Job Description P0A8G3 Confidence 99.89% Date Thu Jan 5 11:07:46 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 353 % Identity 18% Template c2qpxA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:predicted metal-dependent hydrolase of the tim-barrel fold; PDBTitle: crystal structure of putative metal-dependent hydrolase (yp_805737.1)2 from lactobacillus casei atcc 334 at 1.40 a resolution Resolution 1.40 Å

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		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	Y	A	K	D	Q	P	I	F	D	Y	H	C	H	L	P	P	Q	Q	I	A	E	D	Y	R	F	K	N	L	Y	D	I	W	L	K	G	D	H	Y	K	W	R	A	M	R	T	N	G	V	A	E	R	L	C	T	G	D	A	S	D	R	E	K	F	D	A	W	A	A	T	V	P	H	T	I	G	N	P	L	Y
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	F	V	D	Q	V	P	L	L	D	H	H	C	H	F	.	.	.	.	.	L	I	D	G	K	V	P	N	R	D	D	R	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Q	V	S	T	E	A	D	K	D	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	P	L	A	D	T	K	N	R	L	A	Y
Template Known Secondary structure																	.	.	.	.	.	B	B		T	T		S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	S	S			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	S						T	T	S
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20						.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	40	.	.	.									.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.
		102	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.						.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.
Query Sequence		H	W	T	H	L	E	L	R	R	P	F	G	I	T	G	K	L	L	S	P	S	T	A	D	E	I	W	N	E	C	N	E	L	L	A	Q	D	N	F	S	A	R	G	I	M	Q	Q	M	N	V	K	M	V	G	T	.	.	.	.	.	T	D	D	P	I	D	S	L	E	H	H	A	E	I	A	K	D	G	S	F
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.
Alig confidence							.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.																			.	.
Template Conservation							.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.
Template Sequence		H	G	F	L	A	.	L	A	K	E	F	A	L	D	A	N	N	P	L	A	A	X	N	D	P	G	Y	A	T	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	R	I	F	G	H	F	H	F	K	E	L	L	I	D	T	G	F	V	P	D	D	P	I	L	D	L	D	Q	T	A	E	L	V	G	I	P	.	.
Template Known Secondary structure							.							S	S	T	T	S	T	T													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T								T	T				S	S	B												T	S		.	.
Template Predicted Secondary structure							.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.
Template SS confidence
		56	.	.	.	60		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.											.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.
		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.					.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.
Query SS confidence																																																																			.	.	.	.
Query Sequence		T	I	K	V	L	P	S	W	R	P	D	K	A	F	N	I	E	Q	A	T	F	N	D	Y	M	A	K	L	G	E	V	S	D	T	D	I	R	R	F	A	D	L	Q	T	A	L	T	K	R	L	D	H	F	A	A	H	G	C	K	V	S	D	H	A	L	.	.	.	.	D	V	V	M	F	A	E	A	N	E	A
Query Conservation																																																																			.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.			.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.
Template Sequence		V	K	A	I	Y	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	T	H	A	E	D	F	X	L	E	H	D	N	F	A	A	W	W	Q	A	F	S	N	D	V	K	Q	A	K	A	H	G	F	V	G	F	.	.	S	I	A	A	Y	R	V	G	L	H	L	E	P	V	N	V	I
Template Known Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	T		S	S														T	T	T	T	T	T					.	.							T		S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.
Template SS confidence
		123	.	.	.	.	.																			.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.			.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.
		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	L	D	S	I	L	A	R	R	L	A	G	E	T	L	S	E	H	E	V	A	Q	F	K	T	A	V	L	V	F	L	G	A	E	Y	A	R	R	G	W	V	Q	Q	Y	H	I	G	A	L	R	N	N	N	L	R	Q	F	K	L	L	G	P	D	V	G	F	D	S	I	N	D	R	P	M	A	E	E	L	S	K
Query Conservation
Alig confidence																					.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	A	A	A	G	F	D	T	W	K	H	S	G	E	K	R	L	T	S	.	K	P	L	I	D	Y	X	L	Y	H	V	A	P	F	I	I	A	Q	D	X	P	L	Q	F	H	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	D	A	D	T	D	X	Y	L	G	N	P	L	L	X	R	D
Template Known Secondary structure																	S				.																			T								S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	S		G	G	G			G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																					.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.		.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.																230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
		333	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	S	K	Q	N	E	E	N	L	L	P	K	T	I	L	Y	C	L	N	P	R	D	N	E	V	L	G	T	M	I	G	N	F	Q	G	E	G	M	P	G	K	M	Q	F	G	S	G	W	W	F	N	D	Q	K	D	G	M	E	R	Q	M	T	Q	L	A	Q	L	G	L	L	S	R	F	V	G	M	L	T	D
Query Conservation
Alig confidence											.	.								.																		.	.	.	.	.	.																																.
Template Conservation											.	.								.																		.	.	.	.	.	.																																.
Template Sequence		Y	L	K	A	F	T	K	K	G	.	.	L	K	V	V	L	L	H	.	C	Y	P	Y	H	R	E	A	G	Y	L	A	S	V	F	P	N	.	.	.	.	.	.	L	Y	F	D	I	S	L	L	D	N	L	G	P	S	G	A	S	R	V	F	N	E	A	V	E	L	A	P	Y	T	R	.	I	L	F	A	S	D
Template Known Secondary structure							G	G	G	T	.	.								.		T	T												S	T	T	.	.	.	.	.	.						T	T					S	G	G	G									T	S	S	S		G	G	G	.
Template Predicted Secondary structure											.	.								.																		.	.	.	.	.	.																																.
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.			.	.	.	260	.	.	.		.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280							.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.		.	.	.	.	.	.
		413	.	.	.			.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.
Query SS confidence						.	.
Query Sequence		S	R	S	F	.	.	L	S	Y	T	R	H	E	Y	F	R	R	I	L	C	Q	M	I	G	R	W	V	E	A	G	E	A	P	A	D	I	N	L	L	G	E	M	V	K	N	I	C	F	N	N	A	R	D	Y	F	A	I	E
Query Conservation						.	.
Alig confidence						.	.																		.	.	.													.	.
Template Conservation																									.	.	.													.	.
Template Sequence		A	S	T	Y	P	E	X	Y	G	L	A	A	R	Q	F	K	Q	A	L	V	A	H	F	.	.	.	N	Q	L	P	F	V	D	L	A	Q	K	K	.	.	A	W	I	N	A	I	C	W	Q	T	S	A	K	L	Y	H	Q	E
Template Known Secondary structure				B	S																				.	.	.		T		S	S								.	.								T							T	T		G
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.													.	.
Template SS confidence
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340				.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.			.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370