		916	.	.	.	920	.	.				.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.
Query SS confidence									.	.	.
Query Sequence		A	L	T	N	R	H	G	.	.	.	N	G	L	L	V	V	P	Q	R	P	I	N	F	S	A	W
Query Conservation									.	.	.
Alig confidence									.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	F	T	A	R	T	A	R	Q	Q	L	F	L	S	T	Q	G	G	S	A	F	A	S	S	V	W
Template Known Secondary structure						S	S	S	S										S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		738	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.