Job Description P37766 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:57:34 GMT 2012 Rank 14 Aligned Residues 345 % Identity 20% Template c3d3uA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:4-hydroxybutyrate coa-transferase; PDBTitle: crystal structure of 4-hydroxybutyrate coa-transferase (abft-2) from2 porphyromonas gingivalis. northeast structural genomics consortium3 target pgr26 Resolution 2.80 Å

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		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.		.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
Predicted Secondary structure												.
Query SS confidence												.
Query Sequence		R	V	P	V	L	S	A	Q	E	A	.	V	N	Y	I	P	D	E	A	T	L	C	V	L	G	A	G	G	G	I	L	E	A	T	T	L	I	T	A	L	A	D	K	Y	K	Q	T	Q	T	P	R	N	L	S	I	I	S	P	T	G	L	G	D	R	A	D	R	G	I	S	P	L	A	Q	E	G	L	V	K	W
Query Conservation												.
Alig confidence												.															.	.	.																				.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.																				.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	Q	R	V	C	S	A	D	E	A	V	V	D	S	L	K	P	G	T	K	V	V	F	G	H	.	.	.	A	A	A	A	P	V	R	F	S	Q	A	M	Y	R	Q	R	E	K	L	.	.	.	E	N	I	T	V	F	H	M	L	Y	F	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					B													T	T								.	.	.	B	T	T												T	T	T	T		.	.	.		S						S		B	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.																				.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.				.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.				.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.
		91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	L	C	G	H	W	G	Q	S	P	R	I	S	E	L	A	E	Q	N	K	I	I	A	Y	N	Y	P	Q	G	V	L	T	Q	T	L	R	A	A	A	A	H	Q	P	G	I	I	S	D	I	G	I	G	T	F	V	D	P	R	Q	Q	G	G	K	L	N	E	V	T	K	E	D	L	I	K	L	V	E	F	D	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	H	L	A	P	E	M	R	S	H	V	H	P	T	L	C	H	F	H	E	V	P	E	L	F	R	Q	G	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S	S	G	G	G	T	T	T								G	G	G						T	T	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											65	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.
		171	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	E	Y	L	Y	Y	K	A	I	A	P	D	I	A	F	I	R	A	T	T	C	D	S	E	G	Y	A	T	F	E	D	E	V	M	Y	L	D	A	L	V	I	A	Q	A	V	H	N	N	G	G	I	V	M	M	Q	V	Q	K	M	V	K	K	A	T	L	H	P	K	S	V	R	I	P	G	Y	L	V	D	I	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	F	P	L	D	V	A	V	V	Q	V	S	T	P	N	E	E	G	Y	C	S	F	G	V	S	.	.	.	.	.	.	C	D	Y	T	K	A	A	A	E	C	A	P	V	V	V	A	E	V	N	K	Q	M	P	F	.	.	.	I	G	G	E	N	L	I	H	I	S	K	L	T	H	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	S			S											T	T	S					T	T	B	.	.	.	.	.	.		B	T									S								S	S	S			.	.	.				S					G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Template SS confidence
										115	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.							.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.				.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310		.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure																																																														.												.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																														.												.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	V	D	P	D	Q	T	Q	L	Y	G	G	A	P	V	N	R	F	I	S	G	D	F	T	L	D	D	S	T	K	L	S	L	P	L	N	Q	R	K	L	V	A	R	R	A	L	F	E	M	R	K	G	A	V	G	N	V	G	V	G	.	I	A	D	G	I	G	L	V	A	R	E	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																														.												.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	E	V	D	E	P	I	A	E	V	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	G	S	D	L	E	L	R	I	G	Q	N	C	A	S	L	I	K	D	G	D	T	L	Q	L	G	I	G	G	I	P	D	A	V	L	R	A	L	E	G	H	K	D	L	G	I	H	T
Template Known Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															T	T			T	T							S	S									T	T	T	T			S	B
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.									.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360											.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	G	C	A	D	D	F	I	L	T	V	E	T	G	P	I	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	I	T	S	Q	G	I	A	F	G	A	N	V	N	T	R	A	I	L	D	M	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Q	F	D	F	Y	H	G	G	G	L	D	V	C	Y	L	S	F	A	E	V	D	Q
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	M	F	T	D	G	V	M	R	M	I	R	K	G	I	I	N	G	K	K	K	T	L	H	P	E	K	V	V	T	S	L	I	F	G	S	K	E	L	Y	D	F	V	N	N	N	P	V	I	E	C	Y	P	V	D	Y	I	N	N	P	D	V	I	G	K	N	D	R	M	V	S	I	N	S	C	L	E	M	D	L
Template Known Secondary structure		S		B											T		B			S	S		S	S	S	T	T	S				S	B	B											T	T		T	T					B					T								S	S	S								S				T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410						.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.
Query Sequence		H	G	N	V	G	V	H	K	F	N	G	K	I	M	G	T	G	G	F	I	D	I	S	A	T	S	K	.	.	.	.	.	K	I	I	F	C	G	T	L	T	A	G	S	L	K	T	E	I	T	D	G	K	L	N	I	V	Q	E	G	R	V	K	K	F	I	R	E	L	P	E	I	T	F	S	G	K	I	A	L
Query Conservation																													.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	G	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	Q	V	D	F	L	R	G	A	K	R	S	K	G	G	I	S	I	M	A	F	P	S	T	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	T	E	S	R	I	V	P	I	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	T
Template Known Secondary structure		T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	T	S	T	T									S			T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T			S			S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		319	320	.														.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.																.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.										360	.
		459	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.		.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.
Predicted Secondary structure																																							.
Query SS confidence																																							.
Query Sequence		E	R	G	L	D	V	R	Y	I	T	E	R	A	V	F	T	L	K	E	D	G	L	H	L	I	E	I	A	P	G	V	D	L	Q	K	D	I	.	L	D	K	M	D	F	T	P	V	I	S	P	E	L	K	L
Query Conservation																																							.
Alig confidence																				.	.									.	.	.	.	.					.
Template Conservation																				.	.									.	.	.	.	.
Template Sequence		G	R	N	E	V	D	Y	V	V	T	E	Y	G	V	A	R	L	R	.	.	G	A	T	L	R	Q	R	A	.	.	.	.	.	E	A	L	T	A	I	A	H	P	D	F	R	P	A	L	E	E	E	I	R	R
Template Known Secondary structure			S	T	T		S					T	T						T	.	.	T								.	.	.	.	.							S		T	T											T
Template Predicted Secondary structure																				.	.									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.			400	.	.	.	.	.	.	.						.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.