Job Description P00452 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:56:38 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 515 % Identity 15% Template d1l1la_ SCOP info PFL-like glycyl radical enzymes PFL-like glycyl radical enzymes B12-dependent (class II) ribonucleotide reductase Resolution 1.75

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		115	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	D	N	H	L	L	E	D	Y	T	E	E	E	F	K	Q	M	D	T	F	I	D	H	D	R	D	M	T	F	S	Y	A	A	V	K	Q	L	E	G	K	Y	L	V	Q	N	R	V	T	G	E	I	Y	E	S	A	Q	F	L	Y	I	L	V	A	A	C	L	F	S	N	Y	P	R	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.
Template Sequence		L	S	A	E	F	I	D	R	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	V	K	P	H	W	G	K	L	G	W	V	T	Y	K	R	T	Y	A	R	W	L	P	E	K	G	R	S	.	E	N	W	D	E	T	V	K	R	V	V	E	G	N	I	N	L	D	P	R	L	Q	D	S	P	S	L	E
Template Known Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	T							T	T	T					T	T	T	T			.																T	T		G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.													.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.		.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.
				187	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.						.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.																.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																																				.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																																				.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	E	T	R	L	Q	Y	V	K	R	F	Y	D	A	V	S	T	F	K	I	S	L	P	T	P	I	M	S	G	V	R	T	P	T	R	Q	.	.	.	.	.	F	S	S	C	V	L	I	E	C	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	D	S	I	N	A	T	S	S	A	I
Query Conservation		.	.																																				.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																																				.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	K	Q	S	L	T	E	E	A	E	R	L	Y	K	L	I	Y	G	L	G	A	T	P	S	G	R	N	L	W	I	S	G	T	D	Y	Q	R	R	T	G	D	S	L	N	N	C	W	F	V	A	I	R	P	Q	K	Y	G	D	S	K	I	V	P	S	Y	L	G	K	Q	E	K	A	V	S	M	P	F	S	F	L
Template Known Secondary structure																			T	T	S											T	T	S					T	S	T	T	T	T									S						S		S				T	T	S		S	S				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	K	Y	V	S	Q	R	A	G	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	D	E	L	M	K	G	G	G	V	G	F	S	V	A	R	S	N	I	S	Q	I	P	R	V	D	F	A	I	D	L	Q	L	V	V	D	E	T	S	E	S	Y	D	A	S	V	K	V	G	A	V	G	K	N	E	L	V	Q	D	A	D	S	I	Y	Y	R	L	P	D	T	R	E	G	W	V	L	A	N	A	L
Template Known Secondary structure							T	T													T	T	S															T	T	S	T	T							T	T		B		T	T	T					T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.
																				256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	N	A	G	R	I	R	A	L	G	S	P	I	R	G	G	E	A	F	H	T	G	C	I	P	F	Y	K	H	F	Q	T	A	V	K	S	C	S	Q	G	G	V	R	G	G	A	A	T	L	F	Y	P	M	W	H	L	E	V	E	S	L	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	I	D	L	H	F	A	Q	T	N	P	D	R	K	Q	K	L	I	L	D	L	S	D	I	R	P	Y	G	A	E	I	H	G	F	G	G	T	A	S	G	P	M	P	L	I	S	M	L	L	D	V	N	E	V	L	N	N	K	A	G	G	R	L	T	A	V	D	A	A	D	I	C	N	L	I	G	K	A	V	V
Template Known Secondary structure					T	T	S	G	G	G		T	T										T	T	S			T	T		B		T	T	S	S	S	B				S																T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		234	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	L	K	N	N	R	G	V	E	G	N	R	V	R	H	M	D	Y	G	V	Q	I	N	K	L	M	Y	T	R	L	L	K	G	E	D	I	T	L	F	S	P	S	D	V	P	G	L	Y	D	A	F	F	A	D	Q	E	E	F	E	R	L	Y	T	K	Y	E	K	D	D	S	I	R	K	Q	R	V	K	A	V	E
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	G	N	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	A	L	G	S	N	D	D	Q	D	F	I	S	M	K	Q	D	Q	E	K	L	M	H	H	R	W	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	N	S	V	A	V	D	S	A	F	S
Template Known Secondary structure		T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T							G	G	G								T	G	G	G		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	T
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		314	.	.	.											.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.						.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.
