Job Description P06864 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 641 % Identity 21% Template c3gm8A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:glycoside hydrolase family 2, candidate beta-glycosidase; PDBTitle: crystal structure of a beta-glycosidase from bacteroides vulgatus Resolution 2.40 Å

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		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	F	L	P	L	S	G	Q	W	N	F	H	F	F	D	H	P	L	Q	V	P	E	A	F	T	S	E	L	M	A	D	W	G	H	I	T	V	P	A	M	W	Q	M	E	G	H	G	K	L	Q	Y	T	D	E	G	F	P	F	P	I	D	V	P	F	V	P	S	D	N	P	T	G	A	Y	Q	R	I	F	T	L
Query Conservation
Alig confidence																											.	.																							.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.																							.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	T	I	N	F	C	K	G	W	K	F	H	L	G	D	A	G	K	G	A	S	S	S	S	Y	.	.	N	D	S	Q	W	R	I	L	N	I	P	H	D	W	S	I	E	G	T	Y	K	Q	.	.	.	.	.	.	F	E	N	G	T	D	W	Q	S	G	F	L	P	A	G	I	S	W	Y	R	K	T	F	T	I
Template Known Secondary structure								S	S						S				G	G	G	G	S	S	S		.	.			T	T	S					S	S			G	G	G	G	S				S	.	.	.	.	.	.	S	T	T	S			T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																											.	.																							.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		21	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.			.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.							.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	D	G	W	Q	G	K	Q	T	L	I	K	F	D	G	V	E	T	Y	F	E	V	Y	V	N	G	Q	Y	V	G	F	S	K	G	S	R	L	T	A	E	F	D	I	S	A	M	V	K	T	G	D	N	L	L	C	V	R	V	M	Q	W	A	D	S	T	Y	V	E	D	Q	D	M	W	W	S	A	G	I	F	R
Query Conservation
Alig confidence																																																												.	.	.	.
Template Conservation																																																												.	.	.	.
Template Sequence		P	S	K	W	K	N	K	K	V	Q	I	L	F	E	G	V	Y	L	N	S	E	V	W	I	N	G	H	W	L	G	K	R	P	N	G	Y	I	S	F	V	Y	D	L	T	P	Y	L	Q	E	G	K	N	Q	I	A	V	K	V	.	.	.	.	D	H	S	K	A	L	T	G	R	W	Y	T	G	S	G	I	Y	R
Template Known Secondary structure			S	G	G	G	S								S			B	S							T	T									S	S								G	G	G			S	S									.	.	.	.				S					S	S					B			S
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.
Template SS confidence
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150					.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.			.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.
Query SS confidence																.	.
Query Sequence		D	V	Y	L	V	G	K	H	L	T	H	I	N	D	.	.	F	T	V	R	T	D	F	D	E	A	Y	C	D	A	T	L	S	C	E	V	V	L	E	N	L	A	A	S	P	V	V	T	T	L	E	Y	T	L	F	D	G	E	R	V	V	H	S	S	A	I	D	H	L	A	I	E	K	L	T	S	A	S	F	A
Query Conservation																.	.
Alig confidence																.	.											.																			.	.																							.	.	.	.	.
Template Conservation																												.																			.	.																							.	.	.	.	.
Template Sequence		P	V	Y	L	L	V	S	N	P	T	H	I	P	Y	S	G	I	H	F	R	S	K	L	Q	N	K	.	Q	S	A	T	Y	T	L	S	I	E	I	E	T	Q	E	K	K	P	.	.	I	K	V	K	T	Y	L	Q	A	P	N	G	S	I	A	D	T	S	E	K	I	F	.	.	.	.	.	V	L	C	F	L	S
Template Known Secondary structure										S	S	B			T	T										T	T	.	T											B		S			S		.	.										T	T	S											.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																												.																			.	.																							.	.	.	.	.
Template SS confidence
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.		.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.			.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.						.	.	.	.	.	240
		278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.		.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.
Query SS confidence																																																.
Query Sequence		F	T	V	E	Q	P	Q	Q	W	S	A	E	S	P	Y	L	Y	H	L	V	M	T	L	K	D	A	N	G	N	V	L	E	V	V	P	Q	R	V	G	F	R	D	I	K	V	R	.	D	G	L	F	W	I	N	N	R	Y	V	M	L	H	G	V	N	R	H	D	N	D	H	R	K	G	R	A	V	G	M	D	R
Query Conservation																																																.
Alig confidence																										.																						.
Template Conservation																										.
Template Sequence		G	S	I	R	K	P	L	L	W	S	P	D	S	P	N	V	Y	T	L	I	C	Q	L	T	.	R	D	N	K	I	L	D	E	C	R	L	P	V	G	F	R	Q	L	E	F	N	P	V	S	G	F	L	L	N	G	K	S	L	K	I	K	G	V	C	D	H	H	T	V	G	A	V	G	A	A	V	P	D	D	L
Template Known Secondary structure						S			B	B		S	S	S	B											.		T	T												B							T	T	T					T	T												S			G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure																										.
Template SS confidence
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	E	K	D	L	Q	L	M	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	T	A	H	Y	P	N	D	P	R	F	Y	E	L	C	D	I	Y	G	L	F	V	M	A	E	T	D	V	E	S	H	G	F	A	N	V	G	D	I	S	R	I	T	D	D	P	Q	W	E	K	V	Y	V	E	R	I	V	R	H	I	H	A	Q	K
Query Conservation
Alig confidence																																																			.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.	.	.	.
