Job Description P06864 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 685 % Identity 16% Template c2vzvB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:exo-beta-d-glucosaminidase; PDBTitle: substrate complex of amycolatopsis orientalis exo-2 chitosanase csxa e541a with chitosan Resolution 2.70 Å

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		36	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70			.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.
Query SS confidence																																					.	.
Query Sequence		E	T	S	S	L	F	L	P	L	S	G	Q	W	N	F	H	F	F	D	H	P	L	Q	V	P	E	A	F	T	S	E	L	M	A	D	.	.	W	G	H	I	T	V	P	A	M	W	Q	M	E	G	H	G	K	L	Q	Y	T	D	E	G	F	P	F	P	I	D	V	P	F	V	P	S	D	N	P	T	G	A	Y
Query Conservation																																					.	.
Alig confidence																							.														.	.
Template Conservation																							.
Template Sequence		G	A	A	A	G	N	A	T	P	I	P	G	Y	V	I	Q	S	S	A	Q	V	.	S	D	D	S	A	V	S	K	P	G	F	P	T	S	G	W	Y	P	V	S	S	R	S	T	V	Y	A	G	L	L	Q	N	G	K	Y	A	D	P	F	Y	S	T	N	M	Q	N	V	P	A	A	Q	F	S	V	P	W	W	Y
Template Known Secondary structure					T	T													G	G	G		.	S		G	G	G	T	T	S	T	T				T	T						S	S										T	T		S			T	T	S	T	T	G	G	G	G	S		S	G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																							.
Template SS confidence
		45	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.		.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.
		114	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150				.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.																																								.
Query SS confidence																																							.	.	.																																								.
Query Sequence		Q	R	I	F	T	L	S	D	G	W	Q	G	K	Q	T	L	I	K	F	D	G	V	E	T	Y	F	E	V	Y	V	N	G	Q	Y	V	G	F	.	.	.	S	K	G	S	R	L	T	A	E	F	D	I	S	A	M	V	K	T	G	D	N	L	L	C	V	R	V	M	Q	W	A	D	S	T	Y	V	E	D	Q	.
Query Conservation																																							.	.	.																																								.
Alig confidence										.	.																												.	.	.																																								.
Template Conservation										.	.
Template Sequence		R	T	D	L	N	V	D	D	.	.	T	S	S	R	T	Y	L	D	F	S	G	V	L	S	K	A	D	V	W	V	N	G	T	K	V	A	T	K	D	Q	V	N	G	A	Y	T	R	H	D	L	D	I	T	A	Q	V	H	T	G	V	N	S	V	A	F	K	V	Y	P	N	D	P	N	R	D	L	S	M	G	W
Template Known Secondary structure								S		.	.	T	T	S											S	B						T	T						T	T	T	S	B	S	T	T								T	T	T			S														T	T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure										.	.
Template SS confidence
		124	.	.	.	.	.	130	.			.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.
			190	.	.	.	.						.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.
Predicted Secondary structure		.						.	.	.	.	.
Query SS confidence		.						.	.	.	.	.
Query Sequence		.	D	M	W	W	S	.	.	.	.	.	A	G	I	F	R	D	V	Y	L	V	G	K	H	L	T	H	I	N	D	F	T	V	R	T	D	F	D	E	A	Y	C	D	A	T	L	S	C	E	V	V	L	E	N	L	A	A	S	P	V	V	T	T	L	E	Y	T	L	F	D	G	E	R	V	V	H	S	S	A	I
Query Conservation		.						.	.	.	.	.
Alig confidence		.						.	.	.	.	.																																																										.	.	.
Template Conservation																																																																						.	.	.
Template Sequence		I	D	W	A	Q	T	P	P	D	Q	N	M	G	I	V	R	D	V	L	V	R	R	S	G	A	V	A	L	R	S	A	H	V	I	Q	K	L	N	S	A	L	D	H	A	D	L	T	V	K	A	D	V	R	N	D	S	A	N	A	V	Q	T	T	V	A	G	T	V	.	.	.	A	G	K	P	I	S	Q	T	V
Template Known Secondary structure		T	T	T	S				T	T	T	T					S								S	S														T	T	S	S														S	S	S											.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.