Query Sequence		L	F	S	L	M	M	Q	E	R	A	S	T	G	R	I	Y	I	Q	N	V	D	H	C	N	T	H	S	.	.	.	.	.	P	F	D	P	A	I	A	P	V	R	Q	S	N	L	C	L	E	I	A	L	P	T	K	P	L	N	D	V	N	D	E	N	G	E	I	A	L	C	T	L	S	A	F	N	L	G	A	I
Query Conservation																													.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	Y	Q	P	I	A	A	G	I	R	E	N	G	E	P	G	I	V	N	L	D	L	S	K	N	Y	G	R	I	V	D	G	Y	Q	A	G	I	D	G	D	V	E	G	T	N	P	C	G	E	I	S	L	A	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	P	C	N	L	F	E	V	F	P	L	I	A
Template Known Secondary structure														S														S	S	G	G	G				T	T	T	T	T	T						T	T			S				T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		B
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.													.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		473	.	.	.		.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.
Predicted Secondary structure						.
Query SS confidence						.
Query Sequence		N	N	L	D	.	E	L	E	E	L	A	I	L	A	V	R	A	L	D	A	L	L	D	Y	Q	D	Y	P	I	P	A	A	K	R	G	A	M	G	R	R	T	L	G	I	G	V	I	N	F	A	Y	Y	L	A	K	H	G	K	R	Y	S	D	G	S	A	N	N	L	T	H	K	T	F	E	A	I	Q	Y	Y	L
Query Conservation						.
Alig confidence						.																			.
Template Conservation																									.
Template Sequence		E	E	Q	G	W	D	L	Q	E	V	F	A	L	A	A	R	Y	A	K	R	V	T	F	.	S	P	Y	D	W	E	I	S	R	E	I	I	Q	K	N	R	R	I	G	I	S	M	S	G	I	Q	D	W	L	L	T	R	L	G	N	R	V	V	T	G	F	K	D	D	F	D	P	E	T	H	E	A	I	K	V	P
Template Known Secondary structure				T	T																		T	T	.	S			S																				S										S	S		S										T	T	T
Template Predicted Secondary structure																									.
Template SS confidence
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.		.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
		552	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.		.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630
Predicted Secondary structure																																																																		.
Query SS confidence																																																																		.
Query Sequence		L	K	A	S	N	E	L	A	K	E	Q	G	A	C	P	W	F	N	E	T	T	Y	A	K	G	I	L	P	I	D	T	Y	K	K	D	L	D	T	I	A	N	E	P	L	H	Y	D	W	E	A	L	R	E	S	I	K	T	H	G	L	R	N	S	T	.	L	S	A	L	M	P	S	E	T	S	S	Q	I	S	N
Query Conservation																																																																		.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	Y	D	K	R	A	I	K	M	V	D	Q	L	Y	K	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	A	D	Q	D	Y	S	K	T	L	G	C	N	E	S	I	K	H	T	T	V	K	P	S	G	T	V	A	K	L	A	G
Template Known Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T					S					B											T
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.
		631	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	T	N	G	I	E	P	P	R	G	Y	V	S	I	K	A	S	K	D	G	I	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Q	V	V	P	D	Y	E	H	L	H	D	A	Y	E	L	L	W	E	M	P	G	N	D	G	Y	L	Q	L	V	G	I
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation																																																																								.
Template Sequence		A	S	E	G	M	H	F	H	Y	G	A	Y	L	I	Q	R	I	R	F	Q	D	S	D	P	L	L	P	A	L	K	A	C	G	Y	R	T	E	A	D	I	Y	T	E	N	T	T	C	V	E	F	P	I	K	A	V	G	A	D	N	P	N	F	A	S	A	G	T	V	S	I	.	A	E	Q	F	A	T	Q	A	F
Template Known Secondary structure					T	T			B	S		S										T	T		T								T	T							S	S	S	T	T											T	T	T	T		T	T			B	T	T	T	S			.
Template Predicted Secondary structure																																																																								.
Template SS confidence
		559	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.		.	630	.	.	.	.	.	.	.
		685	.	.		.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.			.	.	730
Predicted Secondary structure					.																																									.	.
Query SS confidence					.																																									.	.
Query Sequence		M	Q	K	.	F	I	D	Q	S	I	S	A	N	T	N	Y	D	P	S	R	F	P	S	G	K	V	P	M	Q	Q	L	L	K	D	L	L	T	A	Y	K	F	G	V	K	.	.	T	L	Y
Query Conservation					.																																									.	.
Alig confidence					.													.	.	.	.	.	.				.															.				.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.				.															.
Template Sequence		L	Q	T	Y	W	S	D	N	A	V	S	C	T	I	T	F	.	.	.	.	.	.	Q	D	S	.	E	G	D	Q	V	E	S	L	L	R	Q	Y	R	F	.	I	T	K	S	T	S	L	L
Template Known Secondary structure						T		S	S		B							.	.	.	.	.	.		G	G	.	G	G	G	G								T	T	T	.	T		S
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.				.															.
Template SS confidence
		638	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.							.	.	.		.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670		.	.	.	.	.	.	.	.