Job Description P06971 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:59:36 GMT 2012 Rank 12 Aligned Residues 640 % Identity 16% Template c3cslB_ PDB info PDB header:membrane protein/heme binding protein Chain: B: PDB Molecule:hasr protein; PDBTitle: structure of the serratia marcescens hemophore receptor hasr in2 complex with its hemophore hasa and heme Resolution 2.70 Å

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Show / Hide Conservation and Alignment quality

		73	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.							.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																											.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	T	P	I	Q	K	V	P	Q	S	I	S	V	V	T	A	E	E	M	A	L	H	Q	P	K	S	V	K	E	A	L	S	Y	T	P	G	V	S	V	G	T	R	G	A	S	N	T	Y	D	H	L	I	I	R	G	F	A	A	E	G	Q	S	Q	N	N	Y	L	N	G	L	K	L	Q	.	.	.	.	.	.	G
Query Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																		.										.															.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.										.
Template Sequence		N	D	W	V	Y	D	E	P	R	S	V	S	V	I	S	R	E	Q	M	D	N	R	P	A	R	H	A	A	D	I	L	E	Q	T	T	G	A	Y	S	S	V	S	Q	Q	D	P	A	L	.	S	V	N	I	R	G	I	Q	D	.	Y	G	R	V	N	M	N	I	D	G	M	R	Q	N	F	Q	K	S	G	H	G
Template Known Secondary structure				G	G	G	G	S	S	S													S			S	S	G	G	G	T	T	T	T	S	T	T							T	T				B	.					T	T	B		S	.	G	G	G						T	T									S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																		.										.
Template SS confidence
		113	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160		.	.	.	.	.	.	.	.	.		170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190
		147	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.							.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	F	Y	N	D	A	V	I	D	P	Y	M	L	E	R	A	E	I	M	R	G	P	V	S	V	L	Y	G	K	S	S	P	G	G	L	L	N	M	V	S	K	R	P	T	T	E	P	L	.	.	.	.	.	.	K	E	V	Q	F	K	A	G	T	D	S	L	F	Q	T	G	F	D	F	S	D	S	L	D	D	D
Query Conservation																																																		.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	R	N	G	T	M	Y	I	D	S	E	L	L	S	G	V	T	I	D	K	G	T	T	G	G	M	G	S	A	G	T	L	G	G	I	A	T	F	N	T	V	S	A	S	D	F	L	A	P	G	K	E	L	G	G	K	L	H	A	S	T	G	D	N	G	T	H	F	I	G	S	G	I	L	A	L	G	N	E	T
Template Known Secondary structure		S		S	S		B				S	T	T									S	S			S	T	T		T	T		S	S										G	G	G	T			S	S													S	T	T														S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		191	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	V	Y	S	Y	R	L	T	G	L	A	R	S	A	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Q	Q	K	G	S	E	E	Q	R	Y	A	I	A	P	A	F	T	W	R	P	D	D	K	T	N	F	T	F	L	S	Y	F	Q	N	E
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	D	I	L	L	A	A	S	E	R	H	L	G	D	Y	W	P	G	N	K	G	D	I	G	N	I	R	I	N	N	D	T	G	N	Y	D	R	Y	A	E	S	I	K	N	N	K	I	P	D	T	H	Y	R	M	H	S	R	L	A	K	V	G	W	N	L	P	A	N	Q	R	L	Q	L	S	Y	L	Q	T	Q	T
Template Known Secondary structure																					B	S				S	S	S	S		S		T	T											T	S			G	G	G																T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	E	T	G	Y	Y	G	W	L	P	K	E	G	T	V	E	P	L	P	N	G	K	R	L	P	T	D	F	N	E	G	A	K	N	N	T	Y	S	R	N	E	K	M	V	G	Y	S	F	D	H	E	F	N	D	T	F	T	V	R	Q	N	L	R	F	A	E	N	K	T	S	Q	N	S	V	Y	G	Y	G	V	C
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	S	P	I	A	G	T	L	T	N	L	G	T	R	P	P	Y	E	L	G	W	K	R	T	G	Y	T	D	V	M	A	R	N	A	A	F	D	Y	S	L	A	P	E	D	V	D	W	L	D	F	Q	A	K	L	Y	Y	V	D	T	Q	D	D	S	D	T	Y	S	T	S	S	L	L	D	N	G	Y	A	T	R	T
Template Known Secondary structure									S				S	S	S	S	S																											T	T		T	T																					S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	D	P	A	N	A	Y	S	K	Q	C	A	A	L	A	P	A	D	K	G	H	Y	L	A	R	K	Y	V	V	D	D	E	K	L	Q	N	F	S	V	D	T	Q	L	Q	S	K	F	A	T	G	D	I	D	H	T	L	L	T	G	V	D	F	M	R	M	R	N	D	I	N	A	W	F	G	Y	D	D	S	V	P
Query Conservation
Alig confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	L	R	T	Y	G	A	Q	A	Q	N	T	S	R	F	S	L	A	P	G	H	D	F	R	A	N	Y	G	L	E	F	Y	Y	D	K	A	T	S	D	S	S	R	Q	G	M	E	G	V	T	P	A	G	N	R	S	V	A	S	L	F	A	N	L	T	Y	D	Y	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																				T	T																					S	S	T	T		T	T	S	S																			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		432	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	N	L	Y	N	P	V	N	T	D	F	D	F	N	A	K	D	P	A	N	S	G	P	Y	R	I	L	N	K	Q	K	Q	T	G	V	Y	V	Q	D	Q	A	Q	W	D	K	V	L	V	T	L	G	G	R	Y	D	W	A	D	Q	E	S	L	N	R	V	A	G	T	T	D	K	R	D	D	K	Q	F	T	W
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	L	T	L	E	G	G	L	R	Y	D	R	Y	R	L	R	G	Q	T	G	L	S	Y	P	D	L	A	K	D	G	Q	R	Y	T	I	D	N	P	C	K	A	L	R	L	T	G	C	S	T	T	T	R	E	D	W	D	V	D	R	D	Q	G	K	L	S	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T																										B	S	S	S		B			T	T	S					S	S	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.