Template SS confidence
		202	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.				270	.	.	.	.	.	.	.	.
		264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.				.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.						.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.																																				.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.																																				.	.	.	.	.
Query Sequence		D	H	L	A	I	E	K	L	T	S	A	S	F	A	F	T	V	E	Q	P	Q	Q	W	S	A	.	.	.	E	S	P	Y	L	Y	H	L	V	M	T	L	K	D	A	N	G	N	V	L	E	V	V	P	Q	R	V	G	F	R	D	I	K	V	R	.	.	.	.	.	D	G	L	F	W	I	N	N	R	Y	V	M
Query Conservation																											.	.	.																																				.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.														.																						.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.
Template Sequence		S	L	A	A	K	E	R	K	T	V	T	F	P	L	V	G	L	D	R	P	N	V	W	W	P	A	G	M	G	G	Q	H	R	Y	D	L	D	L	T	A	S	.	V	G	G	T	P	S	D	A	A	K	S	K	F	G	V	R	D	V	K	A	T	L	N	S	S	G	G	R	Q	Y	S	V	N	G	K	P	L	L
Template Known Secondary structure					T	T														S							T	T	S	S													.		T	T																					T	T	S							T	T
Template Predicted Secondary structure																																											.
Template SS confidence
		279	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
		336	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.		.	410	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.
Query SS confidence																																																																											.
Query Sequence		L	H	G	V	N	R	H	D	N	D	H	R	K	G	R	A	V	G	M	D	R	V	E	K	D	L	Q	L	M	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	T	A	H	Y	P	N	D	P	R	F	Y	E	L	C	D	I	Y	G	L	F	V	M	A	E	T	D	V	E	S	H	G	F	A	N	V	.	G	D	I	S	R	I
Query Conservation																																																																											.
Alig confidence									.	.	.																																																																.
Template Conservation									.	.	.
Template Sequence		I	R	G	G	G	Y	T	.	.	.	P	D	L	F	L	R	W	N	E	T	A	A	A	D	K	L	K	Y	V	L	N	L	G	L	N	T	V	R	L	E	G	H	I	E	P	D	E	F	F	D	I	A	D	D	L	G	V	L	T	M	P	G	W	E	C	C	D	K	W	E	G	Q	V	N	G	E	E	K	G	E
Template Known Secondary structure									.	.	.			T	T																		T	T								S															T									S	S	S	G	G	G	T	T	T		T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.
Template SS confidence
		358	.	360	.	.	.	.				.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
		415	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460		.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	D	D	P	Q	W	E	K	V	Y	V	E	R	I	V	R	H	I	H	A	Q	K	N	H	P	S	I	I	I	W	S	L	G	N	E	S	G	Y	G	C	N	I	R	A	M	Y	.	H	A	A	K	A	L	D	D	T	R	L	V	H	Y	E	E	D	R	D	A	E	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	W	V	E	S	D	Y	P	I	A	K	A	S	M	F	S	E	A	E	R	L	R	D	H	P	S	V	I	S	F	H	I	G	S	D	F	A	P	D	R	R	I	E	Q	G	Y	L	D	A	M	K	A	A	D	F	L	L	P	V	I	P	A	A	S	A	R	P	S	P	I	T	G	A	S	G	M	K	M	N	G
Template Known Secondary structure					T	T																	T	T		T	T	B					S		S	S	S																	T	T			S				S		S	S	S			B	T	T	T	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.
				484	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	D	I	I	S	T	M	Y	T	R	V	P	L	M	N	E	F	G	E	Y	P	H	P	K	P	R	I	I	C	E	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	A	M	G	N	G	P	G	G	L	T	E	Y	Q
Query Conservation		.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.										.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.
