Job Description P06864 Confidence 65.96% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 191 Aligned Residues 317 % Identity 14% Template c3clwF_ PDB info PDB header:structural genomics, unknown function Chain: F: PDB Molecule:conserved exported protein; PDBTitle: crystal structure of conserved exported protein from bacteroides2 fragilis Resolution 2.20 Å

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		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.												.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	Y	V	M	L	H	G	V	N	R	H	D	N	D	H	R	K	G	R	A	V	G	M	D	R	V	E	K	D	L	Q	L	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	T	A	H	Y	P	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	E	I	D	N	F	S	A	S	D	A	W	R	C	A	F	I	G	K	N	W	P	Q	E	K	K	E	K	I	A	D	L	L	F	K	R	E	F	D	E	K	G	N	P	I	G	M	A	L	T	N	W	R	V	N	I	G	A	G	S	Y	E	N	R	E	A	K	E	V	D	N	S	W	N	R	T	E	C	F	L
Template Known Secondary structure												T	T	T								S																	B		T	T	S		B		S				S									S	T	T	T	T	T	T	S	S			S	S	S	T	T					S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.							.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.																								.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.																								.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	R	F	Y	E	L	C	D	I	Y	G	L	F	V	M	A	E	T	D	V	E	S	H	G	F	A	N	V	G	D	I	S	R	I	T	D	.	.	.	.	.	.	D	P	Q	W	E	K	V	Y	V	E	R	I	V	R	H	I	H	A	Q	K	N	H	P	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.																								.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.																								.
Template Conservation
Template Sequence		S	P	D	G	K	Y	D	F	T	K	Q	A	G	Q	Q	W	F	M	K	A	A	R	E	R	G	M	N	N	F	L	F	F	T	N	S	A	P	Y	F	M	T	R	S	A	S	T	V	S	T	D	Q	D	C	I	N	L	Q	N	D	K	F	D	D	F	A	R	F	L	V	K	S	A	Q	H	F	R	E	Q	G	F
Template Known Secondary structure			T	T	S		B		T	T	S	S													T	T									S	S			G	G	G	S	S	S	S	S	S	B		S		S	S	S		S	S		T	T																			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	I	I	I	W	S	L	G	N	E	S	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	C	N	I	R	A	M	Y	H	A	A	K	A	L	D	D	T	R	L	V	H	Y	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	V	N	Y	I	S	P	N	N	E	P	N	G	Q	W	H	A	N	S	F	Q	E	G	S	F	A	T	K	A	D	L	Y	R	M	V	E	E	L	D	K	A	I	S	E	A	Q	I	D	T	K	I	L	I	P	E	V	G	D	M	K	Y	L	F	E	I	D	S	I	A	K	T	P	D	D	I	I	H	S	M	F
Template Known Secondary structure										S		T	T	S		G	G	G			S	S		B																							T		S									S	S	G	G	G	G	S				S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
										477	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.		490	.	.												.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.						.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.														.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.														.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	D	R	D	A	E	V	V	D	I	I	S	T	M	.	Y	T	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	L	M	N	E	F	G	E	Y	P	H	P	K	P	R	I	I	C	E	Y	A	.	.	.	.	.	H	A	M	G	N	G	P	G	G	L	T	E	Y	Q	N	V	F
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.														.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.														.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	K	D	G	Q	Y	S	V	L	K	F	K	N	L	F	N	C	V	A	A	H	D	Y	W	S	A	Y	P	A	T	L	L	V	D	I	R	N	R	I	H	K	E	L	S	A	N	G	H	N	T	K	F	W	A	S	E	Y	C	I	L	E	K	N	E	E	I	T	M	P	A	S	P	E	R	S	I	N	L	G	L
Template Known Secondary structure		S	T	T	S	T	T			T	T		T	T										T	T		S	S	S																	T	T	S	S																T	T	T		S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		532	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.						590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.														.	.	.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.	.	.														.	.	.	.
Query Sequence		Y	K	H	D	C	I	Q	G	H	Y	V	W	E	W	C	D	H	G	I	Q	A	Q	D	D	H	G	N	V	W	Y	K	F	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N	N	Y	N	F	C	L	D	G	L	I	Y	S	D	Q	T	P	G	.	.	.	.	.	P	G	L	K	E	Y	K	Q	V	I	A	P	V	.	.	.	.
Query Conservation																																																												.	.	.	.	.														.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.														.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	I	I	H	N	D	L	T	L	A	N	A	S	A	W	Q	W	W	T	A	V	S	L	G	E	D	V	P	I	Q	L	L	P	L	E	G	S	N	G	L	S	L	Q	Y	D	G	E	I	S	T	T	K	M	L	W	T	T	A	N	Y	S	F	F	V	R	P	G	M
Template Known Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	S			S							S			S	S	S	S	S	S							T	T			S	G	G	G	G	T																		T	T	S		T	T
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		360	.	.										.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430
																							603	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640														.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	I	H	A	R	D	L	T	R	G	E	L	K	V	E	N	K	L	W	F	T	T	L	D	D	Y	T	L	H	A	E	V	R	A	E	G	E	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	T	Q	Q	I	K	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.
Template Sequence		K	R	I	A	I	K	P	T	Y	K	I	S	D	L	E	A	A	T	S	L	M	I	S	S	Y	T	D	G	K	E	V	V	T	V	A	I	N	Y	.	.	.	.	S	K	E	N	Q	V	I	S	L	N	C	D	H	A	Q	K	G	K	V	Y	L	T	T	I	D	K	N	L	R	Y	M	G	E	Q	P	L	K	K
Template Known Secondary structure									S	S								T	T	S									S	S										.	.	.	.	S	S	S									T	T											T	T											T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.
Template SS confidence
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.					.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.
		649	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	D	V	A	P	N	S	E	A	P	L	Q	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	Q	L	P	A	R	S	V	A	T	I	V	V
Template Known Secondary structure						S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		507	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.