		512	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.															.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.						.	.	.	.	.	.	.	570	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.
Query Sequence		R	G	G	V	N	Y	L	F	D	N	G	V	T	P	Y	F	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	S	E	S	F	E	P	S	S	Q	V	G	K	D	G	N	I	F	A	P	S	K	G	K	Q	Y	E	V	G	V	K	Y	V	P	.	.	.	.	.	E	D	R	P	I	V	V	T	G	A
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	L	A	V	A	V	R	P	G	V	E	W	L	E	L	Y	T	T	Y	G	K	S	W	R	P	P	A	I	T	E	T	L	T	N	G	S	A	H	S	S	S	T	Q	Y	P	N	P	F	L	Q	P	E	R	S	R	A	W	E	V	G	F	N	V	Q	Q	P	D	L	W	F	E	G	D	R	L	V	A	K	V	A
Template Known Secondary structure										S	S	T	T																							B		S	S	T	T							T	T																			S	S	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		566	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.
		573	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.													.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	Y	N	L	T	K	T	N	N	L	M	A	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	S	F	F	S	V	E	G	G	E	I	R	A	R	G	V	E	I	E	A	K	A	A	L	S	A	S	V	N	V	V	G	S	Y	T	Y	T	D	A	E	Y	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.
Template Sequence		Y	F	D	T	K	V	D	N	Y	I	N	L	A	I	D	R	N	K	P	G	L	V	Q	P	S	I	G	N	A	A	Y	V	N	N	L	S	K	T	R	F	R	G	L	E	Y	Q	L	N	Y	D	.	A	G	V	F	Y	A	D	L	T	Y	T	H	M	I	G	K	N	E	F	C	S	N	K	A	W	L	G	G	R
Template Known Secondary structure									S							S				S	B	S					T	T								S	S															.		S	S																				S	S	T	T			B
Template Predicted Secondary structure																																																				.
Template SS confidence
		646	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.		.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.
																											630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	T	T	Y	K	G	N	T	P	A	Q	V	P	K	H	M	A	S	L	W	A	D	Y	T	F	F	D	G	P	L	S	G	L	T	L	G	T	G	G	R	Y	T	G	S	S	Y	G	D	P	A	N	S	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.																							.	.
Template Conservation																																																							.	.	.
Template Sequence		L	R	Y	G	D	G	S	R	R	G	N	F	Y	V	E	P	D	A	A	S	N	D	F	V	T	C	D	G	G	T	Q	F	G	S	A	A	Y	L	P	G	D	R	G	S	V	T	L	G	G	R	A	F	D	.	.	.	R	K	L	D	A	G	V	T	V	R	F	A	P	G	Y	Q	D	S	S	V	P	S	N	Y
Template Known Secondary structure						S			S	S	S												S						T	T				S	G	G	G	S															T	T	.	.	.	T																		S	S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.
Template SS confidence
		725	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.				.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.
					683	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.
Query SS confidence		.	.	.
Query Sequence		.	.	.	F	K	V	G	S	Y	T	V	V	D	A	L	V	R	Y	D	L	A	R	V	G	M	A	G	S	N	V	A	L	H	V	N	N	L	F	D	R	E	Y	V	A	S	C	F	N	T	Y	G	C	F	W	G	A	E	R	Q	V	V	A	T	A	T	F	R	F
Query Conservation		.	.	.
Alig confidence		.	.	.																				.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.
Template Sequence		P	Y	L	A	D	W	P	K	Y	T	L	F	D	L	Y	A	S	Y	K	L	T	D	.	.	.	.	S	L	T	L	R	G	S	V	E	N	L	T	N	R	A	Y	V	V	S	Y	G	E	T	L	A	N	T	L	G	R	G	R	T	V	Q	G	G	V	E	Y	R	F
Template Known Secondary structure		S	S																		S	S	S	.	.	.	.	S								S		T	T		B					T	T			T	T	T							S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.
Template SS confidence
		802	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.					.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.