Job Description P37766 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:57:34 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 418 % Identity 20% Template c2hj0A_ PDB info PDB header:lyase Chain: A: PDB Molecule:putative citrate lyase, alfa subunit; PDBTitle: crystal structure of the putative alfa subunit of citrate lyase in2 complex with citrate from streptococcus mutans, northeast structural3 genomics target smr12 (casp target). Resolution 2.70 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.			.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.
Query SS confidence																										.	.
Query Sequence		M	K	P	V	K	P	P	R	I	N	G	R	V	P	V	L	S	A	Q	E	A	V	N	Y	.	.	I	P	D	E	A	T	L	C	V	L	G	A	G	G	G	I	L	E	A	T	T	L	I	T	A	L	A	D	K	Y	K	Q	T	Q	T	P	R	N	L	S	I	I	S	P	T	G	L	G	D	R	A	D	R	G
Query Conservation																										.	.
Alig confidence																										.	.									.	.	.																						.													.	.
Template Conservation																																				.	.	.																						.													.	.
Template Sequence		S	R	Q	V	K	P	V	K	P	S	D	D	K	L	L	S	S	I	H	E	A	I	E	K	T	R	L	K	D	G	X	T	I	S	.	.	.	F	H	H	H	F	R	E	G	D	Y	V	X	N	X	V	L	D	E	I	A	K	.	X	G	I	K	D	I	S	I	A	P	S	S	.	.	I	A	N	V	H	E	P
Template Known Secondary structure										T	T						S									T	T			T	T					.	.	.				T	T	G	G	G	B													.	T	T			S						S		.	.			G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.																						.													.	.
Template SS confidence
		35	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.				.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.			.	.	.	.	.	.	.
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.			.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.
Query SS confidence																																				.	.
Query Sequence		I	S	P	L	A	Q	E	G	L	V	K	W	A	L	C	G	H	W	G	Q	S	P	R	I	S	E	L	A	E	Q	N	K	I	I	.	.	A	Y	N	Y	P	Q	G	V	L	T	Q	T	L	R	A	A	A	A	H	Q	P	G	I	I	S	D	I	G	I	G	T	F	V	D	P	R	Q	Q	G	G	K	L	N	E
Query Conservation																																				.	.
Alig confidence																		.	.																	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	I	D	H	I	K	N	G	V	V	T	N	I	T	S	S	.	.	G	L	R	D	K	V	G	A	A	I	S	E	G	I	X	E	N	P	V	I	I	R	S	H	G	G	R	A	R	A	I	A	T	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T	T	S							S	.	.	B											T	T			S	S																	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																		.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.			.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	T	K	E	D	L	I	K	L	V	E	F	D	N	K	E	Y	L	Y	Y	K	A	I	A	P	D	I	A	F	I	R	A	T	T	C	D	S	E	G	Y	A	T	F	E	D	E	V	M	Y	L	D	A	L	V	I	A	Q	A	V	H	N	N	G	G	I	V	M	M	Q	V	Q	K	M	V	K	K	A	T	L	H
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	H	I	D	V	A	F	L	G	A	P	S	S	D	A	Y	G	N	A	N	G	T	R	G	K	T	T	C	G	S	L	G	Y	A	X	I	D	A	K	Y	A	D	Q	V	V	I	V	T	D	T	L	V	P	Y	.	.	.	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S			S							S				T	T	S				S	S	S	S	S	S			S													S							S	S	B			S	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.
Template SS confidence
																								160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.				.
