Job Description P06864 Confidence 99.71% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 51 Aligned Residues 593 % Identity 12% Template c1xc6A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:beta-galactosidase; PDBTitle: native structure of beta-galactosidase from penicillium sp. in complex2 with galactose Resolution 2.10 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.						.	.	.	.	.	380	.												.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	K	V	R	D	G	L	F	W	I	N	N	R	Y	V	M	L	H	G	V	N	R	H	D	N	D	H	R	K	G	R	A	V	G	M	D	R	V	E	K	D	L	Q	L	M	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	T	.	.	.	.	.	A	H	Y	P	N	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	F
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.
Template Sequence		V	T	W	D	E	H	S	I	F	V	N	G	E	R	L	M	I	F	S	G	E	V	H	P	Y	.	.	.	.	.	R	L	P	V	A	S	L	Y	I	D	I	F	E	K	V	K	A	L	G	F	N	C	V	S	F	Y	V	D	W	A	L	L	E	G	N	P	G	H	Y	S	A	E	G	I	F	D	L	Q	P	F
Template Known Secondary structure						S	S					T	T												G	G	.	.	.	.	.	G	S			G	G	G										T	T	T															S	B	T	T	B					G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.
Template SS confidence
		46	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70						.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.										410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.						440	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	E	L	C	D	I	Y	G	L	F	V	M	A	E	T	D	V	E	S	H	G	F	A	N	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	I	S	R	I	T	D	D	P	Q	W	E	K	V	Y	V	E	R	I	V	R	H	I	H	A	Q	K	N	H	P	.	.	.	.	.	S	I	I	I	W	S	L	G	N	E
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	D	A	A	K	E	A	G	I	Y	L	L	A	R	P	G	P	Y	I	N	A	E	V	S	G	G	G	F	P	G	W	L	Q	R	V	D	G	I	L	R	T	S	D	E	A	Y	L	K	A	T	D	N	Y	A	S	N	I	A	A	T	I	A	K	A	Q	I	T	N	G	G	P	I	I	L	Y	Q	P	E	N	E
Template Known Secondary structure									T									S				T	T	B	G	G	G	G			G	G	G	G	G		S	S		T	T	S	S																						T	B	G	G	G	T	S	S							S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		121	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
		450	.	.											.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	C	N	I	R	A	M	Y	H	A	A	K	A	L	D	D	T	R	L	V	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	E	E	D	R	D	A	E	V	V	D	I	I	S	T	M	Y	T	R	V
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	S	G	A	C	C	G	Y	N	G	F	P	D	G	S	Y	M	Q	Y	I	E	D	H	A	R	D	A	G	I	V	V	P	F	I	S	N	D	A	W	A	A	G	H	N	A	P	G	T	G	A	G	A	V	D	I	Y	G	H	D	S	Y	P	L	G	F	D	C	A	N	P	S	T	W	P	S	G	N	L	P	T
Template Known Secondary structure					B		T	T					S															T	T			S		B	B			B	S	S	S	S		T	T		T	T	S		T	T			S	B							T	T		S			S	S	T	T				T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
		494	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	L	M	N	E	F	G	E	Y	P	H	P	K	P	R	I	I	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	G	P	G	G	L	T	E	Y	Q	N	V	F	Y	K	H	D	C	I	Q	G	H	Y	V	W	E	W	C	D	H	G	I	Q	A	Q	D	D	H	G	N	V	W	Y	K	F	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N	N
Query Conservation
Alig confidence																																																															.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.
Template Sequence		Y	F	H	T	S	H	E	Q	Q	S	P	S	T	P	Y	S	L	V	E	F	Q	G	G	A	F	D	P	W	G	G	V	G	F	A	K	C	A	A	L	L	N	H	E	F	E	R	V	F	Y	K	N	D	F	S	F	G	V	A	F	L	N	.	.	.	.	L	Y	M	I	F	G	G	T	N	W	G	N	L	G	H
Template Known Secondary structure												T	T	S									S						T	T											T	S													T	T	T		S				.	.	.	.								B			T	T		B
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.
Template SS confidence
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.					.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
		574	.					.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.		590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620
Predicted Secondary structure				.	.	.	.															.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.															.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	N	.	.	.	.	F	C	L	D	G	L	I	Y	S	D	Q	T	P	G	.	P	G	L	K	E	Y	K	Q	V	I	A	P	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	I	H	A	R	D	L	T	R	G	E	L	K	V	E	N	K	L
Query Conservation				.	.	.	.															.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.															.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	G	G	Y	T	S	Y	D	Y	G	S	A	I	S	E	S	R	N	I	T	R	E	K	Y	S	E	L	K	L	L	G	N	F	A	K	V	S	P	G	Y	L	V	A	N	P	G	D	L	S	T	S	T	Y	T	N	T	A	D	L	T	V	T	P	L	L	G	S	N	S	S	A	S	S	F	F	V	I	R	H	S
Template Known Secondary structure		T	T	S		S	B			T	T		S	B		T	T	S				S															T		G	G	G	T	T	S						B	S	S	S	S	B	S		T	T									S	S	T	T	S									S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
		621	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.		.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.
