Job Description P06864 Confidence 97.66% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 121 Aligned Residues 322 % Identity 12% Template c2w5fB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:endo-1,4-beta-xylanase y; PDBTitle: high resolution crystallographic structure of the2 clostridium thermocellum n-terminal endo-1,4-beta-d-3 xylanase 10b (xyn10b) cbm22-1-gh10 modules complexed with4 xylohexaose Resolution 1.90 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.				.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.
Query Sequence		T	L	S	C	E	V	V	L	E	N	L	A	A	S	P	V	V	T	T	L	E	Y	T	L	F	D	G	E	R	V	V	H	S	S	A	I	D	.	.	.	H	L	A	I	E	K	L	T	S	A	S	F	A	F	T	V	E	Q	P	Q	Q	W	S	A	E	S	P	Y	L	Y	H	L	V	M	T	L	K	D	A	N
Query Conservation																																							.	.	.
Alig confidence																																							.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	Y	K	Y	S	V	F	V	K	H	N	G	T	G	T	E	T	F	K	L	S	V	S	Y	L	D	S	E	T	E	E	E	N	K	E	V	I	A	T	K	D	V	V	A	G	E	W	T	E	I	S	A	K	Y	K	A	P	K	T	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	I	T	L	S	I	T	T	D	S
Template Known Secondary structure													S	S	S													T	T	T															T	T													T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.									S	S
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.										.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
		305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340									.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	N	V	L	E	V	V	P	Q	R	V	G	F	R	D	I	K	V	R	D	G	L	F	W	I	N	N	R	Y	V	M	L	H	G	V	N	.	.	.	.	.	.	.	.	R	H	D	N	D	H	R	K	G	R	A	V	G	M	D	R	V	E	K	D	L	Q	L	M	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	T	A	H
Query Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	D	F	I	F	D	D	V	T	I	T	R	K	G	Y	A	A	N	A	V	L	K	D	M	Y	A	N	Y	F	R	V	G	S	V	L	N	S	G	T	V	N	N	S	S	I	K	A	L	I	L	R	E	F	N	S	I	T	C	E	N
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			S	S					T	T	T	T									T	T	T	T	T													S					S	S
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		167																				.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
																							377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.							.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	P	N	D	P	R	F	Y	E	L	C	D	I	Y	G	L	.	.	.	.	.	.	F	V	M	A	E	T	D	V	E	S	H	G	F	A	N	V	G	D	I	S	R	I	T	D	D	P	Q	W	E	K	V	Y	V	E	R	I	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	M	K	P	D	A	T	L	V	Q	S	G	S	T	N	T	N	I	R	V	S	L	N	R	A	A	S	I	L	N	F	C	A	Q	N	N	I	A	V	R	G	H	T	L	V	W	H	S	Q	T	P	Q	W	F	F	K	D	N	F	Q	D	N	G	N	W	V	S	Q	S	V	M	D	Q	R	L	E	S	Y	I	K
Template Known Secondary structure		T	T	S												T	T							T	T	T										T	T											S	S	S			G	G	G	G	B	T	T	S	S	T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
		430	.	.	.	.	.	.	.	.				.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.			.	470	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Query SS confidence											.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Query Sequence		R	H	I	H	A	Q	K	N	H	.	.	.	P	S	I	I	I	W	S	L	G	N	E	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Y	G	C	N	I	R	A	M	Y	H	A	A	K	A	L	D	D	.	.	T	R	L	V	H	Y
Query Conservation											.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Alig confidence											.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	M	F	A	E	I	Q	R	Q	Y	P	S	L	N	L	Y	A	Y	D	V	V	N	A	A	V	S	D	D	A	N	R	T	R	Y	Y	G	G	A	R	E	P	G	Y	G	N	G	R	S	P	W	V	Q	I	Y	G	D	N	K	F	I	E	K	A	F	T	Y	A	R	K	Y	A	P	A	N	C	K	L	Y	Y	N
Template Known Secondary structure												T	T	S										S		B		S								S	T	T	B			B	S	S	B	T	T	B	B							S	S	T	T													S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.
		475	.	.	.	.	480	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.			.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.																			.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.																			.	.	.	.
Query Sequence		E	E	D	R	D	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	V	D	I	I	S	T	M	Y	T	R	V	P	L	M	N	E	F	G	E	Y	P	H	.	.	P	K	P	R	I	I	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	G	P	G	.	.	.	.
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.																			.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.																			.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	Y	N	E	Y	W	D	H	K	R	D	C	I	A	S	I	C	A	N	L	Y	N	K	G	L	L	D	G	V	G	M	Q	S	H	I	N	A	D	M	N	G	F	S	G	I	Q	N	Y	K	A	A	L	Q	K	Y	I	N	I	G	C	D	V	Q	I	T	E	L	D	I	S	T	E	N	G	K	F	S	L	Q	Q
Template Known Secondary structure			S	S	T	T	S																	T	T													S		S	S	S	T	T																S	S												T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		395	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.
		523	.	.	.	.	.	.	530	.	.										.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	L	T	E	Y	Q	N	V	F	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	H	D	C	I	Q	G	H	Y	V	W	E	W	C	D	H	G	I	Q	A	Q	D	D	H	G	N	V	W	Y	K	F	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N	N	Y	N	F	C	L	D	G	L	I	Y	S	D	Q	T	P	G	P	G	L	K
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	A	D	K	Y	K	A	V	F	Q	A	A	V	D	I	N	R	T	S	S	K	G	K	V	T	A	V	C	V	W	G	P	N	D	A	N	T	W	L	G	S	Q	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	L	L	F	N	A	N	N	Q	P	K	P	A	Y	N
Template Known Secondary structure																						S	S								S	S	S	S	T	T	S		T	T		G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S	B		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		475	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.
		594	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Y	K	Q	V
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	V	A	S	I
Template Known Secondary structure					T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		534	.	.	.	.