Job Description P06864 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:59:27 GMT 2012 Rank 12 Aligned Residues 520 % Identity 24% Template c1bhgB_ PDB info PDB header:glycosidase Chain: B: PDB Molecule:beta-glucuronidase; PDBTitle: human beta-glucuronidase at 2.6 a resolution Resolution 2.53 Å

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		34	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.				.	.	.	60	.	.	.	.	.	.				.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.											.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.											.	.	.
Query Sequence		A	R	E	T	S	S	L	F	L	P	L	S	G	Q	W	N	F	H	F	F	D	H	P	.	.	.	L	Q	V	P	E	A	F	T	S	E	.	.	.	L	M	A	D	W	G	H	I	T	V	P	A	M	W	Q	M	E	G	H	G	K	L	Q	Y	T	D	E	G	F	P	F	P	I	D	V	P	F	V	P	S	D
Query Conservation																									.	.	.											.	.	.
Alig confidence																									.	.	.											.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	E	S	P	S	R	E	C	K	E	L	D	G	L	W	S	F	R	A	D	F	S	D	N	R	R	R	G	F	E	E	Q	W	Y	R	R	P	L	W	E	S	G	P	T	V	D	M	P	V	P	S	S	F	N	D	I	S	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	R	L	R	H	F
Template Known Secondary structure			S	S	S	S			B					S									S	S	S	S		T	G	G	G	G	T	T	T	S	S						S							S	S	B		G	G	G	T	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		31	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.																90	.	.	.	.	.
		108	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.				.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.					170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Predicted Secondary structure																			.	.	.																																														.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.																																														.	.	.	.
Query Sequence		N	P	T	G	A	Y	Q	R	I	F	T	L	S	D	G	W	Q	.	.	.	G	K	Q	T	L	I	K	F	D	G	V	E	T	Y	F	E	V	Y	V	N	G	Q	Y	V	G	F	S	K	G	S	R	L	T	A	E	F	D	I	S	A	M	V	K	T	G	.	.	.	.	D	N	L	L	C	V	R	V	M	Q	W
Query Conservation																			.	.	.																																														.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.																																														.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	G	W	V	W	Y	E	R	E	V	I	L	P	E	R	W	T	Q	D	L	R	T	R	V	V	L	R	I	G	S	A	H	S	Y	A	I	V	W	V	N	G	V	D	T	L	E	H	E	G	G	Y	L	P	F	E	A	D	I	S	N	L	V	Q	V	G	P	L	P	S	R	L	R	I	T	I	A	I	N	N	T
Template Known Secondary structure			S												G	G	G	S	S	S	T	T	S	B					B	S			S	S							T	T									S	S			B				S	S		T	T		S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
		181	.	.	.	.	.	.	.	.																							190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	D	S	T	Y	V	E	D	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	M	W	W	S	A	G	I	F	R	D	V	Y	L	V	G	K	H	L	T	H	I	N	D	F	T	V	R	T	D	F	D	E	A	Y	C	D	A	T	L	S	C	E	V	V	L	E	N	L
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																			.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	T	P	T	T	L	P	P	G	T	I	Q	Y	L	T	D	T	S	K	Y	P	K	G	Y	F	V	Q	N	T	Y	F	D	F	F	N	Y	A	G	L	Q	R	S	V	L	L	Y	T	T	P	T	T	Y	I	D	D	I	T	V	T	T	S	V	E	Q	D	.	.	.	.	.	.	S	G	L	V	N	Y	Q	I	S
Template Known Secondary structure				T	T	S	S	S										S	S	S	S		T	T								S	S	S					S	B		S		B		B			B		S	S				B					B			S	S	S	.	.	.	.	.	.	S	B		B					B
Template Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		176	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240							.	.	.	.	.	.	.	.	.
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.			.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																				.	.
Query SS confidence																																																																				.	.
Query Sequence		A	A	S	P	V	V	T	T	L	E	Y	T	L	F	D	G	E	R	V	V	H	S	S	A	I	D	H	L	A	I	E	K	L	T	S	A	S	F	A	F	T	V	E	Q	P	Q	Q	W	S	A	E	S	P	Y	L	Y	H	L	V	M	T	L	K	D	A	N	.	.	G	N	V	L	E	V	V	P	Q	R	V	G
Query Conservation																																																																				.	.
Alig confidence																																				.	.	.	.																													.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.
