Job Description P06864 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 596 % Identity 24% Template c3cmgA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:putative beta-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of putative beta-galactosidase from bacteroides2 fragilis Resolution 1.90 Å

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		39	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	L	F	L	P	L	S	G	Q	W	N	F	H	F	F	D	H	P	L	Q	V	P	E	A	F	T	S	E	L	M	A	D	W	G	H	I	T	V	P	A	M	W	Q	M	E	G	H	G	K	L	Q	Y	T	D	E	G	F	P	F	P	I	D	V	P	F	V	P	S	D	N	P	T	G	A	Y	Q	R	I	F	T
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	Q	D	I	L	L	N	N	N	W	N	F	R	F	S	H	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	Q	G	D	T	R	R	V	D	L	P	H	T	W	N	A	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	A	G	K	I	D	Y	K	R	G	I	G	N	Y	E	K	A	L	Y
Template Known Secondary structure									S							T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T								S	S			T	T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	T		T	T				S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		38	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.												.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.															.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
		119	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.		170	.	.	.	.	.	.	.	.	.		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.											.
Query SS confidence																																																					.											.
Query Sequence		L	S	D	G	W	Q	G	K	Q	T	L	I	K	F	D	G	V	E	T	Y	F	E	V	Y	V	N	G	Q	Y	V	G	F	S	K	G	S	R	L	T	A	E	F	D	I	S	A	M	V	K	T	G	.	D	N	L	L	C	V	R	V	M	Q	.	W	A	D	S	T	Y	V	E	D	Q	D	M	W	W	S	A	G
Query Conservation																																																					.											.
Alig confidence																																																					.											.
Template Conservation
Template Sequence		I	R	P	E	W	K	G	K	R	L	F	L	R	F	D	G	V	N	S	I	A	D	V	F	I	N	R	K	H	I	G	E	H	R	G	G	Y	G	A	F	I	F	E	I	T	D	L	V	K	Y	G	E	K	N	S	V	L	V	R	A	N	N	G	E	Q	L	D	I	M	P	L	V	G	D	F	N	F	Y	G	G
Template Known Secondary structure				G	G	G	T	T	S							S			B	S							T	T									S	S	S							T	T	T	S		T	T	S														S	S	S	S		S	S		S	S					B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.
		197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.							.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.		.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.																																											.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.																																											.
Query Sequence		I	F	R	D	V	Y	L	V	G	K	H	L	T	H	I	N	D	F	T	V	.	.	.	.	.	.	R	T	D	F	D	E	A	Y	C	D	A	T	L	S	C	E	V	V	L	E	N	L	A	A	S	P	V	V	T	T	L	E	Y	T	L	F	D	G	E	R	V	V	.	H	S	S	A	I	D	H	L	A	I	E
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.																																											.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.																									.																		.
Template Conservation																																																				.
Template Sequence		I	Y	R	D	V	H	L	L	I	T	D	E	T	C	I	S	P	L	D	Y	A	S	P	G	V	Y	L	V	Q	E	V	V	S	P	Q	E	A	K	V	C	A	K	V	N	L	S	N	R	A	A	.	D	G	T	A	E	L	Q	V	L	V	T	D	G	T	K	V	I	C	K	E	S	R	N	V	S	L	K	Q	G
Template Known Secondary structure				S									S					S		S	T	T	S		S										S	S														S	S	.	S												T	T														T	T
Template Predicted Secondary structure																																																				.
Template SS confidence
		173	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.		.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.		.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.		.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.																																						.
Query SS confidence																					.																																						.
Query Sequence		K	L	T	S	A	S	F	A	F	T	V	E	Q	P	Q	Q	W	S	A	.	E	S	P	Y	L	Y	H	L	V	M	T	L	K	D	A	N	G	N	V	L	E	V	V	P	Q	R	V	G	F	R	D	I	K	V	R	D	G	.	L	F	W	I	N	N	R	Y	V	M	L	H	G	V	N	R	H	D	N	D	H	R
Query Conservation																					.																																						.
Alig confidence																					.														.																								.
Template Conservation																																			.
Template Sequence		A	D	I	L	E	Q	L	P	L	L	I	Q	K	P	R	L	W	N	G	C	E	D	P	F	M	Y	Q	V	S	I	S	L	H	.	K	D	G	K	Q	I	D	S	V	T	Q	P	L	G	L	R	Y	Y	H	T	D	P	D	K	G	F	F	L	N	G	K	H	L	P	L	H	G	V	C	R	H	Q	D	R	A	E
Template Known Secondary structure														S				B		G	G	G		B											.		T	T																			T	T	T					T	T												S		B	T	T
Template Predicted Secondary structure																																			.
Template SS confidence
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.		.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
		348	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	G	R	A	V	G	M	D	R	V	E	K	D	L	Q	L	M	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	T	A	H	Y	P	N	D	P	R	F	Y	E	L	C	D	I	Y	G	L	F	V	M	A	E	T	D	V	E	S	H	G	F	A	N	V	G	D	I	S	R	I	T	D	D	P	Q	W	E	K	V	Y	V	E	R
Query Conservation
Alig confidence																																																														.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.
