Job Description P37766 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:57:34 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 351 % Identity 23% Template c3eh7A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:4-hydroxybutyrate coa-transferase; PDBTitle: the structure of a putative 4-hydroxybutyrate coa-transferase from2 porphyromonas gingivalis w83 Resolution 2.05 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	V	P	V	L	S	A	Q	E	A	V	N	Y	I	P	D	E	A	T	L	C	V	L	G	A	G	G	G	I	L	E	A	T	T	L	I	T	A	L	A	D	K	Y	K	Q	T	Q	T	P	R	N	L	S	I	I	S	P	T	G	L	G	D	R	A	D	R	G	I	S	P	L	A	Q	E	G	L	V	K	W	A
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.														.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.														.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	S	R	I	V	S	A	E	E	A	V	K	H	I	K	N	G	E	R	V	A	L	S	H	A	.	.	.	A	G	V	P	Q	S	C	V	D	A	L	V	Q	.	.	.	.	.	Q	A	D	L	F	V	E	I	Y	H	X	L	C	L	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G	G									T	T			T	T								G	.	.	.	G	G												.	.	.	.	.	S	T	T	T								B		T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.														.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.				.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.						.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	C	G	H	W	G	Q	S	P	R	I	S	E	L	A	E	Q	N	K	I	I	A	Y	N	Y	P	Q	G	V	L	T	Q	T	L	R	A	A	A	A	H	Q	P	G	I	I	S	D	I	G	I	G	T	F	V	D	P	R	Q	Q	G	G	K	L	N	E	V	T	K	E	D	L	I	K	L	V	E	F	D	N	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	R	A	D	F	I	P	V	F	F	Y	E	V	P	S	X	I	R	K	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T						G	G	G							T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																			65	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
		172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Y	L	Y	Y	K	A	I	A	P	D	I	A	F	I	R	A	T	T	C	D	S	E	G	Y	A	T	F	E	D	E	V	M	Y	L	D	A	L	V	I	A	Q	A	V	H	N	N	G	G	I	V	M	M	Q	V	Q	K	M	V	K	K	A	T	L	H	P	K	S	V	R	I	P	G	Y	L	V	D	I	V	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	L	H	I	D	V	A	I	V	Q	L	S	X	P	D	E	N	G	Y	C	S	F	G	V	S	.	.	.	.	.	.	C	D	Y	S	K	P	A	A	E	S	A	H	L	V	I	G	E	I	N	R	Q	X	P	Y	.	.	.	V	H	G	D	N	L	I	H	I	S	K	L	D	Y	I	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	S			S											T	T	S					T	T	B	.	.	.	.	.	.		T	T									S								T	T	S			.	.	.				S					G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Template SS confidence
									115	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.							.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.				.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310		.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.									.
Predicted Secondary structure																																																													.												.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																													.												.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	D	P	D	Q	T	Q	L	Y	G	G	A	P	V	N	R	F	I	S	G	D	F	T	L	D	D	S	T	K	L	S	L	P	L	N	Q	R	K	L	V	A	R	R	A	L	F	E	M	R	K	G	A	V	G	N	V	G	V	G	.	I	A	D	G	I	G	L	V	A	R	E	.	.	.	.	.	.	.	.	E
Query Conservation																																																													.												.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		X	A	D	Y	P	I	Y	S	L	A	K	P	K	I	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	E	A	I	G	R	N	C	A	E	L	I	E	D	G	A	T	L	Q	L	G	I	G	A	I	P	D	A	A	L	L	F	L	K	D	K	K	D	L	G	I	H	T	E
Template Known Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T			T	T							S	S									T	T	T	T			S	B					S
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.									.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.											.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	C	A	D	D	F	I	L	T	V	E	T	G	P	I	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	I	T	S	Q	G	I	A	F	G	A	N	V	N	T	R	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	M	T	S	Q	F	D	F	Y	H	G	G	G	L	D	V	C	Y	L	S	F	A	E	V	D	Q	H
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		X	F	S	D	G	V	V	E	L	V	R	S	G	V	I	T	G	K	K	K	T	L	H	P	G	K	X	V	A	T	F	L	X	G	S	E	D	V	Y	H	F	I	D	K	N	P	D	V	E	L	Y	P	V	D	Y	V	N	D	P	R	V	I	A	Q	N	D	N	X	V	S	I	N	S	C	I	E	I	D	L	X
Template Known Secondary structure													T	T	S	B			T	T		S	S	S	T	T					S													T	T		T	T										T						T	T	S	S	S								S				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.		.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.						.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.																		.	.	.	.	.
Query SS confidence													.																		.	.	.	.	.
Query Sequence		G	N	V	G	V	H	K	F	N	G	K	.	I	M	G	T	G	G	F	I	D	I	S	A	T	S	K	K	I	.	.	.	.	.	I	F	C	G	T	L	T	A	G	S	L	K	T	E	I	T	D	G	K	L	N	I	V	Q	E	G	R	V	K	K	F	I	R	E	L	P	E	I	T	F	S	G	K	I	A	L
Query Conservation													.																		.	.	.	.	.
Alig confidence													.																		.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Template Sequence		G	Q	V	V	S	E	C	I	G	S	K	Q	F	S	G	T	G	G	Q	V	D	Y	V	R	G	A	A	W	S	K	N	G	K	S	I	X	A	I	P	S	T	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	T	A	S	R	I	V	P	I	I	A	E	G	A	A	V	.	.	.	T	T
Template Known Secondary structure								S	T	T	S			S	B				T											S	T	T									S			T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T			S			S	S			T	T				.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Template SS confidence
		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.																.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.				380	.
		459	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.						.	.	.	.	.		.	.	.			490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.						.				.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.						.				.	.
Query Sequence		E	R	G	L	D	V	R	Y	I	T	E	R	A	V	F	T	L	K	E	D	G	L	H	.	.	.	.	.	L	I	E	I	A	.	P	G	V	.	.	D	L	Q	K	D	I	L	D	K	M	D
Query Conservation																									.	.	.	.	.						.				.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.						.				.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	R	N	E	V	D	Y	V	V	T	E	Y	G	I	A	Q	L	K	G	K	S	L	R	Q	R	A	E	A	L	I	A	I	A	H	P	D	F	R	E	E	L	T	K	H	L	R	K	R	F	G
Template Known Secondary structure			T	T	T							T	T						T	T												T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.