Job Description P37766 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:57:34 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 422 % Identity 16% Template c2nvvF_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: F: PDB Molecule:acetyl-coa hydrolase/transferase family protein; PDBTitle: crystal structure of the putative acetyl-coa hydrolase/transferase2 pg1013 from porphyromonas gingivalis, northeast structural genomics3 target pgr16. Resolution 2.70 Å

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		14	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.
Query SS confidence																																																	.
Query Sequence		P	V	L	S	A	Q	E	A	V	N	Y	I	P	D	E	A	T	L	C	V	L	G	A	G	G	G	I	L	E	A	T	T	L	I	T	A	L	A	D	K	Y	K	Q	T	Q	T	P	.	R	N	L	S	I	I	S	P	T	G	L	G	D	R	A	D	R	G	I	S	P	L	A	Q	E	G	L	V	K	W	A	L
Query Conservation																																																	.
Alig confidence																										.																							.														.
Template Conservation																										.																																					.
Template Sequence		R	F	I	T	A	E	E	A	A	E	F	V	H	H	N	D	N	V	G	F	S	G	F	T	.	P	A	G	N	P	K	V	V	P	A	A	I	A	K	R	A	I	A	A	H	E	K	G	N	P	F	K	I	G	X	F	T	G	A	S	T	.	G	A	R	L	D	G	V	L	A	Q	A	D	A	V	K	F	R	T
Template Known Secondary structure			B								T	T			T	T								S	S	.	S	T	T				S														T	T	T										S	S			.		T	T	T							T	T
Template Predicted Secondary structure																										.																																					.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.		.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.		.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	G	H	W	G	Q	S	P	R	I	S	E	L	A	E	Q	N	K	I	I	A	Y	N	Y	P	Q	G	V	L	T	Q	T	L	R	A	A	A	A	H	Q	P	G	I	I	S	D	I	G	I	G	T	F	V	D	P	R	Q	Q	G	G	K	L	N	E	V	T	K	E	D	L	I	K	L	V	E	F	D	N	K	E
Query Conservation
Alig confidence			.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	.	.	Y	Q	S	N	K	D	L	R	N	L	I	N	N	G	S	T	S	Y	F	D	L	H	L	S	T	L	A	Q	D	L	R	Y	G	F	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	.	.													T	T	S	S							G	G	G							T	T	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure			.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		82			.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.
		173	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	L	Y	Y	K	A	I	A	P	D	I	A	F	I	R	A	T	T	C	D	S	E	G	Y	A	T	F	E	D	E	V	M	Y	L	D	A	L	V	I	A	Q	A	V	H	N	N	G	G	I	V	M	M	Q	V	Q	K	M	V	K	K	A	T	L	H	P	K	S	V	R	I	P	G	Y	L	V	D	I	V	V	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	G	K	V	D	V	A	I	I	E	V	A	D	V	T	E	D	G	K	I	L	P	T	T	G	.	.	.	.	.	.	V	G	I	L	P	T	I	C	R	L	A	D	R	I	I	V	E	L	N	D	K	H	P	K	E	I	X	G	X	H	D	L	C	E	P	L	D	P	P	A	R	R	E	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.											S				T	T	S						S	B	.	.	.	.	.	.		B	T									S								T	T	S		G	G	G	T	T	S	B		B						T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.							.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.								.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.											300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310		.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Query Sequence		D	P	D	Q	T	Q	L	Y	G	G	A	P	V	N	R	F	I	S	G	D	F	.	.	.	.	.	.	.	T	L	D	D	S	T	K	L	S	L	P	L	N	Q	R	K	L	V	A	R	R	A	L	F	E	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	K	G	A	V	G	N	V	G	V	G	.	I	A	D	G
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Template Conservation
Template Sequence		P	V	Y	T	P	S	D	R	I	G	K	P	Y	V	Q	V	D	P	A	K	I	V	G	V	V	R	T	S	E	P	N	D	E	S	D	F	A	P	L	D	P	V	T	Q	A	I	G	D	N	V	A	A	F	L	V	S	E	X	K	A	G	R	I	P	K	D	F	L	P	L	Q	S	G	V	G	N	V	A	N	A
Template Known Secondary structure				S	S	T	T				S	B	S	S					G	G	G																																									T	S	S		T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.												.	.	.	.	.				.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	G	L	V	A	R	E	E	G	C	A	D	D	F	I	L	T	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	P	I	G	.	.	.	G	I	T	S	Q	G	I	A	F	G	A	N	V	N	T	R	A	I	L	D	M	T	S	Q	F	D	F	Y	H	G	G	G	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	L	G	A	L	G	D	N	P	D	I	P	A	F	N	X	Y	T	E	V	I	Q	D	A	V	I	A	L	X	K	K	G	R	I	K	F	A	S	G	C	S	L	S	V	S	R	S	V	I	Q	D	I	Y	A	N	L	D	F	F	K	D	K	I	L	L	R	P	Q	E	Y	S	N	N	P	E	I	V	R	R	L
Template Known Secondary structure										T	T	S								S												T	T	S							S														T						T	T	T					B					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
				373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.		.	.	.		.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																					.				.
Query SS confidence		.	.																					.				.
Query Sequence		.	.	V	C	Y	L	S	F	A	E	V	D	Q	H	G	N	V	G	V	H	K	F	.	N	G	K	.	I	M	G	T	G	G	F	I	D	I	S	A	T	S	K	K	I	I	F	C	G	T	L	T	A	G	S	L	K	T	E	I	T	D	G	K	L	N	I	V	Q	E	G	R	V	K	K	F	I	R	E	L	P
Query Conservation		.	.																					.				.
Alig confidence		.	.																					.				.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	V	I	T	I	N	T	A	L	E	A	D	I	F	G	N	I	N	S	T	H	V	S	G	T	R	X	X	N	G	I	G	G	S	G	D	F	T	R	N	S	Y	V	S	I	F	T	T	P	S	V	X	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	K	I	S	S	F	V	P	X	V	A
Template Known Secondary structure		T								S				T	T	S					S			T	T	T				S			T	T								S	S	S							S			G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	T			S			S	S		S
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.																.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410
		449	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.			.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.
Query SS confidence																																																	.	.
Query Sequence		E	I	T	F	S	G	K	I	A	L	E	R	G	L	D	V	R	Y	I	T	E	R	A	V	F	T	L	K	E	D	G	L	H	L	I	E	I	A	P	G	V	D	L	Q	K	D	I	.	.	L	D	K	M	D	F	T	P	V	I	S	P	E	L	K	L	M	D	E	R	L	F	I	D	A	A	M	G	F
Query Conservation																																																	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.																		.	.									.	.	.	.	.					.	.											.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.																		.	.									.	.	.	.	.																	.	.	.
Template Sequence		H	H	D	H	S	.	.	.	.	.	.	E	H	S	V	K	V	I	I	S	E	W	G	V	A	D	L	R	.	.	G	K	N	P	R	E	R	A	.	.	.	.	.	H	E	I	I	D	K	C	V	H	P	D	Y	R	P	L	L	.	.	.	R	Q	Y	L	E	L	G	V	K	G	Q	T	P	Q	N	L
Template Known Secondary structure		S		S	B		.	.	.	.	.	.	T	T	T							T	T						T	.	.	T								.	.	.	.	.							T	S		G	G	G					.	.	.				T	T	S				S	S	S				T
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.																		.	.									.	.	.	.	.																	.	.	.
Template SS confidence
		411	.	.	.	.							.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.			.	.	.	.	.	.	.	440						.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.				.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.