Job Description P06971 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:59:36 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 665 % Identity 19% Template c1xkhC_ PDB info PDB header:membrane protein Chain: C: PDB Molecule:ferripyoverdine receptor; PDBTitle: pyoverdine outer membrane receptor fpva from pseudomonas aeruginosa2 pao1 bound to pyoverdine Resolution 3.60 Å

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		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	T	A	A	P	A	P	Q	E	S	A	W	G	P	A	A	T	I	A	A	R	Q	S	A	T	G	T	K	T	D	T	P	I	Q	K	V	P	Q	S	I	S	V	V	T	A	E	E	M	A	L	H	Q	P	K	S	V	K	E	A	L	S	Y	T	P	G	V	S	V	G	T	R	G	A	S	N	T	Y	D	H	L
Query Conservation
Alig confidence																																																																										.	.
Template Conservation																																																																										.	.
Template Sequence		T	X	I	T	S	N	Q	L	G	T	I	T	E	D	S	G	S	Y	T	P	G	T	I	A	T	A	T	R	L	V	L	T	P	R	E	T	P	Q	S	I	T	V	V	T	R	Q	N	X	D	D	F	G	L	N	N	I	D	D	V	X	R	H	T	P	G	I	T	V	S	A	Y	D	.	.	T	D	R	N	N	Y
Template Known Secondary structure								S	S				S	S	S	S			S	S						T	T	T	S	S				S	T	T			S													T	T			B	S					T	T	S	T	T								.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.
Template SS confidence
		130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.			.	.	.	.	.	.
		124	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150					.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.
Query Sequence		I	I	R	G	F	A	A	E	G	Q	S	Q	N	N	Y	L	N	G	L	K	L	Q	G	N	F	Y	N	.	.	.	.	D	A	V	I	D	P	Y	M	L	E	R	A	E	I	M	R	G	P	V	S	V	L	Y	G	K	S	S	P	G	G	L	L	N	M	V	S	K	R	P	T	T	E	P	L	K	E	V	Q	F
Query Conservation																													.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.															.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.
Template Sequence		Y	A	R	G	F	S	I	N	N	.	.	.	.	F	Q	Y	D	G	I	P	S	T	A	R	N	V	G	Y	S	A	G	N	T	L	S	D	X	A	I	Y	D	R	V	E	V	L	K	G	A	T	G	L	L	T	G	A	G	S	L	G	A	T	I	N	L	I	R	K	K	P	T	H	E	F	K	G	H	V	E	L
Template Known Secondary structure				T	T						.	.	.	.	B		B	T	T	B							S	T	T			S	T	T			B	S	T	T											G	G	G	T	S		S			S				B									S	S
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.
Template SS confidence
		208	.	210	.	.	.	.	.	.					.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	G	T	D	S	L	F	Q	T	G	F	D	F	S	D	S	L	D	D	D	G	V	Y	S	Y	R	L	T	G	L	A	R	S	A	N	A	Q	Q	K	G	S	E	E	Q	R	Y	A	I	A	P	A	F	T	W	R	P	D	D	K	T	N	F	T	F	L	S	Y	F	Q	N	E	P	E	T	G	Y	Y	G	W
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	A	G	S	W	D	N	Y	R	S	E	L	D	V	S	G	P	L	T	E	S	G	N	V	R	G	R	A	V	A	A	Y	Q	D	K	H	S	F	X	D	H	Y	E	R	K	T	S	V	Y	Y	G	I	L	E	F	D	L	N	P	D	T	X	L	T	V	G	A	D	Y	Q	D	N	D	P	K	G	S	G	W	S
Template Known Secondary structure					T	T	T												S	S	T	T		S															S	S	T	T																	T	T	S																S				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	P	K	E	G	T	V	E	P	L	P	N	G	K	R	L	P	T	D	F	N	E	G	A	K	N	N	T	Y	S	R	N	E	K	M	V	G	Y	S	F	D	H	E	F	N	D	T	F	T	V	R	Q	N	L	R	F	A	E	N	K	T	S	Q	N	S	V	Y	G	Y	G	V	C	S	D	P	A	N	A	Y	S
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	S	F	P	L	F	D	S	Q	G	N	R	N	D	V	S	R	S	F	N	N	G	A	K	W	S	S	W	E	Q	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	T	V	F	A	N	L	E	H	N	F	A	N	G	W	V	G	K	V	Q	L	D	H	K	I	N	G	Y	H
Template Known Secondary structure		S	S	S		S	B		S	S	S	S	B					T	T				B		T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		364	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	Q	C	A	A	L	A	P	A	D	K	G	H	Y	L	A	R	K	Y	V	V	D	D	E	K	L	Q	N	F	S	V	D	T	Q	L	Q	S	K	F	A	T	G	D	I	D	H	T	L	L	T	G	V	D	F	M	R	M	R	N	D	I	N	A	W	F	G	Y	D	D	S	V	P	L	L	N	L	Y	N	P	V
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	P	L	G	A	I	X	G	D	W	P	A	P	D	N	S	A	K	I	V	A	Q	K	Y	T	G	E	T	K	S	N	S	L	D	I	Y	L	T	G	P	F	Q	F	L	G	R	E	H	E	L	V	V	G	T	S	A	S	F	S	H	W	E	G	K	S	Y	W	N	L	R	N	Y	D	N	T	T	D	D	F	I
Template Known Secondary structure									S	S				T	T	T																												S	S	S	S																									S						S		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.
