Job Description P36928 Confidence 99.84% Date Thu Jan 5 11:53:57 GMT 2012 Rank 26 Aligned Residues 295 % Identity 16% Template c3js6A_ PDB info PDB header:unknown function Chain: A: PDB Molecule:uncharacterized parm protein; PDBTitle: crystal structure of apo psk41 parm protein Resolution 1.95 Å

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		1	.	.		.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.
Query SS confidence					.
Query Sequence		M	F	I	.	G	F	D	Y	G	T	A	N	C	S	V	A	V	M	R	D	G	K	P	H	L	L	K	M	E	N	D	S	T	L	L	P	S	M	L	C	A	P	T	R	E	A	V	S	E	W	L	Y	R	H	H	D	V	P	A	D	D	D	E	T	Q	A	L	L	R	R	A	I	R	Y	N	R	E	E	D	I
Query Conservation					.
Alig confidence					.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	Y	V	X	A	L	D	F	G	N	G	F	V	K	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	N	D	E	K	F	V	I	P	S	R	I	G	R	K	T	N	E	N	N	Q	L	K	G	F	V	D	N	K	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	V	S	E	F	I	I	N
Template Known Secondary structure											S	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T							S							S	S			S	S	T	T	T	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S							T
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.												20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.																50	.	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	V	T	A	K	S	V	Q	F	G	L	S	S	L	A	Q	Y	I	D	D	P	E	E	V	W	F	V	K	S	P	K	S	F	L	G	A	S	G	L	K	P	Q	Q	V	A	L	F	E	D	L	V	C	A	M	M	L	H	I	R	Q	Q	A	Q	A	Q	L	P	E	A	I	T	Q	A	V	I	G	R	P	I	N
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	N	N	D	E	V	L	L	F	G	N	D	L	D	K	T	T	N	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	D	T	A	S	T	N	D	R	Y	D	I	K	S	F	K	D	L	V	E	C	S	I	G	L	L	A	.	.	.	.	.	.	.	R	E	V	P	E	E	V	V	N	V	V
Template Known Secondary structure		T		T	T						S	T	T						S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S	T	T	G	G	G	S																.	.	.	.	.	.	.	T	T	S		S	S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		58	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.																.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.								.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.														.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.							.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	Q	G	L	G	G	D	E	A	N	T	Q	A	Q	G	I	L	E	R	A	A	K	R	A	G	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	V	V	F	Q	Y	E	P	V	A	A	G	L	D	Y	E	A	T	L	Q	.	.	.	.	.	.	E	E	K	R	V	L	V	V	D	I	G	G	G	T
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	A	T	G	X	P	S	N	E	I	G	T	D	K	Q	A	K	F	E	K	L	L	N	K	S	R	L	I	E	I	D	G	I	A	K	T	I	N	V	K	G	V	K	I	V	A	Q	P	X	G	T	L	L	D	L	N	X	E	N	G	K	V	F	K	A	F	T	E	G	K	Y	S	V	L	D	F	G	S	G	T
Template Known Secondary structure								G	G	G	T	T	S											S	S							T	T																							T	T			T	T								T										S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	D	C	S	L	L	L	M	G	P	Q	W	R	S	R	L	D	R	E	A	S	L	L	G	H	S	G	C	R	I	G	G	N	D	L	D	I	A	L	A	F	K	N	L	M	P	L	L	G	M	G	G	E	T	E	K	G	I	A	L	P	I	L	P	W	W	N	A	V	A	I	N	D	V	P	A	Q	S	D	F
Query Conservation
Alig confidence									.	.												.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.												.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	I	I	D	T	Y	Q	.	.	N	X	K	R	V	E	E	E	S	F	V	.	.	.	.	.	.	.	I	N	K	G	T	I	D	F	Y	K	R	I	A	S	H	V	S	T	P	R	M	I	E	K	G	L	E	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									.	.	T	T				G	G	G				.	.	.	.	.	.	.		S														T								S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure									.	.												.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		196	.	.	.	200	.	.			.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.								.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	S	S	A	N	G	R	L	L	N	D	L	V	R	D	A	R	E	P	E	K	V	A	L	L	Q	K	V	W	R	Q	R	L	S	Y	R	L	V	R	S	A	E	E	C	K	I	A	L	S	S	V	A	E	T	R	A	S	L	P	F	I	S	N	E	L	A	T	L	I	S	Q	R	G	L	E	S	A	L	S	Q
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	D	E	F	Y	K	E	Q	D	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																								263	.	.	.	.	.	.	270	.	.
		381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	L	T	R	I	L	E	Q	V	Q	L	A	L	D	N	A	Q	E	K	P	D	V	I	Y	L	T	G	G	S	A	R	S	P	L	I	K	K	A	L	A	E	Q	L	P	G	I	P	I	A	G	G	D	D	F	G	S	V	T	A	G	L	A	R	W	A	E	V	V	F	R
Query Conservation
Alig confidence																			.													.	.
Template Conservation																			.													.	.
Template Sequence		L	I	E	E	V	X	S	N	F	E	I	T	V	G	N	I	N	.	S	I	D	R	I	I	V	T	G	G	G	A	.	.	N	I	H	F	D	S	L	S	H	Y	Y	S	D	V	F	E	K	A	D	D	S	Q	F	S	N	V	R	G	Y	E	K	L	G	E	L	L	K	N
Template Known Secondary structure														T			T	T	.	S		S						S	T	T		.	.											S	S	S						S	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																			.													.	.
Template SS confidence
		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.			.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.