Job Description P36928 Confidence 99.92% Date Thu Jan 5 11:53:57 GMT 2012 Rank 21 Aligned Residues 290 % Identity 20% Template c2fsnB_ PDB info PDB header:structural protein Chain: B: PDB Molecule:hypothetical protein ta0583; PDBTitle: crystal structure of ta0583, an archaeal actin homolog, complex with2 adp Resolution 2.90 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	F	I	G	F	D	Y	G	T	A	N	C	S	V	A	V	M	R	D	G	K	P	H	L	L	K	M	E	N	D	S	T	L	L	P	S	M	L	C	A	P	T	R	E	A	V	S	E	W	L	Y	R	H	H	D	V	P	A	D	D	D	E	T	Q	A	L	L	R	R	A	I	R	Y	N	R	E	E	D	I	D
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	V	V	G	L	D	V	G	Y	G	D	T	K	V	I	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	K	R	I	I	F	P	S	R	W	A	V	T	I	P	V	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										S	S	B						T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S						B	S										B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.											.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	T	A	K	S	V	Q	F	G	L	S	S	L	A	Q	Y	I	D	D	P	E	E	V	W	F	V	K	S	P	K	S	F	L	G	A	S	G	L	K	P	Q	Q	V	A	L	F	E	D	L	V	C	A	M	M	L	H	I	R	Q	Q	A	Q	A	Q	L	P	E	A	I	T	Q	A	V	I	G	R	P	I	N	F
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	G	G	Q	T	K	F	I	Y	G	K	Y	A	S	G	N	N	I	R	V	P	Q	G	D	G	R	L	A	S	K	E	A	F	P	L	I	A	A	A	L	W	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	I	H	N	V	D	L	V	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S	S	S	S					T	T	S			S	S	S					S	S	T	T		S	S	S	T	T	T											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																		48	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90												.	.	.	.	.	.	.	.	.	100
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.															.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.				.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.
Query Sequence		Q	G	L	G	G	D	E	A	N	T	Q	A	Q	G	I	L	E	R	A	A	K	R	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	R	D	V	V	F	Q	Y	E	P	V	A	A	G	L	D	Y	E	A	T	.	.	.	L	Q	E	E	K	R	V	L	V	V	D	I	G	G	G	T	T	D	C
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	S	G	T	P	L	G	T	F	D	L	E	V	K	A	A	K	E	A	L	E	N	K	V	L	T	V	T	G	P	E	G	E	V	R	Q	F	N	I	T	R	L	I	X	R	P	Q	G	V	G	A	A	L	Y	L	L	N	Q	G	I	I	E	Q	Q	P	G	Y	G	V	V	I	D	V	G	S	R	T	T	D	V
Template Known Secondary structure							G	G	G													T	T						B		T	T	T															T	T										T	T	S	S				S	S									S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		105	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	L	L	L	M	G	P	Q	W	R	S	R	L	D	R	E	A	S	L	L	G	H	S	G	C	R	I	G	G	N	D	L	D	I	A	L	A	F	K	N	L	M	P	L	L	G	M	G	G	E	T	E	K	G	I	A	L	P	I	L	P	W	W	N	A	V	A	I	N	D	V	P	A	Q	S	D	F	Y	S	S
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	T	I	N	L	X	D	X	E	P	V	V	E	L	S	F	S	.	.	.	.	.	.	.	L	Q	I	G	V	G	D	A	I	S	A	L	S	R	K	I	A	K	E	T	G	F	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						T	T	T	T				G	G	G				.	.	.	.	.	.	.		S			S													T	T	S	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		185	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.								.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	N	G	R	L	L	N	D	L	V	R	D	A	R	E	P	E	K	V	A	L	L	Q	K	V	W	R	Q	R	L	S	Y	R	L	V	R	S	A	E	E	C	K	I	A	L	S	S	V	A	E	T	R	A	S	L	P	F	I	S	N	E	L	A	T	L	I	S	Q	R	G	L	E	S	A	L	S	Q	P	L	T
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	F	D	L	A	Q	E	A	L	S	H	P	V	X	F	R	Q	K	Q	V	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	E	V	S	G	P	I	L	E	D	L	A	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T								T	T	S					T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																			226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.													.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260
		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.			.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.
Query SS confidence																																																		.	.
Query Sequence		R	I	L	E	Q	V	Q	L	A	L	D	N	A	Q	E	K	P	D	V	I	Y	L	T	G	G	S	A	R	S	P	L	I	K	K	A	L	A	E	Q	L	P	G	I	P	I	A	G	G	.	.	D	D	F	G	S	V	T	A	G	L	A	R	W	A	E	V
Query Conservation																																																		.	.
Alig confidence																															.	.																		.	.
Template Conservation																															.	.
Template Sequence		R	I	I	E	N	I	R	L	N	L	R	G	E	V	D	R	V	T	S	L	I	P	V	G	G	G	S	N	L	.	.	I	G	D	R	F	E	E	I	A	P	G	T	L	V	K	I	K	P	E	D	L	Q	F	A	N	A	L	G	Y	R	D	A	A	E	R
Template Known Secondary structure												G	G	G	G	G	S								S	T	T				.	.		G	G	G	G	G	G	G	S	T	T		B									T	T												T
Template Predicted Secondary structure																															.	.
Template SS confidence
		261	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.			290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.