Job Description P06864 Confidence 98.16% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 109 Aligned Residues 222 % Identity 25% Template c2z1sA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:beta-glucosidase b; PDBTitle: beta-glucosidase b from paenibacillus polymyxa complexed2 with cellotetraose Resolution 2.46 Å

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		355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.						.	.	.	380	.												.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	R	V	E	K	D	L	Q	L	M	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	T	A	H	.	.	.	.	.	Y	P	N	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	F	Y	E	L	C	D	I	Y	G	L	F	V	M	A	E	T	D	V	E	S	H	G	F	A	N	V	G	D	I	S	R	I	T	D	D	P
Query Conservation																								.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation																																																											.	.
Template Sequence		H	H	F	K	E	D	V	Q	L	M	K	Q	L	G	F	L	H	Y	R	F	S	V	A	W	P	R	I	M	P	A	A	G	I	I	N	E	E	G	L	L	F	Y	E	H	L	L	D	E	I	E	L	A	G	L	I	P	M	.	.	L	T	L	Y	H	W	D	L	P	Q	W	I	E	D	E	G	G	W	T	Q	R
Template Known Secondary structure															T		S													S	S	T	T																					T					.	.					S	S			B						T	T	G	G	G	S	T
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.
Template SS confidence
		61	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.			.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.
		419	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Query Sequence		Q	W	E	K	V	Y	V	E	R	I	V	R	H	I	H	A	Q	K	N	H	P	S	I	I	I	W	S	L	G	N	E	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	C	N	I	R	A	M	Y	H	A	A	K	A	L	D	D	T	.
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Alig confidence																						.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Template Conservation																						.	.
Template Sequence		E	T	I	Q	H	F	K	T	Y	A	S	V	I	M	D	R	F	G	E	R	.	.	I	N	W	W	N	T	I	N	E	P	Y	C	A	S	I	L	G	Y	G	T	G	E	H	A	P	G	H	E	N	W	R	E	A	F	T	A	A	H	H	I	L	M	C	H	G	I	A	S	N	L	H	K	E	K	G	L	T	G
Template Known Secondary structure																		S	S	S	S	.	.		S																	T	S	S		S	T	T																													T	T			S
Template Predicted Secondary structure																						.	.
Template SS confidence
		139	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.			.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
										470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.																																																					.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	R	L	V	H	Y	E	E	D	R	D	A	E	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	D	I	I	S	T	M
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	I	G	I	T	L	N	M	E	H	V	D	A	A	S	E	R	P	E	D	V	A	A	A	I	R	R	D	G	F	I	N	R	W	F	A	E	P	L	F	N	G	K	Y	P	E	D	M	V	E	W	Y	G	T	Y	L	N	G	L	D	F	V	Q	P	G	D	M	E	L	I	Q	Q	P	G	D	F	L	G	I	N
Template Known Secondary structure															S	S	S																T										S	S										G	G	G	G	G	G	G	T	T			T	T									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.
		490	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.			.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	T	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	L	M	N	E	F	G	E	Y	P	H	P	K	.	.	P	R	I	I	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	G	P	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	Y	T	R	S	I	I	R	S	T	N	D	A	S	L	L	Q	V	E	Q	V	H	M	E	E	P	V	T	D	M	G	W	E	I	H	P	E	S	F	Y	K	L	L	T	R	I	E	K	D	F	S	K	G	L	P	I	L	I	T	E	N	G	A	A	M	R	D	E	L	V	N	G	Q	I	E	D	T	G	R	Q
Template Known Secondary structure													S	S	S	S	S									S	S	B		T	T	S		B																T	T	T	T	T	S																	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		297	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
								524	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.						.	.	.	.	.	.	.	590	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																																												.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																																																												.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	L	T	E	Y	Q	N	V	F	Y	K	H	D	C	I	Q	G	H	Y	V	W	E	W	C	D	H	G	I	Q	A	Q	D	D	H	G	N	V	W	Y	K	F	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N	N	Y	N	F	C	L	D	G	L	I	.	.	.	.	.	Y	S	D	Q	T	P	G	P	G	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																																																												.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	Y	I	E	E	H	L	K	A	C	H	R	F	I	E	E	G	G	Q	L	K	G	Y	F	V	W	S	F	L	D	N	F	E	W	A	W	G	Y	S	K	R	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	V	H	I	N	Y	E	T	Q	E	R	T	P	K	Q	S	A
Template Known Secondary structure															T	T	T	T											S	B					G	G	G	G	G	G				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S					T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
		593	.	.	.	.	.	.	600
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	E	Y	K	Q	V	I	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	W	F	K	Q	M	M	A
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		437	.	.	440	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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