Job Description P06864 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 596 % Identity 23% Template c3fn9B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:putative beta-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of putative beta-galactosidase from bacteroides2 fragilis Resolution 2.70 Å

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		38	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	S	L	F	L	P	L	S	G	Q	W	N	F	H	F	F	D	H	P	L	Q	V	P	E	A	F	T	S	E	L	M	A	D	W	G	H	I	T	V	P	A	M	W	Q	M	E	G	H	G	K	L	Q	Y	T	D	E	G	F	P	F	P	I	D	V	P	F	V	P	S	D	N	P	T	G	A	Y	Q	R	I	F
Query Conservation
Alig confidence																																.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	R	Q	V	T	A	F	N	T	G	W	Q	F	K	K	G	P	F	A	T	D	P	M	R	A	A	S	Q	W	D	.	G	K	W	E	T	V	E	I	P	H	T	W	N	A	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	M	Q	V	Q	S	G	S	F	Y	E	G	A	G	Y	Y	R	K	T	Q
Template Known Secondary structure			S							S	S										S	S									T	.	S							S	S			S		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	S	S	S	S					S
Template Predicted Secondary structure																																.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		23	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.		.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.															.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.		170	.	.	.	.	.	.	.	.	.			180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.											.	.
Query SS confidence																																																						.											.	.
Query Sequence		T	L	S	D	G	W	Q	G	K	Q	T	L	I	K	F	D	G	V	E	T	Y	F	E	V	Y	V	N	G	Q	Y	V	G	F	S	K	G	S	R	L	T	A	E	F	D	I	S	A	M	V	K	T	G	.	D	N	L	L	C	V	R	V	M	Q	.	.	W	A	D	S	T	Y	V	E	D	Q	D	M	W	W	S
Query Conservation																																																						.											.	.
Alig confidence																																																						.											.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	F	P	H	D	L	E	G	K	R	V	F	L	R	F	E	G	V	G	A	C	A	E	V	Y	V	N	G	K	L	A	G	T	H	K	G	G	Y	S	A	F	A	C	E	I	G	T	A	L	K	L	G	A	E	N	E	I	I	V	K	A	D	N	K	A	R	P	D	V	I	P	V	N	Q	N	L	F	G	V	Y
Template Known Secondary structure					G	G	G	T	T								S			B	S							S	S	S								T	T	S							G	G	G			T	T														B	T	T	B	S	S		S	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		195	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.								.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.
Query Sequence		A	G	I	F	R	D	V	Y	L	V	G	K	H	L	T	H	I	N	D	.	.	.	.	.	.	.	F	T	V	R	T	D	F	D	E	A	Y	C	D	A	T	L	S	C	E	V	V	L	E	N	L	A	A	S	P	V	V	T	T	L	E	Y	T	L	F	D	G	E	R	V	V	H	S	S	A	I	D	H	.	.
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.						.																																															.	.
Template Conservation																																	.
Template Sequence		G	G	I	Y	R	P	V	W	L	I	V	T	E	Q	N	N	I	T	V	T	D	C	A	S	P	G	V	Y	I	T	Q	.	K	D	V	S	K	K	S	A	D	I	T	V	K	V	K	L	D	N	A	G	L	Q	P	A	A	V	T	L	E	N	T	I	Y	T	Q	E	G	Q	K	V	G	T	H	S	R	S	F	D
Template Known Secondary structure			B			S									S					S		S	T	T			S						.		S		S	S	S														S	S	S													T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																	.
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.		.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.		.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.		.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.																																				.
Query SS confidence																									.																																				.
Query Sequence		L	A	I	E	K	L	T	S	A	S	F	A	F	T	V	E	Q	P	Q	Q	W	S	A	.	E	S	P	Y	L	Y	H	L	V	M	T	L	K	D	A	N	G	N	V	L	E	V	V	P	Q	R	V	G	F	R	D	I	K	V	R	.	D	G	L	F	W	I	N	N	R	Y	V	M	L	H	G	V	N	R	H	D
Query Conservation																									.																																				.
Alig confidence																									.														.																						.
Template Conservation																																							.
Template Sequence		L	S	P	Q	G	T	Q	T	Y	L	S	T	F	K	L	K	N	P	H	L	W	Q	G	R	K	D	P	Y	L	Y	K	V	V	C	R	L	M	.	A	D	G	K	V	I	D	E	V	V	Q	P	L	G	V	R	K	Y	E	I	V	A	G	K	G	F	F	L	N	G	E	K	Y	S	M	Y	G	V	T	R	H	Q
Template Known Secondary structure				S	S	S												S						G	G	G													.		T	T																			T	T	T					T	T												S
Template Predicted Secondary structure																																							.
