Job Description P36928 Confidence 95.75% Date Thu Jan 5 11:53:57 GMT 2012 Rank 72 Aligned Residues 295 % Identity 14% Template c2ch5D_ PDB info PDB header:transferase Chain: D: PDB Molecule:nagk protein; PDBTitle: crystal structure of human n-acetylglucosamine kinase in2 complex with n-acetylglucosamine Resolution 1.9 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	F	I	G	F	D	Y	G	T	A	N	C	S	V	A	V	M	R	D	G	K	P	H	L	L	K	M	E	N	D	S	T	L	L	P	S	M	L	C	A	P	T	R	E	A	V	S	E	W	L	Y	R	H	H	D	V	P	A	D	D	D	E	T	Q	A	L	L	R	R	A	I	R	Y	N	R	E	E	D	I	D
Query Conservation
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	Y	G	G	V	E	G	G	G	T	R	S	E	V	L	L	V	S	E	D	G	K	I	L	A	E	A	D	G	L	S	T	N	H	W	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										T	T									T	T	S																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	T	A	K	S	V	Q	F	G	L	S	S	L	A	Q	Y	I	D	D	P	E	E	V	W	F	V	K	S	P	K	S	F	L	G	A	S	G	L	K	P	Q	Q	V	A	L	F	E	D	L	V	C	A	M	M	L	H	I	R	Q	Q	A	Q	A	Q	L	P	E	A	I	T	Q	A	V	I	G	R	P	I	N	F
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G	T	D	K	C	V	E	R	I	N	E	M	V	N	R	A	K	R	K	A	G	V	D	P	L	V	P	L	.	.	.	.	.	R	S	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						T			T	T			B	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																													40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.						.	70	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.				.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.
Query Sequence		Q	G	L	G	G	D	E	A	N	T	Q	A	Q	G	I	L	E	R	A	A	K	R	A	G	F	R	.	.	.	D	V	V	F	Q	Y	E	P	V	A	A	G	L	D	Y	E	A	T	L	Q	E	E	K	R	V	L	V	V	D	I	G	G	G	T	T	D	C	S	L	L	L	M	G	P	Q	W	R	S	R	L	D
Query Conservation																												.	.	.
Alig confidence																												.	.	.															.	.	.	.	.															.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.															.	.	.	.	.
Template Sequence		G	L	S	L	S	G	G	D	Q	E	D	A	G	R	I	L	I	E	E	L	R	D	R	F	P	Y	L	S	E	S	Y	L	I	T	T	D	A	A	G	S	I	A	T	.	.	.	.	.	A	T	P	D	G	G	V	V	L	I	S	G	T	G	.	.	.	.	.	S	N	C	R	L	I	N	P	D	G	S	E	S
Template Known Secondary structure						T	T	T	T																	T	T	S	B	S															.	.	.	.	.			S	S								S	S	S	.	.	.	.	.								T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.															.	.	.	.	.
Template SS confidence
		72	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.						.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.						.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	E	A	S	L	L	G	H	S	G	C	R	I	G	G	N	D	L	D	I	A	L	A	F	K	N	L	M	P	L	L	G	M	G	G	E	T	E	K	G	I	A	L	P	I	L	P	W	W	N	A	V	A	I	N	D	V	P	A	Q	S	D	F	Y	S	S	A	N	G	R	L	L	N	D	L	V	R	D	A	R
Query Conservation
Alig confidence																																																																															.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		G	C	G	G	W	G	H	M	M	G	D	E	G	S	A	Y	W	I	A	H	Q	A	V	K	I	V	F	D	S	I	D	N	L	E	A	A	P	H	D	I	G	Y	V	K	Q	A	M	F	H	Y	F	Q	V	P	D	R	L	G	I	L	T	H	L	Y	R	D	F	D	K	C	R	F	A	G	F	C	R	.	.	.
Template Known Secondary structure								T	T	T			T	T	S																		T	S	S			S	S														T		S	S									T	T	T								T	T			.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	P	E	K	V	A	L	L	Q	K	V	W	R	Q	R	L	S	Y	R	L	V	R	S	A	E	E	C	K	I	A	L	S	S	V	A	E	T	R	A	S	L	P	F	I	S	N	E	L	A	T	L	I	S	Q	R	G	L	E	S	A	L	S	Q	P	L	T	R	I	L	E	Q	V	Q	L	A	L	D	N	A	Q
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	I	A	E	G	A	Q	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	P	L	S	R	Y	I	F	R	K	A	G	E	M	L	G	R	H	I	V	A	V	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T																							G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																				219	220	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
		398	.	400	.											.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.		.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.						.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.												.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.												.	.	.	.	.
Query Sequence		E	K	P	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	I	Y	L	T	G	G	S	A	R	S	.	P	L	I	K	K	A	L	A	E	Q	L	.	.	.	.	.	P	G	I	P	I	A	G	G	D	D	F	G	S	V	T	A	G	L	A	R	W	A	E	V	V
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.												.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.												.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	E	I	D	P	V	L	F	Q	G	K	I	G	L	P	I	L	C	V	G	S	V	W	K	S	W	E	L	L	K	E	G	F	L	L	A	L	T	Q	G	R	E	I	F	S	S	F	T	L	M	K	L	R	H	S	S	A	L	G	G	A	S	L	G	A	R	H
Template Known Secondary structure		G	G	S		G	G	G	G		S	S	S								S	G	G	G	G	G																												S	S		T											T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.