Job Description P31455 Confidence 95.58% Date Thu Jan 5 11:47:46 GMT 2012 Rank 159 Aligned Residues 361 % Identity 12% Template c1kv9A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:type ii quinohemoprotein alcohol dehydrogenase; PDBTitle: structure at 1.9 a resolution of a quinohemoprotein alcohol2 dehydrogenase from pseudomonas putida hk5 Resolution 1.90 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	P	V	L	Y	Q	D	R	A	M	K	Q	I	T	F	A	P	R	N	H	L	L	T	N	T	N	T	W	T	P	D	S	Q	W	L	V	F	D	V	R	P	S	G	A	S	F	T	G	E	T	I	E	R	V	N	I	H	T	G	E	V	E	V	I	Y	R	A	S	Q	G	A	H	V	G	V	V	T	V	H	P
Query Conservation
Alig confidence																																												.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	K	E	L	W	R	Y	D	P	E	V	A	K	V	K	A	R	T	S	C	C	D	A	V	N	R	G	V	A	L	W	G	D	K	V	Y	V	G	T	L	D	G	.	.	.	.	.	.	.	R	L	I	A	L	D	A	K	T	G	K	A	I	W	S	Q	Q	T	T	D	P	A	K	P	Y	S	I	T	G	A	P
Template Known Secondary structure														G	G	G	G	G	G		T	T		S									B	T							T	T	S	.	.	.	.	.	.	.							T	T	T										S		T	T	S	S		B			S
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.								.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
																				83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	S	E	K	Y	V	F	I	H	G	P	E	N	P	D	E	T	W	H	Y	D	F	H	H	R	R	G	V	I	V	E	G	G	K	M	S	N	L	D	A	M	D	I	T	A	P	Y	T	P	G	V	L	R	G	G	S	H	V	H	V	F	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	V	V	K	G	K	V	I	I	G	N	G	G	A	E	Y	G	V	R	G	F	V	S	A	Y	D	A	D	T	G	K	L	A	W	R	F	Y	T	V	P	G	D	P	A	L	P	Y	E	H	P	E	L	R	E	A	A	K	T	W	Q	G	D	Q	Y	W	K	L	G	G	G	G	T	V	W	D	S	M	A	Y	D
Template Known Secondary structure					T	T							B		T	T	T			B								T	T	T									S	S				T	T	S			S	S								T	T			S	S													S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.							.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	N	G	E	R	V	S	F	T	Y	N	D	H	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	H	E	L	D	P	A	L	D	L	R	N	V	G	V	A	A	P	.	.	.	.	.	.	F	G	P	V	N	V	Q	K	Q	H	P	R	E	Y	S	G	S	H	W	C	V	L	V
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	E	L	D	L	L	Y	V	G	T	G	N	G	S	P	W	N	R	E	V	R	S	P	G	G	G	D	N	L	Y	L	S	S	I	L	A	I	R	P	D	T	G	K	L	A	W	H	Y	Q	V	T	P	G	D	S	W	D	F	T	A	T	Q	Q	I	T	L	A	E	L	N	I	D	G	K	P	R	K	V	L	M
Template Known Secondary structure		T	T	T	T											S	S						S	T	T					T	T	T	T							T	T	T									S	S	T	T			S						S										T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	K	T	T	P	T	P	Q	P	G	S	D	E	I	N	R	A	Y	E	E	G	W	V	G	N	H	A	L	A	F	I	G	D	T	L	S	P	K	G	E	K	V	P	E	L	F	I	V	E	L	P	Q	D	E	A	G	W	K	A	A	G	D	A	P	L	S	G	T	E	T	T	L	P	A	P	P	R	G	V	V
Query Conservation
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template Sequence		Q	A	P	K	N	G	F	F	Y	V	L	D	R	T	N	G	K	L	I	S	A	E	K	F	G	K	V	T	W	A	E	K	V	D	L	A	T	G	R	P	V	E	A	P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	R	Y	E	K	E	P	I	V	M	W	P	S	P	F	G	.	.
Template Known Secondary structure					T	T	S							T	T	T									S	S				S						T	T	T							T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T		S	S	S					S	S		T	T		.	.
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template SS confidence
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.																																	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	R	R	L	T	F	T	H	H	R	A	Y	P	G	L	V	N	V	P	R	H	W	V	R	C	N	P	Q	G	T	Q	I	A	F	L	M	R	D	D	N	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	Q	L	W	L	I
Query Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	H	N	W	H	S	M	S	F	N	P	G	T	G	L	V	Y	I	P	Y	Q	E	V	P	G	V	Y	R	N	E	G	K	D	F	V	T	R	K	A	F	N	T	A	A	G	F	A	D	A	T	D	V	P	A	A	V	V	S	G	A	L	L	A	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S		S	S						T	T	T	T																	G	G	G					S	S				S	S		G	G	G						G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.		400	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																										.
Query SS confidence																																																																										.
Query Sequence		S	P	Q	G	G	E	P	R	Q	L	T	H	N	K	T	D	I	Q	S	A	F	N	W	H	P	S	G	E	W	L	G	F	V	L	D	N	R	I	A	C	A	H	A	Q	S	G	E	V	E	Y	L	T	E	H	H	A	N	S	P	S	A	D	A	V	V	F	S	P	D	G	Q	W	.	L	A	W	M	E	G	G
Query Conservation																																																																										.
Alig confidence																																																	.																									.
Template Conservation																																																	.
Template Sequence		D	P	V	K	Q	K	A	A	W	K	V	P	Y	P	T	H	W	N	G	G	T	L	S	T	A	G	N	L	V	F	Q	G	T	A	A	G	Q	M	H	A	Y	S	A	D	K	G	E	.	A	L	W	Q	F	E	A	Q	S	G	I	V	A	A	P	M	T	F	E	L	A	G	R	Q	Y	V	A	I	M	A	G	W
Template Known Secondary structure			T	T	T	T									S	S	S									T	T	T							T	T	S							T	T	T			.								S	S				S								T	T
Template Predicted Secondary structure																																																	.
Template SS confidence
		444	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490		.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.