Template Sequence		P	Y	D	Y	V	P	P	V	Y	W	Y	.	.	.	.	D	K	S	Q	K	D	R	G	G	A	W	S	F	N	S	A	T	S	A	G	V	D	I	P	T	M	D	T	L	K	R	M	M	S	A	S	E	L	D	T	M	W	K	N	P	S	A	K	Q	Y	H	R	S	S	S	D	T	F	G	N	L	K	L	F	G
Template Known Secondary structure				S				G	G	G	G	G	.	.	.	.			S		T	T	S		S	S	S									S	B												S												T	T	S	B		T	T	S		S	S	G	G	G	S	B
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.
Template SS confidence
		515	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.					.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590
																529	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	V	F	Y	K	H	D	C	I	Q	G	H	Y	V	W	E	W	C	D	H	G	I	Q	A	Q	D	D	H	G	N	V	W	Y	K	F	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N	N	Y	N	F	C	L	D	G	L	I	Y	S	D	Q	T	P	G	P	G	L	K	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.
Template Conservation																																															.	.
Template Sequence		D	A	L	T	K	R	Y	G	A	S	A	N	L	N	D	F	V	R	K	A	Q	L	S	Q	Y	E	N	V	R	A	E	F	E	S	H	S	R	N	Y	T	D	S	T	N	P	.	.	S	T	G	L	I	Y	W	M	L	N	S	P	W	T	S	L	H	W	Q	L	F	D	A	Y	M	D	Q	N	G	A	Y	Y	G
Template Known Secondary structure													S																											T	T		S	S	S		.	.							S		S			S	S	S		S	B	S		S	B		T	T			B
Template Predicted Secondary structure																																															.	.
Template SS confidence
		591	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.			.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.
		595	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.		.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.			.	.	.	.	.	.	.	670	.
Predicted Secondary structure																																												.																											.	.
Query SS confidence																																												.																											.	.
Query Sequence		Y	K	Q	V	I	A	P	V	K	I	H	A	R	D	L	T	R	G	E	L	K	V	E	N	K	L	W	F	T	T	L	D	D	Y	T	L	H	A	E	V	R	A	.	E	G	E	T	L	A	T	Q	Q	I	K	L	R	D	V	A	P	N	S	E	A	P	L	Q	I	T	.	.	L	P	Q	L	D	A	R	E	A
Query Conservation																																												.																											.	.
Alig confidence														.																.														.																											.	.
Template Conservation														.																.
Template Sequence		A	K	K	A	N	E	P	L	H	I	Q	Y	.	S	H	D	N	R	S	V	V	V	I	N	Q	T	S	N	.	A	V	S	G	L	T	A	T	T	K	L	Y	N	L	D	G	T	E	K	Y	S	N	T	K	T	G	L	S	V	G	A	L	G	A	K	A	T	A	V	T	V	P	A	V	S	G	L	S	T	T	Y
Template Known Secondary structure						T		S						.		T	T	T									S	S	S	.														T	T	S															S	S	S												T	T			S
Template Predicted Secondary structure														.																.
Template SS confidence
		669	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680		.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.		.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.
		672	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.										.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	L	N	I	T	V	T	K	D	S	R	T	R	Y	S	E	A	G	H	P	I	A	T	Y	Q	F	P	L	K	E	N	T	A	Q	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	F	A	P	N	N	A	R	P	L	T	L	E	D	D	R	L	S	C	T	V	R	G	Y	N	F	A	I	T	F	S
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	A	K	N	V	L	T	D	S	S	G	K	E	V	S	R	N	V	Y	W	L	S	T	K	A	D	T	L	N	W	G	G	S	D	W	Y	Y	T	P	Q	S	A	F	A	D	L	S	G	L	N	N	L	G	Q	S	A	V	G	A	T	A	N	S	V	A	G	A	D	G	T	T	T	T	T	V	T
Template Known Secondary structure										T	T													S	S						G	G	G			S	S											G	G	G	G	G																T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		747	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.