Job Description P39349 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:59:38 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 277 % Identity 19% Template d1hdha_ SCOP info Alkaline phosphatase-like Alkaline phosphatase-like Arylsulfatase Resolution 1.3

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		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.			.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	Y	D	T	I	V	I	V	T	G	E	S	V	R	R	D	Y	M	S	V	Y	D	Y	P	V	P	T	T	P	W	L	N	T	A	.	.	P	G	L	F	I	D	D	Y	T	S	T	A	S	S	T	V	S	S	L	S	R	T	L	I	Y	D	Y	E	Q	N	P	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																				.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.								.	.											.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.																				.	.
Template Sequence		K	R	P	N	F	L	V	I	V	A	D	D	L	G	F	S	D	I	G	A	F	G	G	E	I	A	.	T	P	N	L	D	A	L	A	I	A	G	L	R	L	T	D	F	H	T	.	.	A	S	T	S	P	T	R	S	M	L	L	T	G	T	D	H	H	I	A	G	I	G	T	M	A	E	A	L	T	P	E	L
Template Known Secondary structure												S	S			T	T		S	G	G	G	T			S		.											S				S	S				.	.											T	T	S	S						T		S	S		G	G	G			T	T	T
Template Predicted Secondary structure																												.																				.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.		.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.			.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
														156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	N	N	V	V	A	L	A	A	K	A	G	Y	S	T	W	W	I	S	N	Q	G	K	L	G	E	H	D	T	R	I	S	V	I	A	S	D	A	E	H	A	T	F	L	K	K	G	S	F	A	S	R	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	G	K	P	G	Y	E	G	H	L	N	E	R	V	V	A	L	P	E	L	L	R	E	A	G	Y	Q	T	L	M	A	G	K	W	H	L	G	L	K	P	E	Q	T	P	H	A	R	G	F	E	R	S	F	S	L	L	P	G	A	A	N	H	Y	G	F	E	P	P	Y	D	E	S	T	P	R	I	L	K	G	T
Template Known Secondary structure		T	T		T	T		S	S	S			S	S	S									T	T	T											S		S	S	G	G	G	S	T	T	T	T	T		S							S	S				T	T							S	T	T	S						T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
																				210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.			.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	D	K	L	L	L	Q	E	T	E	R	A	L	A	D	T	S	.	.	S	P	K	I	I	F	L	H	M	M	G	S	H	P	N	P	C	D	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	A	L	Y	V	E	D	E	R	Y	L	D	T	L	P	E	G	F	Y	S	S	D	A	F	G	D	K	L	L	Q	Y	L	K	E	R	D	Q	S	R	P	F	F	A	Y	L	P	F	S	A	P	H	W	P	L	Q	A	P	R	E	I	V	E	K	Y	R	G	R	Y	D	A	G	P	E	A	L	R	Q	E	R	L
Template Known Secondary structure								T	T				S				T	T																	T	S		T	T	S										T	T	S	S	S									G	G	G	T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
																											248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.			.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	S	X	P	N	N	Y	L	E	Q	Y	P	R	K	I	A	C	Y	L	A	S	I	S	K	L	D	N	F	L	G	Q	L	D	G	I	L	R	R	Y	S	.	.	R	H	F	A	M	L	Y	F	S	G	L	G	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	R	L	K	E	L	G	L	V	E	A	D	V	E	A	H	P	V	L	A	L	T	R	E	W	E	A	L	E	D	E	E	R	A	K	S	A	R	A	M	E	V	Y	A	A	M	V	E	R	M	D	W	N	I	G	R	V	V	D	Y	L	R	R	Q	G	E	L	D	N	T	F	V	L	F	M	S	D	N	G	A
Template Known Secondary structure								T	S	S		T	T									S	S			G	G	G	S																																				T	T		G	G	G								S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		301	.	.	.	.	.	.	.																																													.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.		330	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Query Sequence		S	V	S	D	S	A	N	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	H	H	Y	G	H	V	Q	G	G	Y	S	V	P	L	I	I	T	A	S	D	.	I	T	S	H	Q	P
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Template Conservation
Template Sequence		E	G	A	L	L	E	A	F	P	K	F	G	P	D	L	L	G	F	L	D	R	H	Y	D	N	S	L	E	N	I	G	R	A	N	S	Y	V	W	Y	G	P	R	W	A	Q	A	A	T	A	P	S	R	L	Y	K	A	F	T	T	Q	G	G	I	R	V	P	A	L	V	R	Y	P	R	L	S	R	Q	G	A	I
Template Known Secondary structure						G	G	G		G	G	G		S	S												S	G	G	G	T	T	S	T	T															T	T	S	S	S		T	T	S	S	S					B								T	T	S	S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
		336	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	S	R	K	I	S	A	R	H	F	A	G	I	F	Q	W	M	T	G	I	C	T	E	N	I	P	P	F	N	P	L	T	D	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	H	A	F	A	T	V	M	D	V	T	P	T	L	L	D	L	A	G	V	R	H	P	G	K	R	W	R	G	R	E	I	A	E
Template Known Secondary structure								G	G	G										T						S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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