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.							300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	K	S	V	R	I	P	G	Y	L	V	D	I	V	V	V	D	P	D	Q	T	Q	L	Y	G	G	A	P	V	N	R	F	I	S	G	D	F	T	L	D	D	S	T	K	L	S	L	P	L	N	Q	R	K	L	V	A	R	R	A	L	F	E	M	.	.	.	.	.	.	R	K	G	A	V	G	N	V	G	V	G
Query Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	T	P	I	S	I	P	Q	T	D	V	D	Y	I	V	V	V	D	A	I	G	D	.	.	.	.	.	.	P	E	G	I	A	K	G	A	T	R	Y	T	K	N	P	.	.	.	.	.	.	.	K	E	L	L	I	A	E	Y	A	A	K	V	I	T	S	S	P	Y	Y	K	E	G	F	S	F	Q	T	G	T	G
Template Known Secondary structure			S	S		S	B		G	G	G		S						S		S	B		.	.	.	.	.	.	T					S										.	.	.	.	.	.	.															T	S	T	T		S	T	T							S	S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.							.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.								.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.
			311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.										.	.	.	.	.	.					.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340								.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.													.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.													.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	I	A	D	G	I	G	L	V	A	R	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	C	A	D	D	F	.	.	.	.	I	L	T	V	E	T	G	P	I	G	G	I	.	.	.	.	.	.	.	T	S	Q	G	I	A	F	G	A	N	V	N	T	R	A	I	L	D	M	T	S	Q	F	D	F	Y	H	G	G
Query Conservation		.													.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.													.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	A	S	L	A	V	T	R	F	X	R	E	Q	X	I	K	D	D	I	K	A	N	F	A	L	G	G	I	T	N	A	X	V	E	L	L	E	E	G	L	V	D	K	I	L	D	V	Q	D	F	D	H	P	S	A	V	S	L	D	R	N	A	E	K	H	Y	E	I	D	A	N	X	Y	A	S	P	L	S	K	G
Template Known Secondary structure																		S									S												T	T	S							S			S	S										T	T	T	T												S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		282	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
		370					.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390			.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.																					.	.
Query SS confidence			.	.	.	.																					.	.
Query Sequence		G	.	.	.	.	L	D	V	C	Y	L	S	F	A	E	V	D	Q	H	G	N	V	G	V	H	.	.	K	F	N	G	K	I	M	G	T	G	G	F	I	D	I	S	A	T	S	K	K	I	I	F	C	G	T	L	T	A	G	S	L	K	T	E	I	T	D	G	K	L	N	I	V	Q	E	G	R	V	K	K	F
Query Conservation			.	.	.	.																					.	.
Alig confidence			.	.	.	.																					.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	V	I	N	Q	L	D	I	C	V	L	S	A	L	E	V	D	T	N	F	N	V	N	V	X	T	G	S	D	G	V	I	R	G	A	S	G	G	H	C	D	T	A	F	A	A	K	X	S	L	V	I	S	P	L	V	R	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	T	F
Template Known Secondary structure			G	G	G	G		S							S				T	T						S	B		T	T			B			B		T	T								S	S								S			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	B
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420																		.	.	.	.
		444	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	R	E	L	P	E	I	T	F	S	G	K	I	A	L	E	R	G	L	D	V	R	Y	I	T	E	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	F	T	L	K	E	D	G	L	H	L	I	E	I	A	P	G	V	D	L	Q	K	D	I	L	D	K	M	D
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	D	K	V	N	T	V	I	T	P	G	T	.	.	.	.	.	.	S	V	D	V	V	V	T	E	V	G	I	A	I	N	P	N	R	P	D	L	I	E	Y	F	K	D	L	K	V	P	Q	L	T	I	E	E	L	K	E	K	A	Y	A	I	V	G	N	P	Q	P	I	Q	Y	G	D	K	I	V	A	L	I	E
Template Known Secondary structure			S	S		S	S		S	B		G	G	.	.	.	.	.	.	G							S	S						T	T								T	T	T		S	S																		S
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.							.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.
		501	.	.		.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.
Query SS confidence					.
Query Sequence		F	T	P	.	V	I	S	P	E	L	K	L	M	D	E
Query Conservation					.
Alig confidence					.
Template Conservation
Template Sequence		Y	R	D	G	S	L	I	D	V	V	R	N	V	L	E
Template Known Secondary structure			T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		499	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.