Template Sequence		V	G	N	A	L	R	P	Q	H	H	E	E	D	V	A	L	M	R	E	M	G	V	N	A	I	R	L	A	H	Y	P	Q	A	T	Y	M	Y	D	L	M	D	K	H	G	I	V	T	W	A	E	I	P	F	V	G	P	G	G	Y	A	.	.	.	D	K	G	F	V	D	Q	A	S	F	R	E	N	G	K	Q	Q
Template Known Secondary structure		T	B	T																	T	T							T	T	S														T										B			T	T	S	S	.	.	.	S		S				S
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.
Template SS confidence
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390				.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
		428	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.						.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.				.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.																															.	.	.														.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.																															.	.	.														.	.	.	.
Query Sequence		I	V	R	H	I	H	A	Q	K	N	H	P	S	I	I	I	W	S	L	G	N	E	S	G	Y	.	.	.	.	.	G	C	N	I	R	A	M	Y	H	A	A	K	A	L	D	D	T	R	L	V	H	Y	E	E	D	R	D	A	E	V	.	.	.	V	D	I	I	S	T	M	Y	T	R	V	P	L	.	.	.	.
Query Conservation																											.	.	.	.	.																															.	.	.														.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.																															.	.	.														.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	I	E	L	I	R	Q	H	Y	N	H	P	S	I	C	F	W	G	L	F	N	E	L	K	E	V	G	D	N	P	V	E	Y	V	K	E	L	N	A	L	A	K	Q	E	D	P	T	R	P	T	T	S	A	S	N	Q	D	G	N	L	N	F	I	T	E	N	I	A	W	N	R	Y	D	G	W	Y	G	S	T	P
Template Known Secondary structure										T	T		T	T									S			S	S	S	S																		T	T	S										S	G	G	G	G	S	S	S	S							T	T	T	S	S	S		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.
								496	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	M	N	E	F	G	E	Y	P	H	P	K	P	R	I	I	C	E	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	A	M	G	N	G	P	G	G	L	T	E	Y	Q	N	V	F	Y	K	H	D	C	I	Q	G	H	Y	V	W	E	W	C	D	H
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Template Conservation																																																																																	.
Template Sequence		K	T	L	A	T	F	L	D	R	T	H	K	K	H	P	E	L	R	I	G	I	S	E	Y	G	A	G	A	S	I	Y	H	Q	Q	D	S	L	K	Q	P	S	A	S	G	W	W	H	P	E	N	W	Q	T	Y	Y	H	M	E	N	W	K	I	I	A	E	R	P	F	V	W	G	T	F	V	W	N	M	F	D	.
Template Known Secondary structure																T	T													B	T	T				S	S						T	T	S	S			B																	T		T	T							S		S	B		.
Template Predicted Secondary structure																																																																																	.
Template SS confidence
		488	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.
		549	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.					.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.
Query Sequence		G	I	Q	A	Q	D	D	H	G	N	V	W	Y	K	F	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N	N	Y	N	F	C	L	D	G	L	I	Y	S	D	Q	T	P	G	P	G	L	K	E	Y	K	Q	V	I	A	P	.	.	.	.	V	K	I	H	A	R	D	L	T	R	G	E	L	K	V	E	N	K	L	W	F	T	T
Query Conservation																																																							.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.																							.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	G	A	A	H	R	T	E	G	D	R	P	G	I	N	D	K	G	.	.	L	V	T	F	D	R	K	V	R	K	D	A	F	Y	F	Y	K	A	N	W	N	K	Q	E	P	M	I	Y	L	A	E	K	R	C	R	L	R	Y	Q	P	E	Q	T	F	M	A	F	T	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T				T	T	S	T	T						.	.	S	B		T	T	S			B													T	T	S						T	T	T	T							S	S								S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Template SS confidence
													567	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.			.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.
		625	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.						.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.
Query Sequence		L	D	D	Y	T	L	H	A	E	V	R	A	E	G	E	T	L	A	T	Q	Q	I	K	L	R	D	V	.	.	.	.	.	A	P	N	S	E	A	P	L	Q	I	T	L	P	Q	L	D	A	R	E	A	F	L	N	I	T	V	T	K	D	S	R
Query Conservation																													.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.																.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.
Template Sequence		A	P	E	A	E	L	F	V	.	.	.	.	N	G	V	S	C	G	K	Q	K	A	D	T	Y	S	T	V	V	W	K	N	V	K	L	T	S	G	E	N	I	I	R	V	T	T	P	G	K	K	P	L	T	D	E	V	T	V	E	Y	K	E	D
Template Known Secondary structure		S	S							.	.	.	.	T	T										T	T	S											S										S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.
Template SS confidence
		634	.	.	.	.	.	640	.					.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.