Job Description P75825 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:21:03 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 494 % Identity 20% Template d1oaoa_ SCOP info Prismane protein-like Prismane protein-like Carbon monoxide dehydrogenase Resolution 1.90

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	V	Q	C	E	Q	T	I	R	T	P	A	G	N	G	C	S	Y	A	Q	G	M	C	G	K	T	A	E	T	S	D	L	Q	D	L	L	I	A	A	L	Q	G	L	S	A	W	A	V	K	A	R	E	Y	G	I	I	N	H	D	V	D	S	F	A	P	R	A	F	F	S	T	L	T	N	V	N	F	D	S	P
Query Conservation
Alig confidence																																																																.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	R	F	C	M	A	G	P	C	R	I	K	A	T	D	G	P	G	S	R	G	I	C	G	A	S	A	W	T	I	V	A	R	N	V	G	L	M	I	L	T	G	A	A	A	H	C	E	H	G	N	H	I	A	H	A	L	V	E	M	A	E	.	.	.	.	.	.	G	K	A	P	D	Y	S	V	K	D	E	A
Template Known Secondary structure				S	S	T	T								S	S	S	T	T	S	B		T	T			B																																				T	.	.	.	.	.	.	T	S		T	T				S
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		68	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.							130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.		.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure																																																																		.
Query SS confidence																																																																		.
Query Sequence		R	I	V	G	Y	A	R	E	A	I	A	L	R	E	A	L	K	A	Q	C	L	A	V	D	A	N	A	R	V	D	N	P	M	A	D	L	Q	L	V	S	D	D	L	G	E	L	Q	R	Q	A	A	E	F	T	P	N	K	D	K	A	A	I	G	E	.	N	I	L	G	L	R	L	L	C	L	Y	G	L	K	G
Query Conservation																																																																		.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.									.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	L	K	E	V	C	R	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	I	E	V	E	G	K	S	V	L	E	L	A	Q	E	V	G	E	K	A	L	E	D	F	R	R	L	K	G	E	G	E	A	T	W	L	M	T	T	.	.	.	.	.	.	I
Template Known Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T				T	T																						T	T	S								T	T	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		142	.	.	.	.	.	.	.																										150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.							190
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190		.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.																																																	.	.
Query SS confidence																															.																																																	.	.
Query Sequence		A	A	A	Y	M	E	H	A	H	V	L	G	Q	Y	D	N	D	I	Y	A	Q	Y	H	K	I	M	A	W	L	.	G	T	W	P	A	D	M	N	A	L	L	E	C	S	M	E	I	G	Q	M	N	F	K	V	M	S	I	L	D	A	G	E	T	G	K	Y	G	H	P	T	P	T	Q	V	N	V	K	A	.	.
Query Conservation																															.																																																	.	.
Alig confidence																															.																																																	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	E	G	R	K	E	K	F	R	T	H	N	V	V	P	F	G	I	H	A	S	I	S	E	L	V	N	Q	A	H	M	G	M	D	N	D	P	V	N	L	V	F	S	A	I	R	V	A	L	A	D	Y	T	G	E	H	I	A	T	D	F	S	D	I	L	F	G	T	P	Q	P	V	V	S	E	A	N	M	G	V
Template Known Secondary structure												T	T				S	S												T	S	T	T	S																																												S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		191	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270
				239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.											.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.					270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure		.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	T	A	G	K	C	I	L	I	S	G	H	D	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	Y	N	L	L	E	Q	T	E	G	T	G	V	N	V	Y	.	.	.	.	T	H	G	E	M	L	P	A	H	G	Y	P	E	L	R	K	F	K	H	L	V	G	N	Y	G	S	G	W	Q	N	Q	Q	V
Query Conservation		.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.
Alig confidence		.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	D	P	D	Q	V	N	F	V	L	H	G	H	N	P	L	L	S	E	I	I	V	Q	A	A	R	E	M	E	G	E	A	K	A	A	G	A	K	G	I	N	L	V	G	I	C	C	T	G	N	E	V	L	M	R	Q	G	I	P	.	.	.	.	.	.	.	L	V	T	S	F	A	S	.	.	.	.	.	.	Q
Template Known Secondary structure				T	T	S							S	S															T							T	T		S																						.	.	.	.	.	.	.					G	G	G	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.								330	.	.	.	.	.	.							.