Template Sequence		V	K	G	S	N	L	F	K	L	E	V	R	L	L	D	A	E	N	K	V	V	A	N	G	T	G	T	Q	G	Q	L	K	V	P	.	.	.	.	G	V	S	L	W	W	P	Y	L	M	H	E	R	P	A	Y	L	Y	S	L	E	V	Q	L	T	A	Q	T	S	L	G	P	V	S	D	F	Y	T	L	P	V	G
Template Known Secondary structure					S	S									B		S	S	S		B				B		S	S	S					B		.	.	.	.	S							T	T	S	S	S	S		S														S	S
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.
Template SS confidence
		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.					.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	R	D	I	K	V	R	D	G	L	F	W	I	N	N	R	Y	V	M	L	H	G	V	N	R	H	D	N	D	H	R	K	G	R	A	V	G	M	D	R	V	E	K	D	L	Q	L	M	K	Q	H	N	I	N	S	V	R	T	A	H	Y	P	N	D	P	R	F	Y	E	L	C	D	I	Y	G	L	F	V	M	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		I	R	T	V	A	V	T	K	S	Q	F	L	I	N	G	K	P	F	Y	F	H	G	V	N	K	H	E	D	A	D	I	R	G	K	G	F	D	W	P	L	L	V	K	D	F	N	L	L	R	W	L	G	A	N	A	F	R	T	S	H	Y	P	Y	A	E	E	V	M	Q	M	C	D	R	Y	G	I	V	V	I	D
Template Known Secondary structure									S	S					T	T															T	T	T	T	T																		T							T	T	S			S	T							T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.						450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.	.
Query Sequence		E	T	D	V	E	S	H	G	F	A	N	V	G	D	I	S	R	I	T	D	D	P	Q	W	E	K	V	Y	V	E	R	I	V	R	H	I	H	A	Q	K	N	H	P	S	I	I	I	W	S	L	G	N	E	.	.	.	.	.	S	G	Y	G	C	N	I	R	A	M	Y	H	A	A	K	A	L	D	D	T	R	L
Query Conservation																																																							.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	C	P	G	V	G	L	A	.	.	.	.	.	.	.	L	P	Q	F	F	N	N	V	S	L	H	H	H	M	Q	V	M	E	E	V	V	R	R	D	K	N	H	P	A	V	V	M	W	S	V	A	N	E	P	A	S	H	L	E	S	A	G	Y	Y	L	K	M	V	I	A	H	T	K	S	L	D	P	S	R	P
Template Known Secondary structure				S						.	.	.	.	.	.	.	S	G	G	G	G	S																			T	T		T	T									S			T	T	S	T	T													T	T	T		T	T	S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		406	.	.	.	410	.	.	.								.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.
		472	.	.	.	.							.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.																.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	H	Y	E	E	.	.	.	.	.	.	D	R	D	A	E	V	V	D	I	I	S	T	M	Y	T	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	L	M	N	E	F	G	E	Y	P	H	P	K	P	R	I	I	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	G	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation							.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	T	F	V	S	N	S	N	Y	A	A	D	K	G	A	P	Y	V	D	V	I	C	L	N	S	Y	Y	S	W	Y	H	D	Y	G	H	L	E	L	I	Q	L	Q	L	A	T	Q	F	E	N	W	Y	K	K	Y	Q	K	P	I	I	Q	S	E	Y	G	A	E	T	I	A	G	F	H	Q	D	P	P	L	M	F	T
Template Known Secondary structure								S		T	T	T		S	S	T	T	T		S	S							B	T	T	T	B	S	T	T																						S													T	T				S	S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		479	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.
							522	.	.	.	.	.	.	.	530	.			.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.											.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.											.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	G	G	L	T	E	Y	Q	N	V	F	.	.	Y	K	H	D	C	I	Q	G	H	Y	V	W	E	W	C	D	H	G	I	Q	A	Q	D	D	H	G	N	V	W	Y	K	F	G	G	D	Y	G	D	Y	P	N	N	Y	N	F	C	L	D	G	L	I	Y	S	D	Q	T	P	G	P	G	L	K	E
Query Conservation		.	.	.	.	.											.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.											.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	E	Y	Q	K	S	L	L	E	Q	Y	H	L	G	L	D	Q	K	R	R	K	Y	V	V	G	E	L	I	W	N	F	A	D	F	M	T	E	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	P	T	R	V	L	G	N	K	K	G	I	F	T	R	Q	R	Q	P	K	S	A	A	F	L
Template Known Secondary structure																				T	T	T	T									S	B		B					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	T	T	B	S	S	S	B				S	B		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		559	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.
		595	.	.	.	.	600	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	K	Q	V	I	A	P	V
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	R	E	R	Y	W	K	I
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		622	.	.	.	.	.	.	.