Job Description P37766 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:57:34 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 409 % Identity 20% Template c2g39A_ PDB info PDB header:structural genomics, unknown function Chain: A: PDB Molecule:acetyl-coa hydrolase; PDBTitle: crystal structure of coenzyme a transferase from pseudomonas2 aeruginosa Resolution 2.10 Å

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		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	V	P	V	L	S	A	Q	E	A	V	N	Y	I	P	D	E	A	T	L	C	V	L	G	A	G	G	G	I	L	E	A	T	T	L	I	T	A	L	A	D	K	Y	K	Q	T	Q	T	P	R	N	L	S	I	I	S	P	T	G	L	G	D	R	A	D	R	G	I	S	P	L	A	Q	E	G	L	V	K	W	A
Query Conservation
Alig confidence																												.																					.	.																.	.	.
Template Conservation																												.																					.	.																.	.	.
Template Sequence		L	D	K	V	X	S	A	A	E	A	A	D	L	I	Q	D	G	X	T	V	G	X	S	G	F	T	.	R	A	G	E	A	K	A	V	P	Q	A	L	A	X	R	A	K	E	R	P	.	.	L	R	I	S	L	X	T	G	A	S	L	G	N	D	L	.	.	.	D	K	Q	L	T	E	A	G	V	L	A	R	R
Template Known Secondary structure		G	G	G	B								T	T			T	T								B	T	.	T	B	S																S		.	.								S	S				T	T		.	.	.							T	T
Template Predicted Secondary structure																												.																					.	.																.	.	.
Template SS confidence
		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.		.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.			.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.				.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	C	G	H	W	G	Q	S	P	R	I	S	E	L	A	E	Q	N	K	I	I	A	Y	N	Y	P	Q	G	V	L	T	Q	T	L	R	A	A	A	A	H	Q	P	G	I	I	S	D	I	G	I	G	T	F	V	D	P	R	Q	Q	G	G	K	L	N	E	V	T	K	E	D	L	I	K	L	V	E	F	D	N	K
Query Conservation
Alig confidence				.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		X	P	.	.	F	Q	V	D	S	T	L	R	K	A	I	N	A	G	E	V	X	F	I	D	Q	H	L	S	E	T	V	E	Q	L	R	N	H	Q	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	.	.													T	T	S	S							T	T	T							T	T	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		86	.			.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.
		172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	Y	L	Y	Y	K	A	I	A	P	D	I	A	F	I	R	A	T	T	C	D	S	E	G	Y	A	T	F	E	D	E	V	M	Y	L	D	A	L	V	I	A	Q	A	V	H	N	N	G	G	I	V	M	M	Q	V	Q	K	M	V	K	K	A	T	L	H	P	K	S	V	R	I	P	G	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	K	L	P	D	I	A	V	I	E	A	A	A	I	T	E	Q	G	H	I	V	P	T	T	S	.	.	.	.	.	.	V	G	N	S	A	S	F	A	I	F	A	K	Q	V	I	V	E	I	N	L	A	H	S	T	N	L	E	G	L	H	D	I	Y	I	P	T	Y	R	P	T	R	T	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.				S							S				T	T	S						S	B	.	.	.	.	.	.		B	T								S	S								T	T	S		G	G	G	T	T	S	B		B						T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									123	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.							.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																					245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																											.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																											.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	V	D	I	V	V	V	D	P	D	Q	T	Q	L	Y	G	G	A	P	V	N	R	F	I	S	G	D	F	T	L	D	D	S	T	K	L	S	L	P	L	N	Q	R	K	L	V	A	R	R	A	L	F	E	M	R	K	G	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																											.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	P	L	T	R	V	D	D	R	I	G	S	T	A	I	P	I	P	P	E	K	I	V	A	I	V	I	N	D	Q	P	D	S	P	S	T	V	L	P	P	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	Q	A	I	A	N	H	L	I	D	F	F	K	R	E	V	D	A
Template Known Secondary structure						S	T	T				S	B	S	S	B				G	G	G																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
									303	.	.	.	.	.	.	310		.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.											.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.									.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.									.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	A	V	G	N	V	G	V	G	.	I	A	D	G	I	G	L	V	A	R	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	C	A	D	D	F	I	L	T	V	E	T	G	P	I	G	G	I	T	S	Q	G	I	A	F	G	A	N	V	N	T	R	A	I	L	D	M	T	S	Q	F	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.									.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.									.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	R	X	S	N	S	L	G	P	L	Q	A	G	I	G	S	I	A	N	A	V	X	C	G	L	I	E	S	P	F	E	N	L	T	X	Y	S	E	V	L	Q	D	S	T	F	D	L	I	D	A	G	K	L	R	F	A	S	G	S	S	I	T	L	S	P	R	R	N	A	D	V	F	G	N	L	E	R	Y	K	D
Template Known Secondary structure		T	S	S		T	T		S						S	S									G	G	G	S	S	S			S						S												T	T								S															S	G	G	G	T	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
		365	.	.	.	.	370	.	.														.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.		.	.	.		.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.				.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.				.
Query Sequence		F	Y	H	G	G	G	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	C	Y	L	S	F	A	E	V	D	Q	H	G	N	V	G	V	H	K	F	.	N	G	K	.	I	M	G	T	G	G	F	I	D	I	S	A	T	S	K	K	I	I	F	C	G	T	L	T	A	G	S	L	K	T	E	I	T	D
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.				.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.				.																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	L	V	L	R	P	Q	E	I	S	N	H	P	E	V	V	R	R	L	G	I	I	G	I	N	T	A	L	E	F	D	I	Y	G	N	V	N	S	T	H	V	G	G	T	K	X	X	N	G	I	G	G	S	G	D	F	A	R	N	A	H	L	A	I	F	V	T	K	S	I	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G					B					T									T								S				T	T	S				S	S			T	T	T				S			T	T									S								S			G	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.						.	.	.		.	.		.	.	.			490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.				.			.				.	.
Query SS confidence																																																						.	.	.	.	.				.			.				.	.
Query Sequence		G	K	L	N	I	V	Q	E	G	R	V	K	K	F	I	R	E	L	P	E	I	T	F	S	G	K	I	A	L	E	R	G	L	D	V	R	Y	I	T	E	R	A	V	F	T	L	K	E	D	G	L	H	.	.	.	.	.	L	I	E	.	I	A	.	P	G	V	.	.	D	L	Q	K	D	I	L	D	K	M	D
Query Conservation																																																						.	.	.	.	.				.			.				.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.				.			.				.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	G	G	N	I	S	S	V	V	P	X	V	S	H	V	D	H	T	.	.	.	.	.	.	E	H	D	V	D	I	L	V	T	E	Q	G	L	A	D	L	R	G	L	A	P	R	E	R	A	R	V	I	I	E	N	C	V	H	P	S	Y	Q	A	P	L	L	D	Y	F	E	A	A	C	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	G	G	T			S			S	S		S	S		S	B		.	.	.	.	.	.	G	G	G							T	T						T	T														T	S		T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.							420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		501	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.				.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.
Query SS confidence													.	.	.
Query Sequence		F	T	P	V	I	S	P	E	L	K	L	.	.	.	M	D	E	R	L	F	I	D	A	A	M
Query Conservation													.	.	.
Alig confidence													.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	G	G	H	T	P	H	L	L	R	E	A	L	A	W	H	L	N	L	E	E	R	G	H	X
Template Known Secondary structure		T			S	S				T	T	T	T	T										S	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.