		303	.	.	.	.	.	.	310	.				.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.				.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.		.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.							.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.												.	.	.														.														.	.	.	.	.	.																				.	.
Query SS confidence											.	.	.												.	.	.														.														.	.	.	.	.	.																				.	.
Query Sequence		E	F	A	R	F	P	G	P	I	.	.	.	V	M	T	S	N	C	I	I	D	P	T	.	.	.	V	G	A	Y	D	D	R	I	W	T	R	S	I	.	V	G	W	P	G	V	R	H	L	D	G	D	D	.	.	.	.	.	.	F	S	A	V	I	T	Q	A	Q	Q	M	A	G	F	P	Y	S	E	I	.	.
Query Conservation											.	.	.												.	.	.														.														.	.	.	.	.	.																				.	.
Alig confidence											.	.	.												.	.	.														.														.	.	.	.	.	.																				.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	L	A	I	C	T	G	A	I	D	A	M	C	V	D	V	Q	C	I	M	P	S	I	S	A	V	A	E	C	Y	H	T	R	I	I	T	T	A	D	N	A	K	I	P	G	A	Y	H	I	D	Y	Q	T	A	T	A	I	E	S	A	K	T	A	I	R	M	A	I	E	A	F	K	E	R	K	E	S	N	R	P
Template Known Secondary structure						T	T	S			S						S	S	S			T	T						T	T	S	S							B	T	T	B			T	T	S							G	G	G																					T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		338	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.
								368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.										.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.			.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	P	H	L	I	T	V	G	F	G	R	Q	T	L	L	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	T	L	I	D	L	V	S	R	E	K	L	R	H	I	F	L	L	G	G	C	D	G	A	R	G	E	R	H	Y	F	T	.	.	D	F	A	T	S	V	P	D	D	C	L	I	L	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	Y	I	P	Q	I	K	N	R	V	V	A	G	W	S	L	E	A	L	T	K	L	L	A	T	Q	N	A	Q	N	P	I	R	V	L	N	Q	A	I	L	D	G	E	L	A	G	V	A	L	I	C	G	C	N	N	L	K	G	F	Q	D	N	S	H	L	T	V	M	K	E	L	L	K	N	N	V	F	V	V	A
Template Known Secondary structure																										T	T		S	S		T										T	T	S	S												T	T	S		B	T													T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		418	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	A	C	G	K	Y	R	F	N	K	L	E	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	I	E	G	L	P	R	L	V	D	A	G	Q	C	N	D	A	Y	S	A	I	I	L	A	V	T	L	A	E	K	L	G	C	G	V	N	D	L	P	L	S
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	G	C	S	A	Q	A	A	G	K	L	G	L	L	D	P	A	N	V	E	T	Y	C	G	D	G	L	K	G	F	L	K	R	L	G	E	G	A	N	I	E	I	G	L	P	P	V	F	H	M	G	S	C	V	D	N	S	R	A	V	D	L	L	M	A	M	A	N	D	L	G	V	D	T	P	K	V	P	F	V
Template Known Secondary structure													T	T	T		G	G	G																				T	T		S	S				S						S	G	G	G																T	S		G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		498	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.
		486		.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.			.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.																																																.	.
Query SS confidence			.																																																.	.
Query Sequence		L	.	V	L	S	W	F	E	Q	K	A	I	V	I	L	L	T	L	L	S	L	G	V	K	N	I	V	T	G	P	T	A	P	G	F	L	T	P	D	L	L	A	V	L	N	E	K	F	G	.	.	L	R	S	I	T	T	V	E	E	D	M	K	Q	L
Query Conservation			.																																																.	.
Alig confidence			.																						.																										.	.
Template Conservation																									.
Template Sequence		A	S	A	P	E	A	M	S	G	K	A	A	A	I	G	T	W	W	V	S	L	G	V	.	P	T	H	V	G	T	M	P	P	V	E	G	S	D	L	I	Y	S	I	L	T	Q	I	A	S	D	V	Y	G	G	Y	F	I	F	E	M	D	P	Q	V	A
Template Known Secondary structure					T	T			S													T	T		.					S	S			S		T	T										T						T	S							S	S
Template Predicted Secondary structure																									.
Template SS confidence
		578	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.