Job Description P06864 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 661 % Identity 19% Template c2je8B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:beta-mannosidase; PDBTitle: structure of a beta-mannosidase from bacteroides2 thetaiotaomicron Resolution 1.7 Å

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		36	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	T	S	S	L	F	L	P	L	S	G	Q	W	N	F	H	F	F	D	H	P	L	Q	V	P	E	A	F	T	S	E	L	M	A	D	W	G	H	I	T	V	P	A	M	W	Q	M	E	G	H	G	K	L	Q	Y	T	D	E	G	F	P	F	P	I	D	V	P	F	V	P	S	D	N	P	T	G	A	Y	Q	R
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template Sequence		N	D	T	S	E	V	M	L	L	D	T	G	W	E	F	S	Q	S	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	K	W	M	P	A	T	V	P	G	T	V	H	Q	D	L	I	S	H	E	L	L	P	N	P	F	Y	G	M	N	E	K	K	I	.	Q	W	V	E	N	E	D	W	E	Y	R	T
Template Known Secondary structure			S	S								S	S						T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S	S										T	T	S	S			T	T	S	T	T	T	T	G	G	G	.	G	G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template SS confidence
		28	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.														.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.		.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.
		116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.		.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Predicted Secondary structure													.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	F	T	L	S	D	G	W	Q	G	K	.	Q	T	L	I	K	F	D	G	V	E	T	Y	F	E	V	Y	V	N	G	Q	Y	V	G	F	S	K	G	S	R	L	T	A	E	F	D	I	S	A	M	V	K	T	G	D	N	L	L	C	V	R	V	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q
Query Conservation													.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	F	I	V	S	E	E	Q	L	N	R	D	G	I	Q	L	I	F	E	G	L	D	T	Y	A	D	V	Y	L	N	G	S	L	L	L	K	A	D	N	M	F	V	G	Y	T	L	P	V	K	S	V	L	R	K	G	E	N	H	L	Y	I	Y	F	H	S	P	I	R	Q	T	L	P	Q	Y	A	S	N	G	F	N
Template Known Secondary structure											T	S	S							S				S							T	T								B	T	T								G	G	G			S																								S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		94	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.
		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	A	D	S	T	Y	V	E	D	Q	D	M	W	W	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	I	F	R	D	V	Y	L	V	G	K	H	L	T	H	I	N	D	F	T	V	R	T	D	F	D	E	A	Y	C	D	A	T	L	S	C	E	V	V	L	E	N	L	A	A	S
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.
Template Conservation																																																																.
Template Sequence		Y	P	A	D	N	D	H	H	E	K	H	L	S	V	F	S	R	K	A	P	Y	S	Y	G	W	D	W	G	I	R	M	V	T	S	G	V	W	R	P	V	T	L	R	F	Y	D	I	A	T	I	S	D	Y	Y	V	R	Q	L	S	L	T	D	.	E	N	A	R	L	S	N	E	L	I	V	N	Q	I	V	P	Q
Template Known Secondary structure					T	T	S		S	S	S		G	G	G	G	S	B	S		G	G	G	G		B	T	T	B										S								S	S															S	.	S														S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																.
Template SS confidence
		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.		.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290				.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.
Query Sequence		P	V	V	T	T	L	E	Y	T	L	F	D	G	E	R	V	V	H	S	S	A	I	D	H	L	A	I	E	K	L	T	S	A	S	F	A	F	T	V	E	Q	P	Q	Q	W	S	A	E	S	.	.	.	P	Y	L	Y	H	L	V	M	T	L	K	D	A	N	G	N	V	L	E	V	V	P	Q	R	V	G	F	R
Query Conservation																																																			.	.	.
Alig confidence																																																			.	.	.												.
Template Conservation																																																																	.
Template Sequence		K	I	P	A	E	V	R	V	N	V	S	L	N	G	T	T	V	T	E	V	K	Q	Q	V	T	L	Q	P	G	I	N	H	I	T	L	P	A	E	V	T	N	P	V	R	W	M	P	N	G	W	G	T	P	T	L	Y	D	F	S	A	Q	I	A	.	C	G	D	R	I	V	A	E	Q	S	H	R	I	G	L	R
Template Known Secondary structure														T	T														S													S				B			T	T	S	S		B											.		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																	.
Template SS confidence
		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.		.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.
		319	320	.	.	.	.	.	.									.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.			.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.
Query Sequence		D	I	K	V	R	D	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	F	W	I	N	N	R	Y	V	M	L	H	G	V	N	R	H	D	N	D	H	R	K	G	R	A	V	G	M	D	R	V	E	K	D	L	Q	L	M	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	T	.	.	A	H	Y	P	N	D	P	R	F	Y	E	L	C	D
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.																								.																									.	.
Template Conservation																																									.
Template Sequence		T	I	R	V	V	N	E	K	D	K	D	G	E	S	F	Y	F	E	V	N	G	I	P	M	F	A	K	G	A	N	Y	I	P	Q	D	A	L	L	P	.	N	V	T	T	E	R	Y	Q	T	L	F	R	D	M	K	E	A	N	M	N	M	V	R	I	W	G	G	G	T	Y	E	N	N	L	F	Y	D	L	A	D
Template Known Secondary structure											T	T									T	T													S		S	S	G	G	.	G																T	T								T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																									.