Query SS confidence																			.
Query Sequence		W	F	T	T	L	D	D	Y	T	L	H	A	E	V	R	A	E	.	G	E	T	L	A	T	Q	Q	I	K	L	R	D	V	A	P	N	S	E	A	P	L	Q	I	T	L	P	Q	L	D	A	R	E	A	F	L	N	I	T	V	T	K	D	S	R	T	R	Y	S	E	A	G	H	P	I	A	T	Y	Q	F	P	L
Query Conservation																			.
Alig confidence																			.																															.	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Y	S	S	Q	A	S	V	E	Y	K	L	T	V	P	T	S	A	G	N	L	T	I	P	Q	L	G	G	S	L	T	L	S	G	R	D	S	K	I	H	V	T	D	Y	D	V	A	G	.	.	.	.	.	T	N	I	L	Y	S	T	A	E	V	F	T	W	K	K	F	N	N	E	K	V	L	V	L	Y	G	G
Template Known Secondary structure		S	T	T														T	T							T	T	S							T	T												T	T	.	.	.	.	.							S	S									T	T
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.						.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.
		700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.			.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.
Query SS confidence																																																									.	.
Query Sequence		K	E	N	T	A	Q	P	V	P	F	A	P	N	N	A	R	P	L	T	L	E	D	D	R	L	S	C	T	V	R	G	Y	N	F	A	I	T	F	S	K	M	S	G	K	P	T	S	W	Q	V	N	G	E	S	L	.	.	L	T	R	E	P	K	I	N	F	F	K	P	M	I	D	N	H	K	Q	E	Y	E	G
Query Conservation																																																									.	.
Alig confidence																																																.									.	.
Template Conservation																																																.
Template Sequence		P	G	E	H	H	E	F	A	V	S	G	A	S	S	S	S	V	V	E	G	S	S	S	G	I	S	S	K	K	V	G	K	A	L	V	V	A	W	D	V	S	T	A	R	R	I	.	V	Q	V	G	S	L	K	V	F	L	L	D	R	N	S	A	Y	N	Y	W	V	P	Q	V	P	T	K	G	T	A	P	G	Y
Template Known Secondary structure		T	T									T									S			T	T							T	T										S	S				.				T	T												T	T								S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																.
Template SS confidence
		512	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.		.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590
		778	.	780	.	.	.	.	.												.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820		.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Query Sequence		L	W	Q	P	N	H	L	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	M	Q	E	H	L	R	D	F	A	V	E	Q	S	D	G	E	V	L	I	I	S	R	T	V	I	A	P	P	V	F	D	F	G	M	.	R	C	T	Y	I	W	R	I	A	A	D	G	Q	V	N	V	A	L	S	G	E	R	Y	G	D
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Template Conservation
Template Sequence		S	N	Q	E	T	T	A	S	S	I	I	V	K	A	G	Y	L	V	R	S	A	Y	L	D	G	N	D	L	H	I	Q	A	D	F	N	A	T	T	P	I	E	V	V	G	A	P	S	G	A	K	N	L	V	I	N	G	K	K	T	Q	T	K	V	D	K	N	G	I	W	S	A	S	V	A	Y	T	A	P	K	V
Template Known Secondary structure			S						T							S	S									T	T								B	S	S								S			T	T							T	T									T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		591	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670
		846	.	.	.	850	.	.			.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.			.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.																														.	.																																						.	.	.
Query SS confidence									.	.																														.	.																																						.	.	.
Query Sequence		Y	P	H	I	I	P	C	.	.	I	G	F	T	M	G	I	N	G	E	Y	D	Q	V	A	Y	Y	G	R	G	P	G	E	N	Y	A	D	S	Q	.	.	Q	A	N	I	I	D	I	W	R	S	T	V	D	A	M	F	E	N	Y	P	F	P	Q	N	N	G	N	R	Q	H	V	R	W	T	A	L	T	.	.	.
Query Conservation									.	.																														.	.																																						.	.	.
Alig confidence									.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.																																						.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	L	P	S	L	K	S	L	K	W	K	S	V	D	T	L	P	E	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	T	Y	D	D	S	A	W	T	S	A	D	H	A	Y	T	N	N	S	A	H	S	L	Q	T	P	T	S	L	F	A	S	D	Y	G	Y	H	T	G	A	L	L	F	R	G	H	F	T	A
Template Known Secondary structure						G	G	G	S							S		G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T				T	T	S						S	S				T	T				S	S	S	S			B	G	G	G	G	T			S	S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		671	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690												.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.
				919	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.
Query SS confidence		.	.
Query Sequence		.	.	N	R	H	G	N	G	L	L	V	V	P	Q	R	P	I	N	F	S	A	W
Query Conservation		.	.
Alig confidence		.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	G	K	E	K	T	F	F	V	Q	T	K	G	G	T	A	Y	G	H	S	I	W
Template Known Secondary structure			S												S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.