Template Sequence		L	H	Y	R	L	K	L	L	K	D	M	G	C	N	A	I	R	T	S	H	N	P	F	S	P	A	F	Y	N	L	C	D	T	M	G	I	M	V	L	N	E	G	L	D	G	W	N	Q	P	.	.	.	.	.	K	A	A	D	D	Y	G	N	Y	F	D	E	W	W	Q	K	D	M	T	D	F	I	K	R	D	R
Template Known Secondary structure												T	T							T	T	S														T									S	S	S	S	S		.	.	.	.	.	S	S	T	T	S	G	G	G	T																	T
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.						.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.			.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.			.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.																																							.	.
Query SS confidence																					.	.																																							.	.
Query Sequence		N	H	P	S	I	I	I	W	S	L	G	N	E	S	G	Y	G	C	N	.	.	I	R	A	M	Y	H	A	A	K	A	L	D	D	T	R	L	V	H	Y	E	E	D	R	D	A	E	V	V	D	I	I	S	T	M	Y	T	R	V	.	.	P	L	M	N	E	F	G	E	Y	P	H	P	K	P	R	I	I	C	E
Query Conservation																					.	.																																							.	.
Alig confidence																					.	.																				.																			.	.
Template Conservation																																										.
Template Sequence		N	H	P	S	I	I	M	W	S	I	G	N	E	V	T	G	A	T	P	E	I	Q	H	N	L	V	S	L	F	H	Q	L	D	P	D	R	P	V	T	Q	.	G	G	T	D	P	N	Y	L	D	I	I	G	F	N	G	N	G	E	E	I	G	E	L	E	H	F	H	K	N	Y	P	T	L	C	A	I	A	T	E
Template Known Secondary structure		T		T	T									S		S	S																		T	T	S					.		T							S						G	G	G	G	S	T	T										T	T	S					S	S
Template Predicted Secondary structure																																										.
Template SS confidence
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.		440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.
		513	.	.	.																																																							.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	A	H	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	G	N	G	P	G	G	L	T	E	Y	Q	N	V	F	Y	K	H	D	C	I	Q
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	P	H	T	Y	Q	T	R	G	V	Y	R	S	Q	T	Q	W	R	R	R	D	F	P	A	P	W	E	F	K	H	R	V	F	P	I	P	D	L	T	E	K	E	C	F	P	E	E	S	D	Y	P	Y	Y	Q	S	S	Y	D	N	A	S	V	R	I	S	A	R	K	S	W	Q	R	T	C	S	F	P	W	L	M
Template Known Secondary structure				B	B				T	T				S	S								S			T	T			G	G	G	S						S	S	S	S		S		G	G	G	G	G		T	T				S	S	S				S	S														T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		491	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570
		539	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.			600	.	.	.	.	.	.	.	.	.						610	.
Predicted Secondary structure																																																															.	.											.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.											.	.	.	.	.
Query Sequence		G	H	Y	V	W	E	W	C	D	H	G	I	Q	A	Q	D	D	H	G	N	V	W	Y	K	F	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N	N	Y	N	F	C	L	D	G	L	I	Y	S	D	Q	T	P	G	P	G	L	K	E	Y	K	Q	V	I	.	.	A	P	V	K	I	H	A	R	D	L	.	.	.	.	.	T	R
Query Conservation																																																															.	.											.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.																					.	.											.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template Sequence		G	E	F	R	W	G	S	F	D	Y	L	G	E	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	P	Q	R	C	G	N	F	.	.	G	I	I	D	I	A	A	I	P	K	D	A	Y	F	L	Y	Q	S	L	W	T	D	K	P	M	V	H	L	L	P	H	W	T	H	P	G	K	E	G
Template Known Secondary structure						B		S	B			B	B	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T		S	B		S		.	.		S	B		T	T	S		B														S							S		S			T	T		B	T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template SS confidence
		579	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	600	.			.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640
		612	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Query Sequence		G	E	L	K	V	E	N	K	L	W	F	T	T	L	D	D	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	H	A	E	V	R	A	E	G	E	T	L	A	T	Q	Q	I	K	L	R	D	V	A	P	N	S	E	A	P	L	Q	I	T	.
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Alig confidence							.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.											.
Template Conservation							.	.	.																																																										.	.	.	.
Template Sequence		K	T	I	P	V	.	.	.	V	I	Y	T	N	C	D	A	V	E	L	F	I	N	N	V	S	L	G	S	K	P	Y	T	G	E	Q	L	I	W	L	V	P	Y	S	P	G	K	I	E	A	R	G	I	K	K	G	K	I	V	A	T	D	C	Y	Q	S	.	.	.	.	A	E	A	P	H	S	V	A	L	A	S
Template Known Secondary structure		S					.	.	.					S	S	S							T	T									S	S	S								B		S	S									T	T											.	.	.	.			S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.																																																										.	.	.	.
Template SS confidence
		641	.	.	.	.				.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.					.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.
						663	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.					.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																			.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																																			.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	L	P	Q	L	D	A	R	E	A	F	L	N	I	T	V	T	K	D	S	R	T	R	Y	S	E	A	G	H	P	I	A	T	Y	Q	.	.	.	.	F	P	L	K	E	N	T	A	Q	P	V	P	F	A	P	N	N	A	R	P	L	T	L	E	D	D	R	L	S	C	T	V	R	G	Y	N
Query Conservation		.	.	.	.																																			.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																			.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	K	Y	S	V	K	A	G	S	D	E	V	I	R	I	E	I	D	I	T	D	K	N	G	I	P	C	P	Y	A	S	N	E	L	S	F	H	V	S	G	P	L	R	L	L	G	V	D	N	G	N	P	T	D	M	F	P	Y	Q	Q	P	H	C	R	C	F	R	G	K	C	V	V	L	L	Q	S	D	E
Template Known Secondary structure		S		S	B			T	T	S													T	T	S		B		T	T											S	S											T	T					T	T	S	S					B	T	T										S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		714	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.