Template SS confidence
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370		.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	Y	G	L	F	V	M	A	E	T	D	V	E	S	H	G	F	A	N	V	G	D	I	S	R	I	T	D	D	P	Q	W	E	K	V	Y	V	E	R	I	V	R	H	I	H	A	Q	K	N	H	P	S	I	I	I	W	S	L	G	N	E	S	G	Y	G	C	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	N	G	I	L	V	W	Q	D	F	M	F	A	C	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	P	S	D	P	T	F	L	K	R	V	E	A	E	A	V	Y	N	I	R	R	L	R	N	H	A	S	L	A	M	W	C	G	N	N	E	I	L	E	A	L	K	Y	W	G	F	E	K	K	F	T	P	E	V	Y
Template Known Secondary structure				T								S		B	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.																							T	T		T	T						S		B	S								S			T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		411	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.										.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.
													456	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.						.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.		.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.																					.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.																					.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	R	A	M	Y	H	A	A	K	A	L	D	D	T	R	L	V	H	Y	E	E	D	R	.	.	.	.	.	D	A	E	V	V	D	I	I	S	T	M	Y	T	R	V	P	L	M	N	E	.	F	G	E	Y	P	H	P	K	P	R	I	I	C	E	Y	A	H	A	M	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.																					.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.																					.
Template Conservation
Template Sequence		Q	G	L	M	H	G	Y	D	K	L	F	R	E	L	L	P	S	T	V	K	E	F	D	S	D	R	F	Y	V	H	S	S	P	Y	L	A	N	W	G	R	P	E	S	W	G	T	G	D	S	H	N	W	G	V	W	Y	G	K	K	P	F	E	S	L	D	T	D	L	P	R	F	M	S	E	F	G	F	Q	S	F
Template Known Secondary structure													T	T											T	T	S				S	S	B	S	S	S			T	T		G	G	G	T	T	B	S						T	T	T	T	T				T	T					S			S	S								B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		482	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.
		519	520	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	G	P	G	G	L	T	E	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	N	V	F	Y	K	H	D	C	I	Q	G	H	Y	V	W	E	W	C	D	H	G	I	Q	A	Q	D	D	H	G	N
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		P	E	M	K	T	I	A	A	F	A	A	P	E	D	Y	Q	I	E	S	E	V	M	N	A	H	Q	K	S	S	I	G	N	S	L	I	R	T	Y	M	E	R	D	Y	I	I	P	E	S	F	E	D	F	V	Y	V	G	L	V	L	Q	G	Q	G	M	R	H	G	L	E	A	H	R	R	N	R	P	Y	.	.	.
Template Known Secondary structure													G	G	G		S	T	T	S						T	B		S	S	S													S				S	S																										T	T	T	T	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		562	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.
		559	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.		.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																								.																									.
Query SS confidence																																																								.																									.
Query Sequence		V	W	Y	K	F	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N	N	Y	N	F	C	L	D	G	L	I	Y	S	D	Q	T	P	G	P	G	L	K	E	Y	K	Q	V	I	A	P	V	K	I	H	A	R	D	L	T	R	G	.	E	L	K	V	E	N	K	L	W	F	T	T	L	D	D	Y	T	L	H	A	E	V	R	A	.
Query Conservation																																																								.																									.
Alig confidence		.	.	.																																																				.											.														.
Template Conservation		.	.	.																																																															.
Template Sequence		.	.	.	C	M	G	T	L	Y	W	Q	L	N	D	S	W	P	V	V	S	W	S	S	I	D	Y	Y	G	N	W	K	A	L	H	Y	Q	A	K	R	A	F	A	P	V	L	I	N	P	I	Q	Q	N	D	S	L	S	V	Y	L	I	S	D	R	L	D	.	T	M	E	Q	M	T	L	E	M	K	V	V	D	F
Template Known Secondary structure		.	.	.							S		S			S	S	S		B	B	S		S	B		T	T			B											T		S									T	T											S	S	.														T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																																																															.
Template SS confidence
					639	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700		.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.
		637	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.		650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.						.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710
Predicted Secondary structure															.														.	.	.	.	.
Query SS confidence															.														.	.	.	.	.
Query Sequence		E	G	E	T	L	A	T	Q	Q	I	K	L	R	.	D	V	A	P	N	S	E	A	P	L	Q	I	T	.	.	.	.	.	L	P	Q	L	D	A	R	E	A	F	L	N	I	T	V	T	K	D	S	R	T	R	Y	S	E	A	G	H	P	I	A	T	Y	Q	F	P	L	K	E	N	T	A	Q	P	V	P	F	A
Query Conservation															.														.	.	.	.	.
Alig confidence															.														.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.						.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.						.
Template Sequence		D	G	K	T	L	G	K	K	I	Q	V	H	S	L	E	V	P	A	N	T	S	K	C	V	Y	R	A	K	L	D	G	W	L	T	P	E	D	C	R	R	S	F	L	K	L	I	L	K	D	K	S	.	.	.	.	.	.	.	G	H	Q	V	A	.	E	S	V	H	F	F	R	K	T	K	D	L	Q	L	P	P
Template Known Secondary structure		T	S																T	T										S	T	T	T	S						T	T										T	T	.	.	.	.	.	.	.						.						S	S		G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.						.
Template SS confidence
		715	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.								.	.	.	.	770		.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.
		711	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	N	N	A	R	P	L	T	L	E	D	D	R	L	S	C	T	V	R	G	Y	N	F	A	I	T	F
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		T	S	V	S	Y	Q	M	K	Q	T	D	G	K	C	E	L	T	L	F	S	S	M	L	A	K	D	I
Template Known Secondary structure												T	T									S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		787	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.