Template SS confidence
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.		.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	D	H	R	K	G	R	A	V	G	M	D	R	V	E	K	D	L	Q	L	M	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	T	A	H	Y	P	N	D	P	R	F	Y	E	L	C	D	I	Y	G	L	F	V	M	A	E	T	D	V	E	S	H	G	F	A	N	V	G	D	I	S	R	I	T	D	D	P	Q	W	E	K	V
Query Conservation
Alig confidence																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	W	W	G	L	G	S	A	L	K	N	E	H	H	D	F	D	L	A	A	I	M	D	V	G	A	T	T	V	R	F	A	H	Y	Q	Q	S	D	Y	L	Y	S	R	C	D	T	L	G	L	I	I	W	A	E	I	P	C	V	N	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	T	G	Y	E	T	E	N
Template Known Secondary structure			B	T	T	T	B	T																		T		S					T	T	S														T										B	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.													.	.	.	.	390	.	.	.
		424	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.						.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.							.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.																			.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.																			.
Query Sequence		Y	V	E	R	I	V	R	H	I	H	A	Q	K	N	H	P	S	I	I	I	W	S	L	G	N	E	S	G	Y	G	.	.	.	.	.	C	N	I	R	A	M	Y	H	A	A	K	A	L	D	D	T	R	L	V	H	.	.	.	.	.	.	Y	E	E	D	R	D	A	E	V	V	D	I	I	S	T	M	Y	T	.
Query Conservation																																.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.																			.
Alig confidence																																.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.																			.
Template Conservation
Template Sequence		A	Q	S	Q	L	R	E	L	I	R	Q	S	F	N	H	P	S	I	Y	V	W	G	L	H	N	E	V	Y	Q	P	H	E	Y	T	A	A	L	T	R	S	L	H	D	L	A	K	T	E	D	P	D	R	Y	T	V	S	V	N	G	Y	G	H	M	D	H	P	V	N	L	N	A	D	I	Q	G	M	N	R	Y	F
Template Known Secondary structure													T	T	T		T	T									S			S	S																				T	T	S							S	S	S		S	S		T	T				S	S								B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.
											492	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	V	P	L	M	N	E	F	G	E	Y	P	H	P	K	P	R	I	I	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	G	P	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	E	Y	Q	N	V	F	Y	K	H	D	C	I	Q	G	H
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	W	Y	E	K	K	I	Q	D	I	K	P	W	V	E	Q	L	E	K	D	Y	P	Y	Q	K	L	M	L	T	E	Y	G	A	D	A	N	L	A	H	Q	T	E	Y	L	G	D	A	L	N	W	G	K	P	F	Y	P	E	T	F	Q	T	K	T	H	E	Y	Q	W	S	I	I	K	D	H	P	Y	I	I	A	S
Template Known Secondary structure		T	T	T	B	S		G	G	G													T	T	S												B	T	T				S				S	S			T	T	S	S			B																	T		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		474	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.
		541	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.		.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.				.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.																.	.	.
Query SS confidence																																																.																.	.	.
Query Sequence		Y	V	W	E	W	C	D	H	G	I	Q	A	Q	D	D	H	G	N	V	W	Y	K	F	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N	N	Y	N	F	C	L	D	G	L	I	Y	S	D	Q	.	T	P	G	P	G	L	K	E	Y	K	Q	V	I	A	P	.	.	.	V	K	I	H	A	R	D	L	T	R	G	E	L	K	V
Query Conservation																																																.																.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.																.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	L	W	N	M	F	D	F	A	V	P	M	W	T	R	G	G	V	P	A	R	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	K	G	L	I	T	F	D	R	K	T	K	K	D	S	Y	F	W	Y	K	A	N	W	S	E	E	P	V	L	Y	L	T	Q	R	R	N	A	D	R	E	K	R	T
Template Known Secondary structure				S		S	B										T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	B		T	T	S			B													S	S						S		S	S			B				S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		554	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.																.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.
		617	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	N	K	L	W	F	T	T	L	D	D	Y	T	L	H	A	E	V	R	A	E	G	E	T	L	A	T	Q	Q	I	K	L	R	D	V	A	P	N	S	E	A	P	L	Q	I	T	L	P	Q	L	D	A	R	E	A	F	L	N	I	T	V	T	K	D	S	R	T	R	Y	S	E	A	G	H	P	I	A	T	Y
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.																.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.																.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	A	V	T	V	Y	S	N	I	G	T	P	K	V	Y	L	.	.	.	.	N	G	Q	E	L	S	G	I	R	N	G	Y	T	D	V	.	.	.	.	.	.	H	Y	V	F	D	N	V	S	L	A	D	G	K	N	I	L	K	A	V	V	S	.	.	.	.	.	.	.	.	T	K	G	K	E	Y	T	D	E
Template Known Secondary structure									S	S	S							.	.	.	.	T	T										S	S	T	T	.	.	.	.	.	.											S											.	.	.	.	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.																.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		619	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.					.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.							650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670									.	.	.	.	.	.	.	.	.