		440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	T	D	F	D	F	N	A	K	D	P	A	N	S	G	P	Y	R	I	L	N	K	Q	K	Q	T	G	V	Y	V	Q	D	Q	A	Q	W	D	K	V	L	V	T	L	G	G	R	Y	D	W	A	D	Q	E	S	L	N	R	V	A	G	T	T	D	K	R	D	D	K	Q	F	T	W	R	G	G	V	N	Y	L	F
Query Conservation
Alig confidence																																																										.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.
Template Sequence		N	W	D	G	D	I	G	K	P	D	W	G	T	P	S	Q	Y	I	D	D	K	T	R	Q	L	G	S	Y	X	T	A	R	F	N	V	T	D	D	L	N	L	F	L	G	G	R	V	V	D	Y	R	V	T	G	L	N	.	.	.	.	.	P	T	I	R	E	S	G	R	F	I	P	Y	V	G	A	V	Y	D	L
Template Known Secondary structure		S												S		S																				S	S	S	S																S	S	S	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		505	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560						.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.			.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590
Predicted Secondary structure																									.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	N	G	V	T	P	Y	F	S	Y	S	E	S	F	E	P	S	S	Q	V	G	K	D	.	.	G	N	I	F	A	P	S	K	G	K	Q	Y	E	V	G	V	K	Y	V	P	E	D	R	P	I	V	V	T	G	A	V	Y	N	L	T	K	T	N	N	L	M	A	D	P	E	G	S	F	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																									.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	D	T	Y	S	V	Y	A	S	Y	T	D	I	F	X	P	Q	D	S	W	Y	R	D	S	S	N	K	L	L	E	P	D	E	G	Q	N	Y	E	I	G	I	K	G	E	Y	L	D	G	R	L	N	T	S	L	A	Y	F	E	I	H	E	E	N	R	A	E	E	D	A	L	Y	N	S	K	P	T	N	P	A	I
Template Known Secondary structure		S	S	S																T	T				S	S	S																				T	T	T	T																				S	S	T	T	S					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.
			591	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	F	S	V	E	G	G	E	I	R	A	R	G	V	E	I	E	A	K	A	A	L	S	A	S	V	N	V	V	G	S	Y	T	Y	T	D	A	E	Y	T	T	D	T	T	Y	K	G	N	T	P	A	Q	V	P	K	H	M	A	S	L	W	A	D	Y	T	F	F	D	G	P	L	S	G	L	T	L	G	T	G	G
Query Conservation		.
Alig confidence		.																																											.	.	.	.																						.
Template Conservation																																													.	.	.	.																						.
Template Sequence		T	Y	A	Y	K	G	I	K	A	K	T	K	G	Y	E	A	E	I	S	G	E	L	A	P	G	W	Q	V	Q	A	G	Y	T	H	K	I	I	R	D	D	S	G	K	.	.	.	.	K	V	S	T	W	E	P	Q	D	Q	L	S	L	Y	T	S	Y	K	F	K	G	.	A	L	D	K	L	T	V	G	G	G	A
Template Known Secondary structure		S																					S	S	S	S															T	T			.	.	.	.	B			T	T	S		S													G	.	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.																						.
Template SS confidence
		660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.					.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.		.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.
		670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.								.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	Y	T	G	S	S	Y	G	D	P	A	N	S	.	.	.	.	.	.	.	F	K	V	G	S	Y	T	V	V	D	A	L	V	R	Y	D	L	A	R	V	G	M	A	G	S	N	V	A	L	H	V	N	N	L	F	D	R	E	Y	V	A	S	C	F	N	T	Y	G	C	F	W	G	A	E	R	Q	V	V	A	T
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.
Template Sequence		R	W	Q	G	K	S	W	Q	X	V	Y	N	N	P	R	S	R	W	E	K	F	S	Q	E	D	Y	W	L	V	D	L	X	A	R	Y	Q	I	T	D	.	.	.	.	K	L	S	A	S	V	N	V	N	N	V	F	D	K	T	Y	Y	T	N	I	G	F	Y	T	S	A	S	Y	G	D	P	R	N	L	X	F	S
Template Known Secondary structure														G	G	G																							S	S	.	.	.	.	S								T	T	T	T								S		S	S	S								S
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.
Template SS confidence
		735	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.					.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810
		743	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	T	F	R	F
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		T	R	W	D	F
Template Known Secondary structure				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		811	.	.	.	.