Job Description P06971 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:59:36 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 582 % Identity 18% Template c3fhhA_ PDB info PDB header:membrane protein Chain: A: PDB Molecule:outer membrane heme receptor shua; PDBTitle: crystal structure of the heme/hemoglobin outer membrane2 transporter shua from shigella dysenteriae Resolution 2.60 Å

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		63	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	R	Q	S	A	T	G	T	K	T	D	T	P	I	Q	K	V	P	Q	S	I	S	V	V	T	A	E	E	M	A	L	H	Q	P	K	S	V	K	E	A	L	S	Y	T	P	G	V	S	V	G	T	R	G	A	S	N	T	Y	D	H	L	I	I	R	G	F	A	A	E	G	Q	S	Q	N	N	Y	L	N	G	L
Query Conservation
Alig confidence																																																												.									.	.
Template Conservation																																																												.									.	.
Template Sequence		E	T	M	T	V	T	A	T	G	N	A	R	S	S	F	E	A	P	M	M	V	S	V	I	D	T	S	A	P	E	N	Q	T	A	T	S	A	T	D	L	L	R	H	V	P	G	I	T	L	D	G	T	G	R	T	N	G	Q	.	D	I	N	M	R	G	Y	D	.	.	H	R	G	V	L	V	L	V	D	G	I
Template Known Secondary structure						S	T	T	T	S	S				S	T	T	S	S	S							T	T	S	T	T	T	T	T			S	G	G	G	G	G	T	T	S	T	T					S		S	S	S	T	T		.					T	T	B		.	.	G	G	G						T	T
Template Predicted Secondary structure																																																												.									.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.		60	.	.	.	.	.	.	.			.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
		143	.	.	.	.	.	.	150			.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
Predicted Secondary structure										.	.																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	L	Q	G	N	F	Y	N	.	.	D	A	V	I	D	P	Y	M	L	E	R	A	E	I	M	R	G	P	V	S	V	L	Y	G	K	S	S	P	G	G	L	L	N	M	V	S	K	R	P	T	T	E	P	L	K	E	V	Q	F	K	A	G	T	D	S	L	F	Q	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation										.	.																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	Q	G	T	D	T	G	H	L	N	G	T	F	L	D	P	A	L	I	K	R	V	E	I	V	R	G	P	S	A	L	L	Y	G	S	G	A	L	G	G	V	I	S	Y	D	T	V	D	A	K	D	L	L	Q	E	G	Q	S	S	G	F	R	V	F	G	T	G	G	T	G	D	H	S	L	G	L	G	A	S	A
Template Known Secondary structure								S	S								G	G	G									S				T	T	T		T	T		S	S																	S	S	S											T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	D	F	S	D	S	L	D	D	D	G	V	Y	S	Y	R	L	T	G	L	A	R	S	A	N	A	Q	Q	K	G	S	E	E	Q	R	Y	A	I	A	P	A	F	T	W	R	P	D	D	K	T	N	F	T	F	L	S	Y	F	Q	N	E	P	E	T	G	Y	Y	G	W	L	P	K	E	G	T	V	E	P	L	P
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		F	G	R	T	E	N	L	D	G	I	V	A	W	S	S	R	D	R	G	D	L	R	Q	S	N	G	E	T	A	P	N	D	E	S	I	N	N	M	L	A	K	G	T	W	Q	I	D	S	A	Q	S	L	S	G	L	V	R	Y	Y	N	N	D	A	R	E	P	K	N	P	Q	T	V	E	A	S	E	S	S	N	P
Template Known Secondary structure						S	S															B			S	S	S			B																	S	S	S	S																		S	S	T	T	S	S	S			S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	G	K	R	L	P	T	D	F	N	E	G	A	K	N	N	T	Y	S	R	N	E	K	M	V	G	Y	S	F	D	H	E	F	N	D	T	F	T	V	R	Q	N	L	R	F	A	E	N	K	T	S	Q	N	S	V	Y	G	Y	G	V	C	S	D	P	A	N	A	Y	S	K	Q	C	A	A	L	A	P	A	D	K
Query Conservation
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	V	D	R	S	T	I	Q	R	D	A	Q	L	S	Y	K	L	A	P	Q	G	N	D	W	L	N	A	D	A	K	I	Y	W	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																					T	T		S	S											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.
