Job Description P06864 Confidence 98.18% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 108 Aligned Residues 234 % Identity 18% Template c3ahxC_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: C: PDB Molecule:beta-glucosidase a; PDBTitle: crystal structure of beta-glucosidase a from bacterium clostridium2 cellulovorans Resolution 1.90 Å

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		355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.						.	.	.	380													.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	R	V	E	K	D	L	Q	L	M	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	T	A	H	.	.	.	.	.	Y	P	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	R	F	Y	E	L	C	D	I	Y	G	L	F	V	M	A	E	T	D	V	E	S	H	G	F	A	N	V	G	D	I	S	R	I	T	D	D
Query Conservation																								.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.
Template Conservation																																																																															.	.
Template Sequence		H	R	Y	K	E	D	V	Q	L	L	K	S	L	G	I	K	S	Y	R	F	S	I	A	W	P	R	I	F	P	K	G	F	G	E	I	N	Q	K	G	I	Q	F	Y	R	D	L	I	D	E	L	I	K	N	D	I	E	P	A	I	T	I	Y	H	W	D	L	P	Q	K	L	Q	D	I	G	G	W	A	.	.	N
Template Known Secondary structure														T	T															T	T	S	S	S	S																			T	T									S	S			B					T	T	T	G	G	G	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.
Template SS confidence
		59	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.			.
		418	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.							450	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	Q	W	E	K	V	Y	V	E	R	I	V	R	H	I	H	A	Q	K	N	H	P	S	I	I	I	W	S	L	G	N	E	.	.	.	.	.	.	S	G	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	N	I	R	A	M	Y	H	A	A	K	A	L	D	D	T
Query Conservation																																		.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.										.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.
Template Sequence		P	Q	V	A	D	Y	Y	V	D	Y	A	N	L	L	F	R	E	F	G	D	R	.	.	V	K	T	W	I	T	H	N	E	P	W	V	A	S	Y	L	G	Y	A	L	G	V	H	A	P	G	I	K	D	M	K	M	A	L	L	A	A	H	N	I	L	L	S	H	F	K	A	V	K	A	Y	R	E	L	E	Q	D
Template Known Secondary structure																				T	T	T	.	.																			T	S		S	S	T	T																													T	T		S
Template Predicted Secondary structure																							.	.
Template SS confidence
		137	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.			.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
		470	.	.																																																													.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	L	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	Y	E	E	D	R	D	A	E	V	V	D	I	I	S	T	M
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	Q	I	G	I	T	L	N	L	S	T	C	Y	S	N	S	A	D	E	E	D	I	A	A	A	H	R	S	D	G	W	N	N	R	W	F	L	D	A	A	L	K	G	T	Y	P	E	D	M	I	K	I	F	S	D	T	N	I	M	P	E	L	P	K	E	L	F	T	E	V	F	E	T	S	D	F	L	G	I	N
Template Known Secondary structure		S														S	S	S																T										S	S												T	T							T	T	T	T	T	T	T					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
		490	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	V	P	L	M	N	E	F	G	E	Y	P	H	P	K	P	R	I	I	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	G	P	G	G	L	T	E	Y	Q	N	V	F	Y	K	H
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	Y	T	R	Q	V	V	K	N	N	S	E	A	F	I	G	A	E	S	V	A	M	D	N	P	K	T	E	M	G	W	E	I	Y	P	Q	G	L	Y	D	L	L	T	R	I	H	R	D	Y	G	N	I	D	L	Y	I	T	E	N	G	A	A	F	N	D	M	V	N	R	D	G	K	V	E	D	E	N	R	L	D
Template Known Secondary structure												T	T	S	G	G	G								S		B		T	T			B			T														S																				T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.
		535	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.					.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.						.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Query Sequence		D	C	I	Q	G	H	Y	V	W	E	W	C	D	H	G	I	Q	A	Q	D	D	H	G	N	V	W	Y	K	F	.	.	.	.	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N	N	Y	N	F	C	L	D	G	L	I	Y	S	D	.	.	.	.	.	Q	T	P	G	P	G	L	K	E	Y	K	Q	V	I	A
Query Conservation																															.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.															.									.	.	.	.													.										.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.															.																									.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	Y	L	Y	T	H	F	A	A	A	L	S	A	I	E	.	A	G	V	P	L	K	G	Y	Y	I	W	S	F	M	D	N	F	E	W	A	E	G	Y	E	.	K	R	F	G	I	V	H	V	N	Y	K	T	Q	E	R	T	I	K	K	S	A	Y	W	Y	K	E	L	I	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.															.	T	T											S	B					G	G	G	G	G	G	.	S				S					T	T	T						B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.															.																									.
Template SS confidence
								375	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.		.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.		.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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