Job Description P06864 Confidence 99.74% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 48 Aligned Residues 242 % Identity 17% Template c2zunB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:458aa long hypothetical endo-1,4-beta-glucanase; PDBTitle: functional analysis of hyperthermophilic endocellulase from2 the archaeon pyrococcus horikoshii Resolution 2.00 Å

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		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.							330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.			.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.										.	.	.	.	.	380
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.																							.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.																							.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.
Query Sequence		I	K	V	R	D	G	L	F	W	I	.	.	.	.	.	.	N	N	R	Y	V	M	L	H	G	V	N	R	H	D	N	D	H	R	K	G	R	A	.	.	V	G	M	D	R	V	E	K	D	L	Q	L	M	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	H	Y	P	N	D	.	.
Query Conservation												.	.	.	.	.	.																							.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.																							.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	E	V	R	G	D	T	I	Y	M	I	N	V	T	S	G	E	E	T	P	I	H	L	F	G	V	N	W	F	G	F	E	T	P	N	H	V	V	H	G	L	W	K	R	N	W	E	D	M	L	L	Q	I	K	S	L	G	F	N	A	I	R	L	P	F	C	T	E	S	V	K	P	G	T	Q	P	I	G	I	D
Template Known Secondary structure						T	T							T	T	T																T	T	S	T	T		S		T	T	T	T	T	S												T	T										G	G	G	G	S	T	T					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		41	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
																		381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	R	F	Y	E	L	C	D	I	Y	G	L	F	V	M	A	E	T	D	V	E	S	H	G	F	A	N	V	G	D	I	S	R	I	T	D	D	P	Q	W	E	K	V	Y	V	E	R	I	V	R	H	I	H	A	Q	K	N	H	P	S	I	I	I	W
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.
Template Sequence		Y	S	K	N	P	D	L	R	G	L	D	S	L	Q	I	M	E	K	I	I	K	K	A	G	D	L	G	I	F	V	L	L	D	Y	.	.	.	.	H	R	I	G	C	T	H	I	E	P	L	W	Y	T	E	D	F	S	E	E	D	F	I	N	T	W	I	E	V	A	K	R	F	G	K	Y	W	N	V	I	G	A
Template Known Secondary structure		T	T	T	S	G	G	G	T	T																	T	T								.	.	.	.			S	S	S	S	S			S	S	S		B	T	T	B																	T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.
Template SS confidence
		121	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.					.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.
		445	.	.	.	.	450																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	L	G	N	E	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Y	G	C	N	I	R	A	M	Y	H	A	A	K	A	L	D	D	T	R	L	V	H	Y	E	E	D	R	D	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	L	K	N	E	P	H	S	V	T	S	P	P	A	A	Y	T	D	G	T	G	A	T	W	G	M	G	N	P	A	T	D	W	N	L	A	A	E	R	I	G	K	A	I	L	K	V	A	P	H	W	L	I	F	V	E	G	T	Q	F	T	N	P	K	T	D	S	S	Y	K	W	G	Y	N	A	W	W	G	G	N
Template Known Secondary structure				S	S					S	S		T	T	G	G	G	T	S	S	S	S		B	S	S	S	S		T	T	T	B																	T	T								B	S								T	T	S	T	T	G	G	G			T	T		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
															482	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.																				.	.	.	.	.	.				.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	V	D	I	I	S	T	M	Y	T	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	L	M	N	E	.	.	.	F	G	E	Y	P	H	P	K	P	R	I	I	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	G	P	G	G	L	T	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	M	A	V	K	D	Y	P	V	N	L	P	K	N	K	L	V	Y	S	P	H	V	Y	G	P	D	V	Y	N	Q	P	Y	F	G	P	A	K	G	F	P	D	N	L	P	D	I	W	Y	H	H	F	G	Y	V	K	L	E	L	G	Y	S	V	V	I	G	E	F	G	G	K	Y	G	H	G	G	D	P	R	D	V
Template Known Secondary structure			T	T	T	T	T	S				S		T	T	T						B				T	T	T				G	G	G	S	G	G	G	T	T	T	T	T									T	T					T	T						B		B					T	T	S	S	S		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		277	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
		527	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	Q	N	V	F	Y	K	H	D	C	I	Q	G	H	Y	V	W	E	W	C	D	H	G	I	Q	A	Q	D	D	H	G	N	V	W	Y	K	F	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N	N	Y	N	F	C	L	D	G	L	I	Y	S	D	Q	T
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	N	K	L	V	D	W	M	I	E	N	K	F	C	D	F	F	Y	W	S	W	N	P	D	S	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	G	I	L	Q	D	D	W	T
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T							S		S		S			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	T			S	B		T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		357	.															.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.									.	.	.	.	390	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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