		371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	H	Y	L	A	R	K	Y	V	V	D	D	E	K	L	Q	N	F	S	V	D	T	Q	L	Q	S	K	F	A	T	G	D	I	D	H	T	L	L	T	G	V	D	F	M	R	M	R	N	D	I	N	A	W	F	G	Y	D	D	S	V	P	L	L	N	L	Y	N	P	V	N	T	D	F	D	F	N	A	K	D	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	V	R	I	N	A	Q	E	Y	R	E	Q	I	T	K	G	A	R	L	E	N	R	S	T	L	F	A	D	S	F	A	S	H	L	L	T	Y	G	G	E	Y	Y	R	Q	E	Q	G	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		451	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	N	S	G	P	Y	R	I	L	N	K	Q	K	Q	T	G	V	Y	V	Q	D	Q	A	Q	W	D	K	V	L	V	T	L	G	G	R	Y	D	W	A	D	Q	E	S	L	N	R	V	A	G	T	T	D	K	R	D	D	K	Q	F	T	W	R	G	G	V	N	Y	L	F	D	N	G	V	T	P	Y	F	S	Y	S
Query Conservation
Alig confidence																																															.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.
Template Sequence		H	T	T	G	F	P	Q	A	K	I	D	F	S	S	G	W	L	Q	D	E	I	T	L	R	D	L	P	I	T	L	L	G	G	T	R	Y	D	S	Y	R	G	S	S	D	G	.	.	.	.	.	Y	K	D	V	D	A	D	K	W	S	S	R	A	G	M	T	I	N	P	T	N	W	L	M	L	F	G	S	Y	A
Template Known Secondary structure					S																				S	S	S	S																	S	S	.	.	.	.	.	S																		S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.
Template SS confidence
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.						.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
		531	.	.	.	.	.	.	.																			.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.						.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.																							.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.																							.	.	.
Query Sequence		E	S	F	E	P	S	S	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	K	D	G	N	I	F	A	P	S	K	G	K	Q	Y	E	V	G	V	K	Y	V	P	.	.	.	.	.	E	D	R	P	I	V	V	T	G	A	V	Y	N	L	T	K	T	N	N	L	M	A	.	.	.
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.																							.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.																							.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	A	F	R	A	P	T	M	G	E	M	Y	N	D	S	K	H	F	S	I	G	R	F	Y	T	N	Y	W	V	P	N	P	N	L	R	P	E	T	N	E	T	Q	E	Y	G	F	G	L	R	F	D	D	L	M	L	S	N	D	A	L	E	F	K	A	S	Y	F	D	T	K	A	K	D	Y	I	S	T	T	V	D
Template Known Secondary structure																S					S	S	S	S									T	T																			S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
		585	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	P	E	G	S	F	F	S	V	E	G	G	E	I	R	A	R	G	V	E	I	E	A	K	A	A	L	S	A	S	V	N	V	V	G	S	Y	T	Y	T	D	A	E	Y	T	T	D	T	T	Y	K	G	N	T	P	A	Q	V	P	K	H	M	A	S	L	W	A	D	Y	T	F	F	D	G	P	L	S	G	L	T
Query Conservation
Alig confidence																												.																					.	.	.	.																							.	.	.
Template Conservation																												.																					.	.	.	.																							.	.	.
Template Sequence		F	A	A	A	T	T	M	S	Y	N	V	P	N	A	K	I	W	G	W	D	V	M	T	K	Y	T	.	T	D	L	F	S	L	D	V	A	Y	N	R	T	R	G	K	D	T	D	T	.	.	.	.	G	E	Y	I	S	S	I	N	P	D	T	V	T	S	T	L	N	I	P	I	A	H	.	.	.	S	G	F	S
Template Known Secondary structure		G	G	G	T																							.		S	S															T	T	T	.	.	.	.			B		S	S															T	T	.	.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure																												.																					.	.	.	.																							.	.	.
Template SS confidence
		492	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.		.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.					.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.				560	.	.	.
		665	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	G	T	G	G	R	Y	T	G	S	S	Y	G	D	P	A	N	S	F	K	V	G	S	Y	T	V	V	D	A	L	V	R	Y	D	L	A	R	V	G	M	A	G	S	N	V	A	L	H	V	N	N	L	F	D	R	E	Y	V	A	S	C	F	N	T	Y	G	C	F	W	G	A	E	R	Q	V	V	A	T	A	T
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.																						.																									.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.																						.																									.	.	.	.	.
Template Sequence		V	G	W	V	G	T	F	A	D	R	S	T	H	.	.	.	I	S	S	K	Q	P	G	Y	G	V	N	D	F	Y	V	S	Y	Q	G	Q	Q	.	A	L	K	G	M	T	T	T	L	V	L	G	N	A	F	D	K	E	Y	W	S	P	Q	G	.	.	.	.	.	I	P	Q	D	G	R	N	G	K	I	F	V	S
Template Known Secondary structure															.	.	.																					G	.	G	G	T	T									S	T	T					B		T	T	S	.	.	.	.	.		B				S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.																						.																									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		564	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.				.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.		.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.						.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.
		745	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	R	F
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Y	Q	W
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		638	.	640